RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W NNF1P47149 201 aa6.46□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W MSH3P25336 1018 aa6.45□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W RDH54P38086 958 aa6.45□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TAF13P11747 167 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W SHU2P38957 223 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W YGR053CP53234 283 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W RTT10Q08924 1013 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W YIG1Q08956 461 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W MMS22Q06164 1454 aa6.44□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W XKS1P42826 600 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W PEX13P80667 386 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W GIS4Q04233 774 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W SLP1Q12232 587 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-DR6P0CX70 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-ER1P0CX71 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-LR2P0CX72 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-PLP0CX73 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-JR1P0CX74 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-LR3P0CX75 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-ML2P0CX76 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-GR1Q12085 440 aa6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W FAA4P47912 694 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HPF1Q05164 967 aa6.42□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HDA2Q06629 674 aa6.42□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W DPH6Q12429 685 aa6.42□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W YTA7P40340 1379 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W VMA4P22203 233 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HXT13P39924 564 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W GIP2P40036 548 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HXT17P53631 564 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HXT15P54854 567 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W HIR3P47171 1648 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W NEO1P40527 1151 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W GDE1Q02979 1223 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W MRL1Q06815 381 aa6.41□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W YKL077WP36081 392 aa6.4□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W PAN5P38787 379 aa6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W POL5P39985 1022 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W ENT3P47160 408 aa6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W CWC24P53769 259 aa6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W SIW14P53965 281 aa6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W EEB1Q02891 456 aa6.4□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W ARL1P38116 183 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W SPO71Q03868 1245 aa6.39□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W REC8Q12188 680 aa6.39□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W CHD1P32657 1468 aa6.38□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W NEM1P38757 446 aa6.38□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W ALG14P38242 237 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W TAT2P38967 592 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W TED1P40533 473 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W GCV1P48015 400 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W MEC3Q02574 474 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W AIM44Q99299 758 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W SLS1P42900 643 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W YJL049WP47048 450 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W YOL098CQ12496 1037 aa6.37□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W OPI10Q08202 246 aa6.36□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W REV3P14284 1504 aa6.36□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PRD1YCL057W NOP2P40991 618 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W YGR035CP53222 116 aa6.35□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W NHA1Q99271 985 aa6.35□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W RAD27P26793 382 aa6.35□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W RER2P35196 286 aa6.35□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W IOC3P43596 787 aa6.34□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W ROD1Q02805 837 aa6.34□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W EST2Q06163 884 aa6.34□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W THO2P53552 1597 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRD1YCL057W SAC7P17121 654 aa6.34□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.34□□□□□ -1.4not detected
PRD1YCL057W ADD66P36040 267 aa6.34□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W ELG1Q12050 791 aa6.34□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W TAF2P23255 1407 aa6.33□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W TRP2P00899 507 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W MKK2P32491 506 aa6.33□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W YKL069WP36088 180 aa6.33□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data6.33□□□□□ -1.4not detected
PRD1YCL057W RKM2Q03942 479 aa6.33□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W ERS1P17261 260 aa6.32□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W TYW3P53177 273 aa6.32□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W PRI2P20457 528 aa6.31□□□□□ -1.4
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