Protein–RNA interactions for Protein: P53122

YGL138C, Uncharacterized protein YGL138C, yeastyeast

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGL138CP53122 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.27■■□□□ 1.32
YGL138CP53122 NSR1YGR159C 1245 nt23.03■■□□□ 1.28
YGL138CP53122 NOP1YDL014W 984 nt22.55■■□□□ 1.2
YGL138CP53122 YKL036CYKL036C 393 nt20.86■□□□□ 0.93
YGL138CP53122 MDJ1YFL016C 1536 nt20.53■□□□□ 0.88
YGL138CP53122 Q0297Q0297 156 nt19.74■□□□□ 0.75
YGL138CP53122 SRX1YKL086W 384 nt19.72■□□□□ 0.75
YGL138CP53122 YJL027CYJL027C 417 nt19.5■□□□□ 0.71
YGL138CP53122 SCS3YGL126W 1143 nt19.01■□□□□ 0.63
YGL138CP53122 YCR051WYCR051W 669 nt18.77■□□□□ 0.6
YGL138CP53122 DBP2YNL112W 1641 nt18.13■□□□□ 0.49
YGL138CP53122 YOL085CYOL085C 342 nt18.08■□□□□ 0.48
YGL138CP53122 PKP1YIL042C 1185 nt17.88■□□□□ 0.45
YGL138CP53122 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.83■□□□□ 0.44
YGL138CP53122 RPP1BYDL130W 321 nt17.74■□□□□ 0.43
YGL138CP53122 CCC1YLR220W 969 nt17.73■□□□□ 0.43
YGL138CP53122 YBR190WYBR190W 312 nt17.42■□□□□ 0.38
YGL138CP53122 RTC3YHR087W 336 nt17.1■□□□□ 0.33
YGL138CP53122 RVS167YDR388W 1449 nt17.02■□□□□ 0.31
YGL138CP53122 ATS1YAL020C 1002 nt17■□□□□ 0.31
YGL138CP53122 SCJ1YMR214W 1134 nt17■□□□□ 0.31
YGL138CP53122 PET122YER153C 765 nt16.99■□□□□ 0.31
YGL138CP53122 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.89■□□□□ 0.29
YGL138CP53122 SCR1SCR1 522 nt16.76■□□□□ 0.27
YGL138CP53122 RRN5YLR141W 1092 nt16.5■□□□□ 0.23
YGL138CP53122 SHR5YOL110W 714 nt16.44■□□□□ 0.22
YGL138CP53122 YDJ1YNL064C 1230 nt16.29■□□□□ 0.2
YGL138CP53122 RSB1YOR049C 1065 nt16.18■□□□□ 0.18
YGL138CP53122 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.16■□□□□ 0.18
YGL138CP53122 DEP1YAL013W 1218 nt16.06■□□□□ 0.16
YGL138CP53122 GAR1YHR089C 618 nt16.01■□□□□ 0.15
YGL138CP53122 URN1YPR152C 1398 nt16■□□□□ 0.15
YGL138CP53122 PUT4YOR348C 1884 nt15.82■□□□□ 0.12
YGL138CP53122 PST2YDR032C 597 nt15.73■□□□□ 0.11
YGL138CP53122 OPI9YLR338W 858 nt15.73■□□□□ 0.11
YGL138CP53122 YNL208WYNL208W 600 nt15.72■□□□□ 0.11
YGL138CP53122 RPN10YHR200W 807 nt15.71■□□□□ 0.11
YGL138CP53122 SAH1YER043C 1350 nt15.68■□□□□ 0.1
YGL138CP53122 ARE1YCR048W 1833 nt15.57■□□□□ 0.08
YGL138CP53122 TIR1YER011W 765 nt15.44■□□□□ 0.06
YGL138CP53122 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.38■□□□□ 0.05
YGL138CP53122 POA1YBR022W 534 nt15.38■□□□□ 0.05
YGL138CP53122 SSA1YAL005C 1929 nt15.27■□□□□ 0.04
YGL138CP53122 PUN1YLR414C 792 nt15.26■□□□□ 0.03
YGL138CP53122 YJR018WYJR018W 363 nt15.25■□□□□ 0.03
YGL138CP53122 SHU1YHL006C 453 nt15.13■□□□□ 0.01
YGL138CP53122 YKL097CYKL097C 411 nt15.13■□□□□ 0.01
YGL138CP53122 PTC2YER089C 1395 nt15.12■□□□□ 0.01
YGL138CP53122 SRB2YHR041C 633 nt15.07■□□□□ 0
YGL138CP53122 BUD23YCR047C 828 nt15.06■□□□□ 0
YGL138CP53122 YJR120WYJR120W 351 nt15.05■□□□□ -0
YGL138CP53122 BSC6YOL137W 1494 nt15.02■□□□□ -0
YGL138CP53122 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.94□□□□□ -0.02
YGL138CP53122 RPP2BYDR382W 333 nt14.93□□□□□ -0.02
YGL138CP53122 NAB2YGL122C 1578 nt14.88□□□□□ -0.03
YGL138CP53122 WWM1YFL010C 636 nt14.8□□□□□ -0.04
YGL138CP53122 FPR4YLR449W 1179 nt14.74□□□□□ -0.05
YGL138CP53122 FIS1YIL065C 468 nt14.7□□□□□ -0.06
YGL138CP53122 DAL1YIR027C 1383 nt14.7□□□□□ -0.06
YGL138CP53122 INM2YDR287W 879 nt14.67□□□□□ -0.06
YGL138CP53122 YGR021WYGR021W 873 nt14.64□□□□□ -0.07
YGL138CP53122 BDH2YAL061W 1254 nt14.64□□□□□ -0.07
YGL138CP53122 SSA3YBL075C 1950 nt14.64□□□□□ -0.07
YGL138CP53122 MNP1YGL068W 585 nt14.63□□□□□ -0.07
YGL138CP53122 HOM6YJR139C 1080 nt14.63□□□□□ -0.07
YGL138CP53122 PHO4YFR034C 939 nt14.58□□□□□ -0.08
YGL138CP53122 YBL100CYBL100C 315 nt14.58□□□□□ -0.08
YGL138CP53122 YOR139CYOR139C 393 nt14.54□□□□□ -0.08
YGL138CP53122 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.49□□□□□ -0.09
YGL138CP53122 RKM5YLR137W 1104 nt14.42□□□□□ -0.1
YGL138CP53122 LSM3YLR438C-A 270 nt14.41□□□□□ -0.1
YGL138CP53122 FUN26YAL022C 1554 nt14.4□□□□□ -0.1
YGL138CP53122 NPL3YDR432W 1245 nt14.4□□□□□ -0.1
YGL138CP53122 TRM9YML014W 840 nt14.37□□□□□ -0.11
YGL138CP53122 YOL037CYOL037C 354 nt14.29□□□□□ -0.12
YGL138CP53122 YPS1YLR120C 1710 nt14.27□□□□□ -0.13
YGL138CP53122 SPT5YML010W 3192 nt14.22□□□□□ -0.13
YGL138CP53122 CCT6YDR188W 1641 nt14.2□□□□□ -0.14
YGL138CP53122 ALF1YNL148C 765 nt14.19□□□□□ -0.14
YGL138CP53122 YDR095CYDR095C 411 nt14.18□□□□□ -0.14
YGL138CP53122 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.14□□□□□ -0.15
YGL138CP53122 MEP2YNL142W 1500 nt14.07□□□□□ -0.16
YGL138CP53122 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.06□□□□□ -0.16
YGL138CP53122 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.06□□□□□ -0.16
YGL138CP53122 YLR281CYLR281C 468 nt13.98□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 WHI5YOR083W 888 nt13.96□□□□□ -0.17
YGL138CP53122 SIS1YNL007C 1059 nt13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms