RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C NDL1Q06568 189 aa3.65□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YOR296WQ08748 1289 aa3.65□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PPX1P38698 397 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ACO2P39533 789 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YIR007WP40566 764 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ORM2Q06144 216 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C FRT1Q99332 602 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C GCN2P15442 1659 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C STU1P38198 1513 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SWR1Q05471 1514 aa3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C DIT1P21623 536 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C FPS1P23900 669 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C BSD2P38356 321 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CEM1P39525 442 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SEC39Q12745 709 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C TAF2P23255 1407 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ESP1Q03018 1630 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C THR4P16120 514 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CUZ1P53899 274 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SCC2Q04002 1493 aa3.64□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SWI6P09959 803 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MSP1P28737 362 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C VPS24P36095 224 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ECM2P38241 364 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C APM2P38700 605 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C AIM46P38885 310 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RIO2P40160 425 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NTA1P40354 457 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C IAH1P41734 238 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C COG8Q04632 607 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C DEP1P31385 405 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MDM38Q08179 573 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NFI1Q12216 726 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SSK2P53599 1579 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YML133CQ03099 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YLL067CQ07888 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YLL066CQ99208 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PSO2P30620 661 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PSY2P40164 858 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NDC80P40460 691 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SKP1P52286 194 aa3.63□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RPO31P04051 1460 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PET100P38958 111 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C TPM2P40414 161 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MHP1P43638 1398 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.62□□□□□ -1.83not detected
DOA4YDR069C MGE1P38523 228 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C AIM20P40451 204 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RGD2P43556 714 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C POL32P47110 350 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SAM37P50110 327 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YNR040WP53736 256 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C HEH2Q03281 663 aa3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PCT1P13259 424 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RAD16P31244 790 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C KTR2P33550 425 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RTS3P53289 263 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CDC55Q00362 526 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RCF1Q03713 159 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ARR1Q06596 294 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C GLE1Q12315 538 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SSM4P40318 1319 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YHL008CP38750 627 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C LEM3P42838 414 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MRS2Q01926 470 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RSC2Q06488 889 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.61□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CLB1P24868 471 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SWE1P32944 819 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YIL165CP40446 119 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C KIP3P53086 805 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ITC1P53125 1264 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RSC4Q02206 625 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C BSC2Q05611 235 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C WHI5Q12416 295 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SIN3P22579 1536 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RAD50P12753 1312 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CCP1P00431 361 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SWH1P35845 1188 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C LYS5P50113 272 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C JJJ1P53863 590 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C GPI13Q07830 1017 aa3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms