Protein–RNA interactions for Protein: P48813

GNP1, High-affinity glutamine permease, yeastyeast

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Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GNP1P48813 NSR1YGR159C 1245 nt16.26■□□□□ 0.19
GNP1P48813 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.83■□□□□ 0.12
GNP1P48813 NOP1YDL014W 984 nt15.14■□□□□ 0.01
GNP1P48813 MDJ1YFL016C 1536 nt15.09■□□□□ 0.01
GNP1P48813 SSA3YBL075C 1950 nt14.77□□□□□ -0.04
GNP1P48813 Q0182Q0182 405 nt14.17□□□□□ -0.14
GNP1P48813 MOT3YMR070W 1473 nt13.95□□□□□ -0.18
GNP1P48813 YJL027CYJL027C 417 nt13.8□□□□□ -0.2
GNP1P48813 YKL036CYKL036C 393 nt13.75□□□□□ -0.21
GNP1P48813 SRX1YKL086W 384 nt13.29□□□□□ -0.28
GNP1P48813 Q0297Q0297 156 nt13.23□□□□□ -0.29
GNP1P48813 YBR190WYBR190W 312 nt13.16□□□□□ -0.3
GNP1P48813 DBP2YNL112W 1641 nt13.12□□□□□ -0.31
GNP1P48813 PUT4YOR348C 1884 nt12.85□□□□□ -0.35
GNP1P48813 RTC3YHR087W 336 nt12.74□□□□□ -0.37
GNP1P48813 SSA4YER103W 1929 nt12.69□□□□□ -0.38
GNP1P48813 SPT5YML010W 3192 nt12.67□□□□□ -0.38
GNP1P48813 YCR051WYCR051W 669 nt12.54□□□□□ -0.4
GNP1P48813 SCS3YGL126W 1143 nt12.41□□□□□ -0.42
GNP1P48813 PAC11YDR488C 1602 nt12.4□□□□□ -0.42
GNP1P48813 BDF1YLR399C 2061 nt12.39□□□□□ -0.43
GNP1P48813 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.36□□□□□ -0.43
GNP1P48813 NVJ2YPR091C 2313 nt12.27□□□□□ -0.44
GNP1P48813 POA1YBR022W 534 nt12.27□□□□□ -0.45
GNP1P48813 ARE1YCR048W 1833 nt12.27□□□□□ -0.45
GNP1P48813 BSC6YOL137W 1494 nt12.26□□□□□ -0.45
GNP1P48813 TAT1YBR069C 1860 nt12.19□□□□□ -0.46
GNP1P48813 CCC1YLR220W 969 nt12.17□□□□□ -0.46
GNP1P48813 RVS167YDR388W 1449 nt12.15□□□□□ -0.46
GNP1P48813 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.07□□□□□ -0.48
GNP1P48813 SCJ1YMR214W 1134 nt11.99□□□□□ -0.49
GNP1P48813 YOL085CYOL085C 342 nt11.96□□□□□ -0.49
GNP1P48813 RPP1BYDL130W 321 nt11.86□□□□□ -0.51
GNP1P48813 URN1YPR152C 1398 nt11.86□□□□□ -0.51
GNP1P48813 FPS1YLL043W 2010 nt11.84□□□□□ -0.51
GNP1P48813 SAH1YER043C 1350 nt11.83□□□□□ -0.52
GNP1P48813 PKP1YIL042C 1185 nt11.8□□□□□ -0.52
GNP1P48813 NME1NME1 340 nt11.71□□□□□ -0.53
GNP1P48813 OPI9YLR338W 858 nt11.65□□□□□ -0.54
GNP1P48813 BUD23YCR047C 828 nt11.64□□□□□ -0.55
GNP1P48813 MEP2YNL142W 1500 nt11.64□□□□□ -0.55
GNP1P48813 SHR5YOL110W 714 nt11.54□□□□□ -0.56
GNP1P48813 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.49□□□□□ -0.57
GNP1P48813 YBR220CYBR220C 1683 nt11.44□□□□□ -0.58
GNP1P48813 DCW1YKL046C 1350 nt11.41□□□□□ -0.58
GNP1P48813 DEP1YAL013W 1218 nt11.4□□□□□ -0.58
GNP1P48813 PET122YER153C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
GNP1P48813 UME6YDR207C 2511 nt11.39□□□□□ -0.59
GNP1P48813 NAB2YGL122C 1578 nt11.34□□□□□ -0.59
GNP1P48813 RPN10YHR200W 807 nt11.34□□□□□ -0.59
GNP1P48813 PCH2YBR186W 1695 nt11.32□□□□□ -0.6
GNP1P48813 GUT2YIL155C 1950 nt11.32□□□□□ -0.6
GNP1P48813 PTC2YER089C 1395 nt11.31□□□□□ -0.6
GNP1P48813 PUN1YLR414C 792 nt11.28□□□□□ -0.6
GNP1P48813 EMI2YDR516C 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
GNP1P48813 SSA1YAL005C 1929 nt11.2□□□□□ -0.62
GNP1P48813 YGR139WYGR139W 339 nt11.18□□□□□ -0.62
GNP1P48813 YMR090WYMR090W 684 nt11.18□□□□□ -0.62
GNP1P48813 YNL208WYNL208W 600 nt11.18□□□□□ -0.62
GNP1P48813 PIB2YGL023C 1908 nt11.17□□□□□ -0.62
GNP1P48813 SEC11YIR022W 504 nt11.17□□□□□ -0.62
GNP1P48813 SDH1YKL148C 1923 nt11.15□□□□□ -0.62
GNP1P48813 FIS1YIL065C 468 nt11.15□□□□□ -0.62
GNP1P48813 YDJ1YNL064C 1230 nt11.12□□□□□ -0.63
GNP1P48813 YPS1YLR120C 1710 nt11.1□□□□□ -0.63
GNP1P48813 SCR1SCR1 522 nt11.1□□□□□ -0.63
GNP1P48813 YDL221WYDL221W 552 nt11.06□□□□□ -0.64
GNP1P48813 RRN5YLR141W 1092 nt11.03□□□□□ -0.64
GNP1P48813 YJR018WYJR018W 363 nt11.02□□□□□ -0.65
GNP1P48813 ATS1YAL020C 1002 nt11.01□□□□□ -0.65
GNP1P48813 DAL1YIR027C 1383 nt10.99□□□□□ -0.65
GNP1P48813 BOR1YNL275W 1731 nt10.98□□□□□ -0.65
GNP1P48813 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.97□□□□□ -0.65
GNP1P48813 GAR1YHR089C 618 nt10.93□□□□□ -0.66
GNP1P48813 PHO4YFR034C 939 nt10.91□□□□□ -0.66
GNP1P48813 RTF1YGL244W 1677 nt10.91□□□□□ -0.66
GNP1P48813 FPR4YLR449W 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
GNP1P48813 SCC4YER147C 1875 nt10.89□□□□□ -0.67
GNP1P48813 MCH5YOR306C 1566 nt10.87□□□□□ -0.67
GNP1P48813 YDR095CYDR095C 411 nt10.86□□□□□ -0.67
GNP1P48813 YJL225CYJL225C 5277 nt10.85□□□□□ -0.67
GNP1P48813 CAC2YML102W 1407 nt10.84□□□□□ -0.67
GNP1P48813 YJR120WYJR120W 351 nt10.83□□□□□ -0.68
GNP1P48813 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.81□□□□□ -0.68
GNP1P48813 PTK1YKL198C 1989 nt10.79□□□□□ -0.68
GNP1P48813 YSC84YHR016C 1407 nt10.78□□□□□ -0.68
GNP1P48813 PTP1YDL230W 1008 nt10.75□□□□□ -0.69
GNP1P48813 INM2YDR287W 879 nt10.74□□□□□ -0.69
GNP1P48813 YHL050CYHL050C 2094 nt10.73□□□□□ -0.69
GNP1P48813 IRC15YPL017C 1500 nt10.7□□□□□ -0.7
GNP1P48813 BOP3YNL042W 1191 nt10.7□□□□□ -0.7
GNP1P48813 RPP2BYDR382W 333 nt10.67□□□□□ -0.7
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