RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	EAF1	Q06337	982 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	CIT1	P00890	479 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RGP1	P16664	663 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	AFT1	P22149	690 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	NPR1	P22211	790 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	MSH3	P25336	1018 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	MRP8	P35719	219 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	VBA5	P36172	582 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YEN1	P40028	759 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	IRR1	P40541	1150 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	HUL4	P40985	892 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YJL181W	P46987	611 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	PPT1	P53043	513 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YGL140C	P53120	1219 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YGL081W	P53156	320 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YNR040W	P53736	256 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	DNM1	P54861	757 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ESC2	Q06340	456 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	HDA2	Q06629	674 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ADR1	P07248	1323 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	CAN1	P04817	590 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	CDC4	P07834	779 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	AGP1	P25376	633 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SFP1	P32432	683 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	LYP1	P32487	611 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RER2	P35196	286 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SEA4	P38164	1038 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SHU2	P38957	223 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SKP1	P52286	194 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ERP6	P53198	216 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	LSC2	P53312	427 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	FMP25	Q08023	583 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YKL077W	P36081	392 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	MRPL16	P38064	232 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	GRX7	P38068	203 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RIM11	P38615	370 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	UBP12	P39538	1254 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ALR2	P43553	858 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SAP155	P43612	1002 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YJR098C	P47139	656 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	GNP1	P48813	663 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ROD1	Q02805	837 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SHE9	Q04172	456 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RSC2	Q06488	889 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	REC8	Q12188	680 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RAS1	P01119	309 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	FUS1	P11710	512 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TAF13	P11747	167 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	INO1	P11986	533 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	BCK2	P33306	851 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PBY1	P38254	753 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	ATG14	P38270	344 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UBP15	P50101	1230 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SIW14	P53965	281 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	MCM7	P38132	845 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HXT13	P39924	564 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	NUP85	P46673	744 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YGL176C	P46945	554 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	VTC4	P47075	721 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HLJ1	P48353	224 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HXT17	P53631	564 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HXT15	P54854	567 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	EST2	Q06163	884 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	NTG2	Q08214	380 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	GLO4	Q12320	285 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	IDI1	P15496	288 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
YMR31	YFR049W	XDJ1	P39102	459 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	MBP1	P39678	833 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	GEM1	P39722	662 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PFD1	P46988	109 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YJR124C	P47159	448 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86

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