Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BM21 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BM21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BM21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BM21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BM21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BM21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BM21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BM21 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BM21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BM21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BM21 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BM21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BM21 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BM21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BM21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BM21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BM21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BM21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BM21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BM21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BM21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BM21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BM21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BM21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BM21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BM21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BM21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BM21 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BM21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BM21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BM21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BM21 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BM21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BM21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BM21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BM21 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BM21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BM21 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BM21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BM21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BM21 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BM21 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BM21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BM21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BM21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BM21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BM21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BM21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BM21 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BM21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BM21 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BM21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BM21 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BM21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BM21 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BM21 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BM21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BM21 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms