RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202320.1

Trmt112-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Trmt112-ps1, Length 375 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa29.8■■■□□ 2.36
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 NischQ80TM9 1593 aa29.47■■■□□ 2.31
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Abcc9P70170 1546 aa28.55■■■□□ 2.16
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Abcc8B2RUS7 1588 aa28.41■■■□□ 2.14
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 ScribQ80U72 1612 aa27.35■■□□□ 1.97
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Kdm5dQ62240 1548 aa26.47■■□□□ 1.83
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 NacadQ5SWP3 1504 aa26.44■■□□□ 1.82
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Dcaf1Q80TR8 1506 aa26.16■■□□□ 1.78
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.92■■□□□ 1.74
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.74■■□□□ 1.71
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rhox8Q6VSS7 320 aa25.64■■□□□ 1.7
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 BicraF8VPZ9 1578 aa25.56■■□□□ 1.68
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ccdc180J3QNE4 1664 aa25.38■■□□□ 1.65
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Baz1aO88379 1555 aa25.36■■□□□ 1.65
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Crybg2B7ZCC2 1516 aa25.13■■□□□ 1.61
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.64■■□□□ 1.54
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rtl1Q7M732 1744 aa24.54■■□□□ 1.52
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.52■■□□□ 1.52
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.47■■□□□ 1.51
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.34■■□□□ 1.49
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.29■■□□□ 1.48
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.17■■□□□ 1.46
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.09■■□□□ 1.45
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.03■■□□□ 1.44
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Fam135aQ6NS59 1506 aa24■■□□□ 1.43
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.96■■□□□ 1.43
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.95■■□□□ 1.43
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.95■■□□□ 1.42
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 CftrP26361 1476 aa23.93■■□□□ 1.42
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.84■■□□□ 1.41
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.63■■□□□ 1.37
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.58■■□□□ 1.37
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Trim41Q5NCC3 630 aa23.53■■□□□ 1.36
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Mrc2Q64449 1479 aa23.43■■□□□ 1.34
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.24■■□□□ 1.31
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Lamc3Q9R0B6 1581 aa23.21■■□□□ 1.31
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cux2P70298 1426 aa23.17■■□□□ 1.3
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Top2bQ64511 1612 aa23.17■■□□□ 1.3
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Golga3P55937 1487 aa23.17■■□□□ 1.3
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cngb1E1AZ71 1325 aa23.08■■□□□ 1.29
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Kif21aQ9QXL2 1672 aa23.05■■□□□ 1.28
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 TnnQ80Z71 1560 aa23.03■■□□□ 1.28
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.97■■□□□ 1.27
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cep164Q5DU05 1446 aa22.87■■□□□ 1.25
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Fmn1Q05860 1466 aa22.86■■□□□ 1.25
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.84■■□□□ 1.25
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.84■■□□□ 1.25
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Il27Q8K3I6 234 aa22.8■■□□□ 1.24
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.65■■□□□ 1.22
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.61■■□□□ 1.21
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.59■■□□□ 1.21
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Grin2bQ01097 1482 aa22.52■■□□□ 1.2
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Duox2A2AQ99 1517 aa22.48■■□□□ 1.19
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Chic1Q8CBW7 227 aa22.44■■□□□ 1.18
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Ift140E9PY46 1464 aa22.4■■□□□ 1.18
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Samd9lQ69Z37 1561 aa22.38■■□□□ 1.17
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rusc2Q80U22 1514 aa22.32■■□□□ 1.16
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Efcab5A0JP43 1406 aa22.3■■□□□ 1.16
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.29■■□□□ 1.16
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 NrkQ9R0G8 1455 aa22.28■■□□□ 1.16
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.26■■□□□ 1.15
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Shroom4Q1W617 1475 aa22.23■■□□□ 1.15
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 PtprkP35822 1457 aa22.21■■□□□ 1.15
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.18■■□□□ 1.14
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.15■■□□□ 1.14
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.11■■□□□ 1.13
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Grin2aP35436 1464 aa22.1■■□□□ 1.13
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.09■■□□□ 1.13
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 SynmQ70IV5 1561 aa22.08■■□□□ 1.13
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 HrcG5E8J6 738 aa22.08■■□□□ 1.13
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Pla2r1Q62028 1487 aa22.02■■□□□ 1.12
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Zeb1Q64318 1117 aa22■■□□□ 1.11
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Gpatch8A2A6A1 1505 aa21.99■■□□□ 1.11
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Npm2Q80W85 207 aa21.98■■□□□ 1.11
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Gab3Q8BSM5 595 aa21.95■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Dnajc5P60904 198 aa21.93■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.92■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.9■■□□□ 1.1
Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms