Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.42■□□□□ 0.54
HDA2Q06629 NSR1YGR159C 1245 nt18.36■□□□□ 0.53
HDA2Q06629 NOP1YDL014W 984 nt17.89■□□□□ 0.45
HDA2Q06629 YKL036CYKL036C 393 nt16.55■□□□□ 0.24
HDA2Q06629 MDJ1YFL016C 1536 nt16.47■□□□□ 0.23
HDA2Q06629 Q0297Q0297 156 nt15.73■□□□□ 0.11
HDA2Q06629 SRX1YKL086W 384 nt15.68■□□□□ 0.1
HDA2Q06629 YJL027CYJL027C 417 nt15.42■□□□□ 0.06
HDA2Q06629 SCS3YGL126W 1143 nt15.1■□□□□ 0.01
HDA2Q06629 YCR051WYCR051W 669 nt14.83□□□□□ -0.04
HDA2Q06629 DBP2YNL112W 1641 nt14.45□□□□□ -0.1
HDA2Q06629 YOL085CYOL085C 342 nt14.35□□□□□ -0.11
HDA2Q06629 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.2□□□□□ -0.14
HDA2Q06629 PKP1YIL042C 1185 nt14.11□□□□□ -0.15
HDA2Q06629 RPP1BYDL130W 321 nt14.09□□□□□ -0.15
HDA2Q06629 YBR190WYBR190W 312 nt14.09□□□□□ -0.15
HDA2Q06629 Q0182Q0182 405 nt14.06□□□□□ -0.16
HDA2Q06629 CCC1YLR220W 969 nt14□□□□□ -0.17
HDA2Q06629 RTC3YHR087W 336 nt13.81□□□□□ -0.2
HDA2Q06629 MOT3YMR070W 1473 nt13.8□□□□□ -0.2
HDA2Q06629 SCJ1YMR214W 1134 nt13.64□□□□□ -0.23
HDA2Q06629 RVS167YDR388W 1449 nt13.64□□□□□ -0.23
HDA2Q06629 ATS1YAL020C 1002 nt13.49□□□□□ -0.25
HDA2Q06629 PET122YER153C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
HDA2Q06629 SSA3YBL075C 1950 nt13.42□□□□□ -0.26
HDA2Q06629 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.41□□□□□ -0.26
HDA2Q06629 SCR1SCR1 522 nt13.27□□□□□ -0.29
HDA2Q06629 SHR5YOL110W 714 nt13.09□□□□□ -0.31
HDA2Q06629 RRN5YLR141W 1092 nt13.07□□□□□ -0.32
HDA2Q06629 YDJ1YNL064C 1230 nt12.98□□□□□ -0.33
HDA2Q06629 PUT4YOR348C 1884 nt12.87□□□□□ -0.35
HDA2Q06629 URN1YPR152C 1398 nt12.83□□□□□ -0.36
HDA2Q06629 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.83□□□□□ -0.36
HDA2Q06629 DEP1YAL013W 1218 nt12.79□□□□□ -0.36
HDA2Q06629 RSB1YOR049C 1065 nt12.77□□□□□ -0.37
HDA2Q06629 OPI9YLR338W 858 nt12.67□□□□□ -0.38
HDA2Q06629 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
HDA2Q06629 RPN10YHR200W 807 nt12.65□□□□□ -0.38
HDA2Q06629 SAH1YER043C 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
HDA2Q06629 ARE1YCR048W 1833 nt12.59□□□□□ -0.39
HDA2Q06629 YNL208WYNL208W 600 nt12.57□□□□□ -0.4
HDA2Q06629 PST2YDR032C 597 nt12.51□□□□□ -0.41
HDA2Q06629 POA1YBR022W 534 nt12.51□□□□□ -0.41
HDA2Q06629 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.5□□□□□ -0.41
HDA2Q06629 PUN1YLR414C 792 nt12.33□□□□□ -0.44
HDA2Q06629 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.45
HDA2Q06629 TIR1YER011W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
HDA2Q06629 YJR018WYJR018W 363 nt12.24□□□□□ -0.45
HDA2Q06629 BUD23YCR047C 828 nt12.22□□□□□ -0.45
HDA2Q06629 PTC2YER089C 1395 nt12.19□□□□□ -0.46
HDA2Q06629 SSA1YAL005C 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
HDA2Q06629 YKL097CYKL097C 411 nt12.11□□□□□ -0.47
HDA2Q06629 NAB2YGL122C 1578 nt12.05□□□□□ -0.48
HDA2Q06629 YJR120WYJR120W 351 nt12.01□□□□□ -0.49
HDA2Q06629 SHU1YHL006C 453 nt12□□□□□ -0.49
HDA2Q06629 RPP2BYDR382W 333 nt11.98□□□□□ -0.49
HDA2Q06629 SRB2YHR041C 633 nt11.97□□□□□ -0.49
HDA2Q06629 FPR4YLR449W 1179 nt11.88□□□□□ -0.51
HDA2Q06629 DAL1YIR027C 1383 nt11.87□□□□□ -0.51
HDA2Q06629 FIS1YIL065C 468 nt11.85□□□□□ -0.51
HDA2Q06629 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
HDA2Q06629 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.79□□□□□ -0.52
HDA2Q06629 PHO4YFR034C 939 nt11.75□□□□□ -0.53
HDA2Q06629 NME1NME1 340 nt11.73□□□□□ -0.53
HDA2Q06629 WWM1YFL010C 636 nt11.72□□□□□ -0.53
HDA2Q06629 YBL100CYBL100C 315 nt11.69□□□□□ -0.54
HDA2Q06629 BDH2YAL061W 1254 nt11.67□□□□□ -0.54
HDA2Q06629 SPT5YML010W 3192 nt11.66□□□□□ -0.54
HDA2Q06629 YGR021WYGR021W 873 nt11.64□□□□□ -0.55
HDA2Q06629 HOM6YJR139C 1080 nt11.63□□□□□ -0.55
HDA2Q06629 MNP1YGL068W 585 nt11.57□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 YOR139CYOR139C 393 nt11.57□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 YPS1YLR120C 1710 nt11.56□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 SSA4YER103W 1929 nt11.55□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 FUN26YAL022C 1554 nt11.54□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.53□□□□□ -0.56
HDA2Q06629 MEP2YNL142W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
HDA2Q06629 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.49□□□□□ -0.57
HDA2Q06629 LSM3YLR438C-A 270 nt11.49□□□□□ -0.57
HDA2Q06629 TRM9YML014W 840 nt11.49□□□□□ -0.57
HDA2Q06629 YDR095CYDR095C 411 nt11.48□□□□□ -0.57
HDA2Q06629 RKM5YLR137W 1104 nt11.45□□□□□ -0.58
HDA2Q06629 ALF1YNL148C 765 nt11.45□□□□□ -0.58
HDA2Q06629 NPL3YDR432W 1245 nt11.41□□□□□ -0.58
HDA2Q06629 YOL037CYOL037C 354 nt11.37□□□□□ -0.59
HDA2Q06629 CCT6YDR188W 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
HDA2Q06629 DCW1YKL046C 1350 nt11.33□□□□□ -0.6
HDA2Q06629 PAC11YDR488C 1602 nt11.32□□□□□ -0.6
HDA2Q06629 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.32□□□□□ -0.6
HDA2Q06629 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.32□□□□□ -0.6
HDA2Q06629 RPP2AYOL039W 321 nt11.28□□□□□ -0.6
HDA2Q06629 YGR139WYGR139W 339 nt11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms