RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	TMA16	Q08687	178 aa		5.44	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	APL4	Q12028	832 aa		5.44	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	PSF3	Q12146	194 aa		5.44	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	TIP41	Q12199	356 aa		5.44	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CDC6	P09119	513 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	ALG1	P16661	449 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MSH3	P25336	1018 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MGM1	P32266	881 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	ANP1	P32629	500 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	PCH2	P38126	564 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	BUD16	P39988	312 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	NMA111	P53920	997 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MRS2	Q01926	470 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RNT1	Q02555	471 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RBA50	Q04418	439 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	BUG1	Q12191	341 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MAK31	P23059	88 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	HIR1	P32479	840 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MYO3	P36006	1272 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CTM1	P38818	585 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	ICP55	P40051	511 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RAD26	P40352	1085 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	DAK2	P43550	591 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	INM2	Q05533	292 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	TOS4	Q06266	489 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	HMI1	Q12039	706 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MCM16	Q12262	181 aa		5.42	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RPO26	P20435	155 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	SPO11	P23179	398 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MSH1	P25846	959 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	DEP1	P31385	405 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	NFU1	P32860	256 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	PCI8	P40512	444 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	YIR042C	P40586	236 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	UBX2	Q04228	584 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	SML1	Q04964	104 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	AFT2	Q08957	416 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	ATG9	Q12142	997 aa		5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
UBX7	YBR273C	RAS1	P01119	309 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CLB1	P24868	471 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	BYE1	P36106	594 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CCC2	P38995	1004 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YGL138C	P53122	345 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	ERG5	P54781	538 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	DPL1	Q05567	589 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VAC14	Q06708	880 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	BDF2	Q07442	638 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CTI6	Q08923	506 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	OSH2	Q12451	1283 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PTC5	Q12511	572 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		5.4	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SEC65	P29478	273 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SRB4	P32569	687 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	CNS1	P33313	385 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YET1	P35723	206 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SLI15	P38283	698 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RTT107	P38850	1070 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	SPT8	P38915	602 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VPS41	P38959	992 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PES4	P39684	611 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	VTC2	P43585	828 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YGR237C	P50089	785 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	PIP2	P52960	996 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	ATG23	Q06671	453 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	RAD61	Q99359	647 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	FOB1	O13329	566 aa		5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
UBX7	YBR273C	MTF2	P10849	440 aa		5.38	□□□□□ -1.55

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