Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F8A0AVK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2F8A0AVK6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F8A0AVK6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms