RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000102776.4

Rnf130-202, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnf130, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Kdm5dQ62240 1548 aa53.22■■■■■ 6.11
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa45.24■■■■■ 4.83
Rnf130-202ENSMUST00000102776 Grin2bQ01097 1482 aa45.2■■■■■ 4.83
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Ift140E9PY46 1464 aa45.05■■■■■ 4.8
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Rusc2Q80U22 1514 aa44.9■■■■■ 4.78
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Shroom4Q1W617 1475 aa44.56■■■■■ 4.72
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Gpatch8A2A6A1 1505 aa44.28■■■■■ 4.68
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Rnf130-202ENSMUST00000102776 Pla2r1Q62028 1487 aa44.2■■■■■ 4.67
Rnf130-202ENSMUST00000102776 HrcG5E8J6 738 aa44.12■■■■■ 4.65
Rnf130-202ENSMUST00000102776 Col17a1Q07563 1470 aa44.11■■■■■ 4.65
Rnf130-202ENSMUST00000102776 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa43.99■■■■■ 4.63
Rnf130-202ENSMUST00000102776 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
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