Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NSR1YGR159C 1245 nt18.78■□□□□ 0.6
NFI1Q12216 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.64■□□□□ 0.57
NFI1Q12216 NOP1YDL014W 984 nt17.95■□□□□ 0.46
NFI1Q12216 MDJ1YFL016C 1536 nt17.05■□□□□ 0.32
NFI1Q12216 YKL036CYKL036C 393 nt16.26■□□□□ 0.19
NFI1Q12216 SSA3YBL075C 1950 nt15.83■□□□□ 0.12
NFI1Q12216 SRX1YKL086W 384 nt15.69■□□□□ 0.1
NFI1Q12216 YJL027CYJL027C 417 nt15.67■□□□□ 0.1
NFI1Q12216 Q0297Q0297 156 nt15.61■□□□□ 0.09
NFI1Q12216 DBP2YNL112W 1641 nt14.94□□□□□ -0.02
NFI1Q12216 YCR051WYCR051W 669 nt14.88□□□□□ -0.03
NFI1Q12216 SCS3YGL126W 1143 nt14.65□□□□□ -0.06
NFI1Q12216 YBR190WYBR190W 312 nt14.58□□□□□ -0.08
NFI1Q12216 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.4□□□□□ -0.1
NFI1Q12216 CCC1YLR220W 969 nt14.27□□□□□ -0.13
NFI1Q12216 RTC3YHR087W 336 nt14.26□□□□□ -0.13
NFI1Q12216 YOL085CYOL085C 342 nt14.11□□□□□ -0.15
NFI1Q12216 RPP1BYDL130W 321 nt14.01□□□□□ -0.17
NFI1Q12216 PKP1YIL042C 1185 nt13.96□□□□□ -0.17
NFI1Q12216 RVS167YDR388W 1449 nt13.94□□□□□ -0.18
NFI1Q12216 SCJ1YMR214W 1134 nt13.84□□□□□ -0.19
NFI1Q12216 PUT4YOR348C 1884 nt13.53□□□□□ -0.24
NFI1Q12216 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NFI1Q12216 PAC11YDR488C 1602 nt13.5□□□□□ -0.25
NFI1Q12216 NVJ2YPR091C 2313 nt13.45□□□□□ -0.26
NFI1Q12216 PET122YER153C 765 nt13.45□□□□□ -0.26
NFI1Q12216 SHR5YOL110W 714 nt13.38□□□□□ -0.27
NFI1Q12216 SSA4YER103W 1929 nt13.29□□□□□ -0.28
NFI1Q12216 FPS1YLL043W 2010 nt13.29□□□□□ -0.28
NFI1Q12216 URN1YPR152C 1398 nt13.23□□□□□ -0.29
NFI1Q12216 ARE1YCR048W 1833 nt13.19□□□□□ -0.3
NFI1Q12216 SCR1SCR1 522 nt13.19□□□□□ -0.3
NFI1Q12216 DEP1YAL013W 1218 nt13.14□□□□□ -0.31
NFI1Q12216 SAH1YER043C 1350 nt13.12□□□□□ -0.31
NFI1Q12216 OPI9YLR338W 858 nt13.09□□□□□ -0.31
NFI1Q12216 POA1YBR022W 534 nt13.07□□□□□ -0.32
NFI1Q12216 YDJ1YNL064C 1230 nt13.05□□□□□ -0.32
NFI1Q12216 SPT5YML010W 3192 nt13.05□□□□□ -0.32
NFI1Q12216 RRN5YLR141W 1092 nt13.02□□□□□ -0.33
NFI1Q12216 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.01□□□□□ -0.33
NFI1Q12216 ATS1YAL020C 1002 nt13□□□□□ -0.33
NFI1Q12216 BDF1YLR399C 2061 nt12.99□□□□□ -0.33
NFI1Q12216 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.33
NFI1Q12216 RPN10YHR200W 807 nt12.92□□□□□ -0.34
NFI1Q12216 YNL208WYNL208W 600 nt12.87□□□□□ -0.35
NFI1Q12216 BSC6YOL137W 1494 nt12.85□□□□□ -0.35
NFI1Q12216 GAR1YHR089C 618 nt12.85□□□□□ -0.35
NFI1Q12216 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.76□□□□□ -0.37
NFI1Q12216 TAT1YBR069C 1860 nt12.76□□□□□ -0.37
NFI1Q12216 Q0182Q0182 405 nt12.72□□□□□ -0.37
NFI1Q12216 PUN1YLR414C 792 nt12.7□□□□□ -0.38
NFI1Q12216 BUD23YCR047C 828 nt12.69□□□□□ -0.38
NFI1Q12216 RSB1YOR049C 1065 nt12.65□□□□□ -0.38
NFI1Q12216 PTC2YER089C 1395 nt12.63□□□□□ -0.39
NFI1Q12216 YJR018WYJR018W 363 nt12.58□□□□□ -0.4
NFI1Q12216 NAB2YGL122C 1578 nt12.49□□□□□ -0.41
NFI1Q12216 TIR1YER011W 765 nt12.43□□□□□ -0.42
NFI1Q12216 UME6YDR207C 2511 nt12.42□□□□□ -0.42
NFI1Q12216 YJR120WYJR120W 351 nt12.35□□□□□ -0.43
NFI1Q12216 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
NFI1Q12216 DAL1YIR027C 1383 nt12.28□□□□□ -0.44
NFI1Q12216 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
NFI1Q12216 RPP2BYDR382W 333 nt12.23□□□□□ -0.45
NFI1Q12216 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
NFI1Q12216 PHO4YFR034C 939 nt12.16□□□□□ -0.46
NFI1Q12216 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
NFI1Q12216 PST2YDR032C 597 nt12.09□□□□□ -0.47
NFI1Q12216 MEP2YNL142W 1500 nt12.09□□□□□ -0.47
NFI1Q12216 YPS1YLR120C 1710 nt12.05□□□□□ -0.48
NFI1Q12216 YBL100CYBL100C 315 nt12.02□□□□□ -0.49
NFI1Q12216 MOT3YMR070W 1473 nt11.95□□□□□ -0.5
NFI1Q12216 BDH2YAL061W 1254 nt11.94□□□□□ -0.5
NFI1Q12216 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.93□□□□□ -0.5
NFI1Q12216 DCW1YKL046C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
NFI1Q12216 YDR095CYDR095C 411 nt11.91□□□□□ -0.5
NFI1Q12216 GUT2YIL155C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
NFI1Q12216 FUN26YAL022C 1554 nt11.87□□□□□ -0.51
NFI1Q12216 WWM1YFL010C 636 nt11.83□□□□□ -0.52
NFI1Q12216 TRM9YML014W 840 nt11.77□□□□□ -0.53
NFI1Q12216 MCH5YOR306C 1566 nt11.76□□□□□ -0.53
NFI1Q12216 ALF1YNL148C 765 nt11.75□□□□□ -0.53
NFI1Q12216 EMI2YDR516C 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
NFI1Q12216 LSM3YLR438C-A 270 nt11.71□□□□□ -0.53
NFI1Q12216 YBR220CYBR220C 1683 nt11.71□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 BOR1YNL275W 1731 nt11.7□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 SHU1YHL006C 453 nt11.7□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 PCH2YBR186W 1695 nt11.69□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 PTP1YDL230W 1008 nt11.69□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 RPP2AYOL039W 321 nt11.68□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 CCT6YDR188W 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 CAC2YML102W 1407 nt11.67□□□□□ -0.54
NFI1Q12216 YMR090WYMR090W 684 nt11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms