RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172334.7

Smagp-202, Transcript of Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Smagp, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smagp-202ENSMUST00000172334 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54.32■■■■■ 6.29
Smagp-202ENSMUST00000172334 NischQ80TM9 1593 aa53.25■■■■■ 6.12
Smagp-202ENSMUST00000172334 Abcc8B2RUS7 1588 aa51.68■■■■■ 5.86
Smagp-202ENSMUST00000172334 Abcc9P70170 1546 aa51.45■■■■■ 5.83
Smagp-202ENSMUST00000172334 ScribQ80U72 1612 aa50.36■■■■■ 5.65
Smagp-202ENSMUST00000172334 NacadQ5SWP3 1504 aa48.62■■■■■ 5.37
Smagp-202ENSMUST00000172334 Kdm5dQ62240 1548 aa48.5■■■■■ 5.35
Smagp-202ENSMUST00000172334 Sycp2Q9CUU3 1500 aa47.7■■■■■ 5.23
Smagp-202ENSMUST00000172334 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47.38■■■■■ 5.18
Smagp-202ENSMUST00000172334 BicraF8VPZ9 1578 aa47.2■■■■■ 5.15
Smagp-202ENSMUST00000172334 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47■■■■■ 5.11
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46.39■■■■■ 5.02
Smagp-202ENSMUST00000172334 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
Smagp-202ENSMUST00000172334 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
Smagp-202ENSMUST00000172334 Baz1aO88379 1555 aa45.64■■■■■ 4.9
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45.53■■■■■ 4.88
Smagp-202ENSMUST00000172334 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45.5■■■■■ 4.87
Smagp-202ENSMUST00000172334 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rhox8Q6VSS7 320 aa45.26■■■■■ 4.84
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45.23■■■■■ 4.83
Smagp-202ENSMUST00000172334 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.09■■■■■ 4.81
Smagp-202ENSMUST00000172334 Smarca2Q6DIC0 1577 aa44.85■■■■■ 4.77
Smagp-202ENSMUST00000172334 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
Smagp-202ENSMUST00000172334 Fam135aQ6NS59 1506 aa44.75■■■■■ 4.76
Smagp-202ENSMUST00000172334 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa44.67■■■■■ 4.74
Smagp-202ENSMUST00000172334 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44.4■■■■■ 4.7
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44.39■■■■■ 4.7
Smagp-202ENSMUST00000172334 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44.31■■■■■ 4.68
Smagp-202ENSMUST00000172334 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
Smagp-202ENSMUST00000172334 Baz1bQ9Z277 1479 aa44.17■■■■■ 4.66
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ubl4bQ9CQ84 188 aa43.87■■■■■ 4.61
Smagp-202ENSMUST00000172334 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43.79■■■■■ 4.6
Smagp-202ENSMUST00000172334 Mrc2Q64449 1479 aa43.72■■■■■ 4.59
Smagp-202ENSMUST00000172334 Dnajc5P60904 198 aa43.33■■■■■ 4.53
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43.28■■■■■ 4.52
Smagp-202ENSMUST00000172334 CftrP26361 1476 aa43.22■■■■■ 4.51
Smagp-202ENSMUST00000172334 Trim41Q5NCC3 630 aa43.17■■■■■ 4.5
Smagp-202ENSMUST00000172334 Synj1Q8CHC4 1574 aa43.11■■■■■ 4.49
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rtl1Q7M732 1744 aa42.97■■■■■ 4.47
Smagp-202ENSMUST00000172334 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
Smagp-202ENSMUST00000172334 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa42.89■■■■■ 4.46
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cux2P70298 1426 aa42.63■■■■■ 4.41
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
Smagp-202ENSMUST00000172334 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42.56■■■■■ 4.4
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42.48■■■■■ 4.39
Smagp-202ENSMUST00000172334 Kif15Q6P9L6 1387 aa42.48■■■■■ 4.39
Smagp-202ENSMUST00000172334 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
Smagp-202ENSMUST00000172334 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
Smagp-202ENSMUST00000172334 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42.18■■■■■ 4.34
Smagp-202ENSMUST00000172334 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
Smagp-202ENSMUST00000172334 Shroom2A2ALU4 1481 aa42.11■■■■■ 4.33
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cep164Q5DU05 1446 aa41.94■■■■■ 4.3
Smagp-202ENSMUST00000172334 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
Smagp-202ENSMUST00000172334 Col17a1Q07563 1470 aa41.67■■■■■ 4.26
Smagp-202ENSMUST00000172334 Plb1Q3TTY0 1478 aa41.67■■■■■ 4.26
Smagp-202ENSMUST00000172334 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ccdc18Q640L5 1455 aa41.58■■■■■ 4.25
Smagp-202ENSMUST00000172334 Top2bQ64511 1612 aa41.57■■■■■ 4.25
Smagp-202ENSMUST00000172334 Il27Q8K3I6 234 aa41.54■■■■■ 4.24
Smagp-202ENSMUST00000172334 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
Smagp-202ENSMUST00000172334 Crocc2F6XLV1 1638 aa41.52■■■■■ 4.24
Smagp-202ENSMUST00000172334 TnnQ80Z71 1560 aa41.48■■■■■ 4.23
Smagp-202ENSMUST00000172334 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
Smagp-202ENSMUST00000172334 Camsap1A2AHC3 1581 aa41.36■■■■■ 4.21
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rusc2Q80U22 1514 aa41.34■■■■■ 4.21
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ift140E9PY46 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
Smagp-202ENSMUST00000172334 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
Smagp-202ENSMUST00000172334 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
Smagp-202ENSMUST00000172334 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
Smagp-202ENSMUST00000172334 Golga3P55937 1487 aa41.1■■■■■ 4.17
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cngb1E1AZ71 1325 aa41■■■■■ 4.15
Smagp-202ENSMUST00000172334 Duox2A2AQ99 1517 aa40.94■■■■■ 4.14
Smagp-202ENSMUST00000172334 Disp1Q3TDN0 1521 aa40.83■■■■■ 4.13
Smagp-202ENSMUST00000172334 Fmn1Q05860 1466 aa40.83■■■■■ 4.13
Smagp-202ENSMUST00000172334 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40.75■■■■■ 4.11
Smagp-202ENSMUST00000172334 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
Smagp-202ENSMUST00000172334 Grin2bQ01097 1482 aa40.69■■■■■ 4.1
Smagp-202ENSMUST00000172334 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa40.67■■■■■ 4.1
Smagp-202ENSMUST00000172334 Samd9lQ69Z37 1561 aa40.66■■■■■ 4.1
Smagp-202ENSMUST00000172334 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40.56■■■■■ 4.08
Smagp-202ENSMUST00000172334 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa40.53■■■■■ 4.08
Smagp-202ENSMUST00000172334 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa40.45■■■■■ 4.07
Smagp-202ENSMUST00000172334 PtprkP35822 1457 aa40.44■■■■■ 4.06
Smagp-202ENSMUST00000172334 Cep170Q6A065 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
Smagp-202ENSMUST00000172334 Efcab5A0JP43 1406 aa40.42■■■■■ 4.06
Smagp-202ENSMUST00000172334 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa40.42■■■■■ 4.06
Smagp-202ENSMUST00000172334 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
Smagp-202ENSMUST00000172334 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40.37■■■■■ 4.05
Smagp-202ENSMUST00000172334 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40.36■■■■■ 4.05
Smagp-202ENSMUST00000172334 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40.35■■■■■ 4.05
Smagp-202ENSMUST00000172334 Grin2aP35436 1464 aa40.34■■■■■ 4.05
Smagp-202ENSMUST00000172334 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40.28■■■■■ 4.04
Smagp-202ENSMUST00000172334 Gm156Q58A37 223 aa40.25■■■■■ 4.03
Smagp-202ENSMUST00000172334 PtprtQ99M80 1454 aa40.2■■■■■ 4.03
Smagp-202ENSMUST00000172334 AknaQ80VW7 1404 aa40.13■■■■■ 4.01
Smagp-202ENSMUST00000172334 Abcc1O35379 1528 aa40.09■■■■■ 4.01
Smagp-202ENSMUST00000172334 NrkQ9R0G8 1455 aa40■■■■□ 3.99
Smagp-202ENSMUST00000172334 Gpatch8A2A6A1 1505 aa39.98■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.3 ms