Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 NSR1YGR159C 1245 nt16.21■□□□□ 0.19
TY1A-DR3Q12441 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.59■□□□□ 0.09
TY1A-DR3Q12441 MDJ1YFL016C 1536 nt15.22■□□□□ 0.03
TY1A-DR3Q12441 NOP1YDL014W 984 nt14.75□□□□□ -0.05
TY1A-DR3Q12441 YJL027CYJL027C 417 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-DR3Q12441 SSA3YBL075C 1950 nt13.83□□□□□ -0.19
TY1A-DR3Q12441 MOT3YMR070W 1473 nt13.46□□□□□ -0.25
TY1A-DR3Q12441 Q0182Q0182 405 nt13.45□□□□□ -0.26
TY1A-DR3Q12441 DBP2YNL112W 1641 nt13.23□□□□□ -0.29
TY1A-DR3Q12441 YBR190WYBR190W 312 nt13.12□□□□□ -0.31
TY1A-DR3Q12441 SRX1YKL086W 384 nt12.99□□□□□ -0.33
TY1A-DR3Q12441 YKL036CYKL036C 393 nt12.94□□□□□ -0.34
TY1A-DR3Q12441 YGR139WYGR139W 339 nt12.93□□□□□ -0.34
TY1A-DR3Q12441 Q0297Q0297 156 nt12.77□□□□□ -0.37
TY1A-DR3Q12441 RTC3YHR087W 336 nt12.73□□□□□ -0.37
TY1A-DR3Q12441 PUT4YOR348C 1884 nt12.63□□□□□ -0.39
TY1A-DR3Q12441 NME1NME1 340 nt12.4□□□□□ -0.42
TY1A-DR3Q12441 SPT5YML010W 3192 nt12.26□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 YCR051WYCR051W 669 nt12.22□□□□□ -0.45
TY1A-DR3Q12441 ARE1YCR048W 1833 nt12.16□□□□□ -0.46
TY1A-DR3Q12441 POA1YBR022W 534 nt12.14□□□□□ -0.47
TY1A-DR3Q12441 SSA4YER103W 1929 nt12.1□□□□□ -0.47
TY1A-DR3Q12441 CCC1YLR220W 969 nt12.09□□□□□ -0.47
TY1A-DR3Q12441 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.48
TY1A-DR3Q12441 RVS167YDR388W 1449 nt11.98□□□□□ -0.49
TY1A-DR3Q12441 SCJ1YMR214W 1134 nt11.98□□□□□ -0.49
TY1A-DR3Q12441 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.93□□□□□ -0.5
TY1A-DR3Q12441 SAH1YER043C 1350 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-DR3Q12441 BDF1YLR399C 2061 nt11.79□□□□□ -0.52
TY1A-DR3Q12441 CSM2YIL132C 642 nt11.78□□□□□ -0.52
TY1A-DR3Q12441 URN1YPR152C 1398 nt11.7□□□□□ -0.54
TY1A-DR3Q12441 OPI9YLR338W 858 nt11.69□□□□□ -0.54
TY1A-DR3Q12441 TAT1YBR069C 1860 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-DR3Q12441 BUD23YCR047C 828 nt11.55□□□□□ -0.56
TY1A-DR3Q12441 PAU21YOR394W 495 nt11.54□□□□□ -0.56
TY1A-DR3Q12441 PAU22YPL282C 495 nt11.54□□□□□ -0.56
TY1A-DR3Q12441 DEP1YAL013W 1218 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1A-DR3Q12441 SHR5YOL110W 714 nt11.48□□□□□ -0.57
TY1A-DR3Q12441 PAC11YDR488C 1602 nt11.48□□□□□ -0.57
TY1A-DR3Q12441 RPP1BYDL130W 321 nt11.44□□□□□ -0.58
TY1A-DR3Q12441 SCS3YGL126W 1143 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-DR3Q12441 ARO7YPR060C 771 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-DR3Q12441 MEP2YNL142W 1500 nt11.37□□□□□ -0.59
TY1A-DR3Q12441 PTC2YER089C 1395 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-DR3Q12441 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1A-DR3Q12441 YOL085CYOL085C 342 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1A-DR3Q12441 NVJ2YPR091C 2313 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1A-DR3Q12441 NAB2YGL122C 1578 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1A-DR3Q12441 PUN1YLR414C 792 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1A-DR3Q12441 PKP1YIL042C 1185 nt11.25□□□□□ -0.61
TY1A-DR3Q12441 DCW1YKL046C 1350 nt11.25□□□□□ -0.61
TY1A-DR3Q12441 RPN10YHR200W 807 nt11.18□□□□□ -0.62
TY1A-DR3Q12441 YNL208WYNL208W 600 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1A-DR3Q12441 YBR220CYBR220C 1683 nt11.13□□□□□ -0.63
TY1A-DR3Q12441 FIS1YIL065C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-DR3Q12441 PAM17YKR065C 594 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-DR3Q12441 YJR018WYJR018W 363 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1A-DR3Q12441 PET122YER153C 765 nt11.07□□□□□ -0.64
TY1A-DR3Q12441 REG2YBR050C 1017 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1A-DR3Q12441 EMI2YDR516C 1503 nt10.99□□□□□ -0.65
TY1A-DR3Q12441 YPS1YLR120C 1710 nt10.99□□□□□ -0.65
TY1A-DR3Q12441 DAL1YIR027C 1383 nt10.96□□□□□ -0.65
TY1A-DR3Q12441 YDJ1YNL064C 1230 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1A-DR3Q12441 YJR120WYJR120W 351 nt10.92□□□□□ -0.66
TY1A-DR3Q12441 GUT2YIL155C 1950 nt10.89□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 PHO4YFR034C 939 nt10.89□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 FPR4YLR449W 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 PCH2YBR186W 1695 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 SDH1YKL148C 1923 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 YDL221WYDL221W 552 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1A-DR3Q12441 YMR090WYMR090W 684 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1A-DR3Q12441 GAR1YHR089C 618 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1A-DR3Q12441 PIB2YGL023C 1908 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1A-DR3Q12441 CAC2YML102W 1407 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1A-DR3Q12441 YDR095CYDR095C 411 nt10.79□□□□□ -0.68
TY1A-DR3Q12441 PTP1YDL230W 1008 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1A-DR3Q12441 INM2YDR287W 879 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1A-DR3Q12441 BUR6YER159C 429 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1A-DR3Q12441 Q0010Q0010 387 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1A-DR3Q12441 FPS1YLL043W 2010 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-DR3Q12441 SEC11YIR022W 504 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 RRN5YLR141W 1092 nt10.68□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 MET8YBR213W 825 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 SCC4YER147C 1875 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 CLB6YGR109C 1143 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 ARA2YMR041C 1008 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1A-DR3Q12441 IRC15YPL017C 1500 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1A-DR3Q12441 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1A-DR3Q12441 BMT5YIL096C 1011 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1A-DR3Q12441 SSA1YAL005C 1929 nt10.62□□□□□ -0.71
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