Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZNF316A6NFI3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZNF316A6NFI3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF316A6NFI3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ZNF316A6NFI3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms