Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms