Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV5S2A0A599 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV5S2A0A599 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S2A0A599 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV5S2A0A599 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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