Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUJ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUJ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087WUJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms