Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.01■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ARID3CA6NKF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARID3CA6NKF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
ARID3CA6NKF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ARID3CA6NKF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ARID3CA6NKF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
ARID3CA6NKF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.5 ms