Protein–RNA interactions for Protein: P38700

APM2, Adaptin medium chain homolog APM2, yeastyeast

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APM2P38700 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.67■■□□□ 1.06
APM2P38700 NSR1YGR159C 1245 nt21.32■■□□□ 1
APM2P38700 NOP1YDL014W 984 nt21.26■□□□□ 0.99
APM2P38700 YKL036CYKL036C 393 nt20.06■□□□□ 0.8
APM2P38700 MDJ1YFL016C 1536 nt19.05■□□□□ 0.64
APM2P38700 YJL027CYJL027C 417 nt18.81■□□□□ 0.6
APM2P38700 Q0297Q0297 156 nt18.78■□□□□ 0.6
APM2P38700 SRX1YKL086W 384 nt18.59■□□□□ 0.57
APM2P38700 SCS3YGL126W 1143 nt18.5■□□□□ 0.55
APM2P38700 YCR051WYCR051W 669 nt17.65■□□□□ 0.42
APM2P38700 YOL085CYOL085C 342 nt17.36■□□□□ 0.37
APM2P38700 PKP1YIL042C 1185 nt17.01■□□□□ 0.31
APM2P38700 SCJ1YMR214W 1134 nt17.01■□□□□ 0.31
APM2P38700 RPP1BYDL130W 321 nt16.85■□□□□ 0.29
APM2P38700 DBP2YNL112W 1641 nt16.82■□□□□ 0.28
APM2P38700 ATS1YAL020C 1002 nt16.68■□□□□ 0.26
APM2P38700 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
APM2P38700 CCC1YLR220W 969 nt16.33■□□□□ 0.2
APM2P38700 YBR190WYBR190W 312 nt16.27■□□□□ 0.2
APM2P38700 PET122YER153C 765 nt16.03■□□□□ 0.16
APM2P38700 SCR1SCR1 522 nt15.99■□□□□ 0.15
APM2P38700 RTC3YHR087W 336 nt15.88■□□□□ 0.13
APM2P38700 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.79■□□□□ 0.12
APM2P38700 RVS167YDR388W 1449 nt15.77■□□□□ 0.11
APM2P38700 RRN5YLR141W 1092 nt15.61■□□□□ 0.09
APM2P38700 RSB1YOR049C 1065 nt15.43■□□□□ 0.06
APM2P38700 PST2YDR032C 597 nt15.37■□□□□ 0.05
APM2P38700 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.32■□□□□ 0.04
APM2P38700 YDJ1YNL064C 1230 nt15.28■□□□□ 0.04
APM2P38700 SHR5YOL110W 714 nt15.2■□□□□ 0.02
APM2P38700 YKL097CYKL097C 411 nt15□□□□□ -0.01
APM2P38700 PUT4YOR348C 1884 nt14.87□□□□□ -0.03
APM2P38700 URN1YPR152C 1398 nt14.85□□□□□ -0.03
APM2P38700 GAR1YHR089C 618 nt14.84□□□□□ -0.03
APM2P38700 DEP1YAL013W 1218 nt14.8□□□□□ -0.04
APM2P38700 OPI9YLR338W 858 nt14.66□□□□□ -0.06
APM2P38700 SHU1YHL006C 453 nt14.63□□□□□ -0.07
APM2P38700 RPN10YHR200W 807 nt14.59□□□□□ -0.07
APM2P38700 SAH1YER043C 1350 nt14.59□□□□□ -0.07
APM2P38700 ARE1YCR048W 1833 nt14.57□□□□□ -0.08
APM2P38700 YNL208WYNL208W 600 nt14.56□□□□□ -0.08
APM2P38700 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.38□□□□□ -0.11
APM2P38700 POA1YBR022W 534 nt14.38□□□□□ -0.11
APM2P38700 TIR1YER011W 765 nt14.34□□□□□ -0.11
APM2P38700 YOR139CYOR139C 393 nt14.32□□□□□ -0.12
APM2P38700 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.23□□□□□ -0.13
APM2P38700 PUN1YLR414C 792 nt14.23□□□□□ -0.13
APM2P38700 YJR018WYJR018W 363 nt14.15□□□□□ -0.14
APM2P38700 BSC6YOL137W 1494 nt14.11□□□□□ -0.15
APM2P38700 SSA3YBL075C 1950 nt14.1□□□□□ -0.15
APM2P38700 NPL3YDR432W 1245 nt14.09□□□□□ -0.15
APM2P38700 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
APM2P38700 PTC2YER089C 1395 nt14.07□□□□□ -0.16
APM2P38700 BUD23YCR047C 828 nt14.03□□□□□ -0.16
APM2P38700 Q0182Q0182 405 nt13.94□□□□□ -0.18
APM2P38700 YJR120WYJR120W 351 nt13.94□□□□□ -0.18
APM2P38700 SRB2YHR041C 633 nt13.92□□□□□ -0.18
APM2P38700 NAB2YGL122C 1578 nt13.9□□□□□ -0.18
APM2P38700 YGR021WYGR021W 873 nt13.86□□□□□ -0.19
APM2P38700 HOM6YJR139C 1080 nt13.84□□□□□ -0.19
APM2P38700 MNP1YGL068W 585 nt13.83□□□□□ -0.2
APM2P38700 RPP2BYDR382W 333 nt13.82□□□□□ -0.2
APM2P38700 YOL037CYOL037C 354 nt13.81□□□□□ -0.2
APM2P38700 WWM1YFL010C 636 nt13.77□□□□□ -0.21
APM2P38700 FIS1YIL065C 468 nt13.73□□□□□ -0.21
APM2P38700 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.72□□□□□ -0.21
APM2P38700 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.72□□□□□ -0.21
APM2P38700 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.72□□□□□ -0.21
APM2P38700 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
APM2P38700 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.72□□□□□ -0.21
APM2P38700 DAL1YIR027C 1383 nt13.71□□□□□ -0.22
APM2P38700 INM2YDR287W 879 nt13.65□□□□□ -0.22
APM2P38700 FPR4YLR449W 1179 nt13.65□□□□□ -0.22
APM2P38700 MOT3YMR070W 1473 nt13.64□□□□□ -0.23
APM2P38700 RKM5YLR137W 1104 nt13.64□□□□□ -0.23
APM2P38700 PHO4YFR034C 939 nt13.59□□□□□ -0.23
APM2P38700 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.57□□□□□ -0.24
APM2P38700 BDH2YAL061W 1254 nt13.55□□□□□ -0.24
APM2P38700 SPT5YML010W 3192 nt13.53□□□□□ -0.24
APM2P38700 YBL100CYBL100C 315 nt13.52□□□□□ -0.25
APM2P38700 PUS2YGL063W 1113 nt13.45□□□□□ -0.26
APM2P38700 YLR281CYLR281C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
APM2P38700 YPS1YLR120C 1710 nt13.36□□□□□ -0.27
APM2P38700 LSM3YLR438C-A 270 nt13.35□□□□□ -0.27
APM2P38700 FUN26YAL022C 1554 nt13.35□□□□□ -0.27
APM2P38700 WHI5YOR083W 888 nt13.32□□□□□ -0.28
APM2P38700 TRM9YML014W 840 nt13.29□□□□□ -0.28
APM2P38700 YDR095CYDR095C 411 nt13.27□□□□□ -0.29
APM2P38700 MEP2YNL142W 1500 nt13.25□□□□□ -0.29
APM2P38700 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.2□□□□□ -0.3
APM2P38700 CCT6YDR188W 1641 nt13.19□□□□□ -0.3
APM2P38700 ALF1YNL148C 765 nt13.17□□□□□ -0.3
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