RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031341.10

Cdk2ap1-201, Transcript of Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cdk2ap1, Length 1,315 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa58.66■■■■■ 6.98
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 NischQ80TM9 1593 aa57.58■■■■■ 6.81
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Abcc8B2RUS7 1588 aa55.88■■■■■ 6.54
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Abcc9P70170 1546 aa55.64■■■■■ 6.5
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 ScribQ80U72 1612 aa54.31■■■■■ 6.28
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 NacadQ5SWP3 1504 aa52.53■■■■■ 6
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Kdm5dQ62240 1548 aa52.35■■■■■ 5.97
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Sycp2Q9CUU3 1500 aa51.51■■■■■ 5.84
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51.25■■■■■ 5.79
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 BicraF8VPZ9 1578 aa50.92■■■■■ 5.74
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa50.58■■■■■ 5.69
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50.13■■■■■ 5.62
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP49.68■■■■■ 5.54
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP49.51■■■■■ 5.52
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Baz1aO88379 1555 aa49.37■■■■■ 5.49
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Crybg2B7ZCC2 1516 aa49.3■■■■■ 5.48
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ccdc180J3QNE4 1664 aa49.26■■■■■ 5.48
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rhox8Q6VSS7 320 aa49.06■■■■■ 5.44
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP49.05■■■■■ 5.44
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48.68■■■■■ 5.38
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ercc6F8VPZ5 1481 aa48.6■■■■■ 5.37
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Smarca2Q6DIC0 1577 aa48.41■■■■■ 5.34
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Fam135aQ6NS59 1506 aa48.25■■■■■ 5.31
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa48.2■■■■■ 5.31
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa47.99■■■■■ 5.27
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Wdr62Q3U3T8 1523 aa47.9■■■■■ 5.26
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Frmpd1A2AKB4 1549 aa47.84■■■■■ 5.25
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Baz1bQ9Z277 1479 aa47.71■■■■■ 5.23
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ubl4bQ9CQ84 188 aa47.35■■■■■ 5.17
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Unc13aQ4KUS2 1712 aa47.14■■■■■ 5.14
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Mrc2Q64449 1479 aa47.13■■■■■ 5.14
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 CftrP26361 1476 aa46.79■■■■■ 5.08
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa46.76■■■■■ 5.08
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Synj1Q8CHC4 1574 aa46.6■■■■■ 5.05
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Dnajc5P60904 198 aa46.52■■■■■ 5.04
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rtl1Q7M732 1744 aa46.47■■■■■ 5.03
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Trim41Q5NCC3 630 aa46.33■■■■■ 5.01
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46.14■■■■■ 4.98
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cux2P70298 1426 aa46.04■■■■■ 4.96
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa46.03■■■■■ 4.96
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Kif15Q6P9L6 1387 aa45.9■■■■■ 4.94
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45.83■■■■■ 4.93
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45.59■■■■■ 4.89
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Shroom2A2ALU4 1481 aa45.36■■■■■ 4.85
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cep164Q5DU05 1446 aa45.31■■■■■ 4.84
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Plb1Q3TTY0 1478 aa45■■■■■ 4.79
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ccdc18Q640L5 1455 aa44.94■■■■■ 4.78
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Il27Q8K3I6 234 aa44.86■■■■■ 4.77
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 TnnQ80Z71 1560 aa44.85■■■■■ 4.77
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Col17a1Q07563 1470 aa44.85■■■■■ 4.77
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Crocc2F6XLV1 1638 aa44.79■■■■■ 4.76
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Top2bQ64511 1612 aa44.7■■■■■ 4.75
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Camsap1A2AHC3 1581 aa44.69■■■■■ 4.74
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ift140E9PY46 1464 aa44.58■■■■■ 4.73
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Golga3P55937 1487 aa44.57■■■■■ 4.73
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rusc2Q80U22 1514 aa44.55■■■■■ 4.72
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cngb1E1AZ71 1325 aa44.39■■■■■ 4.7
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Duox2A2AQ99 1517 aa44.26■■■■■ 4.68
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Fmn1Q05860 1466 aa44.22■■■■■ 4.67
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Disp1Q3TDN0 1521 aa44.14■■■■■ 4.66
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Grin2bQ01097 1482 aa44.02■■■■■ 4.64
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa43.96■■■■■ 4.63
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Setd1bQ8CFT2 1985 aa43.94■■■■■ 4.62
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Samd9lQ69Z37 1561 aa43.9■■■■■ 4.62
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Efcab5A0JP43 1406 aa43.79■■■■■ 4.6
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43.67■■■■■ 4.58
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Rad54l2Q99NG0 1466 aa43.62■■■■■ 4.57
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43.61■■■■■ 4.57
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 PtprkP35822 1457 aa43.59■■■■■ 4.57
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Grin2aP35436 1464 aa43.58■■■■■ 4.57
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa43.56■■■■■ 4.56
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Magi3Q9EQJ9 1476 aa43.53■■■■■ 4.56
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Cep170Q6A065 1588 aa43.52■■■■■ 4.56
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa43.49■■■■■ 4.55
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa43.49■■■■■ 4.55
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa43.44■■■■■ 4.54
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Gm156Q58A37 223 aa43.43■■■■■ 4.54
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 NrkQ9R0G8 1455 aa43.35■■■■■ 4.53
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 PtprtQ99M80 1454 aa43.32■■■■■ 4.53
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 AknaQ80VW7 1404 aa43.27■■■■■ 4.52
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Abcc1O35379 1528 aa43.23■■■■■ 4.51
Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 Gpatch8A2A6A1 1505 aa43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.4 ms