RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W DRS1P32892 752 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PRD1YCL057W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
PRD1YCL057W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRD1YCL057W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRD1YCL057W AVT3P36062 692 aa11.71□□□□□ -0.54
PRD1YCL057W TFA1P36100 482 aa11.57□□□□□ -0.56
PRD1YCL057W ISW2Q08773 1120 aa11.02□□□□□ -0.64
PRD1YCL057W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRD1YCL057W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PRD1YCL057W FAP1P53971 965 aa10.87□□□□□ -0.67
PRD1YCL057W PRI1P10363 409 aa10.86□□□□□ -0.67
PRD1YCL057W AAD16Q02895 342 aa10.61□□□□□ -0.71
PRD1YCL057W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRD1YCL057W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRD1YCL057W REB1P21538 810 aa10.42□□□□□ -0.74
PRD1YCL057W SPT21P35209 758 aa10.3□□□□□ -0.76
PRD1YCL057W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRD1YCL057W RIM101P33400 625 aa10.19□□□□□ -0.78
PRD1YCL057W PRY3P47033 881 aa10.17□□□□□ -0.78
PRD1YCL057W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRD1YCL057W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRD1YCL057W PTP3P40048 928 aa9.88□□□□□ -0.83
PRD1YCL057W OXP1P28273 1286 aa9.88□□□□□ -0.83
PRD1YCL057W MRPL32P25348 183 aa9.86□□□□□ -0.83
PRD1YCL057W SSP1P38871 571 aa9.79□□□□□ -0.84
PRD1YCL057W YCK3P39962 524 aa9.76□□□□□ -0.85
PRD1YCL057W TFC8Q12308 588 aa9.7□□□□□ -0.86
PRD1YCL057W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRD1YCL057W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRD1YCL057W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRD1YCL057W HOP09932 586 aa9.65□□□□□ -0.86
PRD1YCL057W YLR271WQ06152 274 aa9.64□□□□□ -0.87
PRD1YCL057W CDC27P38042 758 aa9.62□□□□□ -0.87
PRD1YCL057W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.59□□□□□ -0.87not detected
PRD1YCL057W DCD1P06773 312 aa9.56□□□□□ -0.88
PRD1YCL057W DMA1P38823 416 aa9.56□□□□□ -0.88
PRD1YCL057W RSM7P47150 247 aa9.55□□□□□ -0.88
PRD1YCL057W MGA2P40578 1113 aa9.44□□□□□ -0.9
PRD1YCL057W BCH2P36122 765 aa9.41□□□□□ -0.9
PRD1YCL057W AI2P03876 854 aa9.37□□□□□ -0.91
PRD1YCL057W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRD1YCL057W CST9Q06032 482 aa9.34□□□□□ -0.91
PRD1YCL057W BBC1P47068 1157 aa9.28□□□□□ -0.92
PRD1YCL057W EPS1P40557 701 aa9.25□□□□□ -0.93
PRD1YCL057W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PRD1YCL057W BDF1P35817 686 aa9.2□□□□□ -0.94
PRD1YCL057W SCY1P53009 804 aa9.18□□□□□ -0.94
PRD1YCL057W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRD1YCL057W YGL015CP33199 130 aa9.16□□□□□ -0.94
PRD1YCL057W MRM1P25270 412 aa9.08□□□□□ -0.96
PRD1YCL057W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PRD1YCL057W RAM2P29703 316 aa9.05□□□□□ -0.96
PRD1YCL057W RCR1P38212 213 aa9.01□□□□□ -0.97
PRD1YCL057W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRD1YCL057W RTG3P38165 486 aa8.99□□□□□ -0.97
PRD1YCL057W VPS29P38759 282 aa8.9□□□□□ -0.98
PRD1YCL057W MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PRD1YCL057W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PRD1YCL057W LEU3P08638 886 aa8.82□□□□□ -1
PRD1YCL057W LEO1P38439 464 aa8.82□□□□□ -1
PRD1YCL057W YPR148CQ06523 435 aa8.81□□□□□ -1
PRD1YCL057W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.8□□□□□ -1not detected
PRD1YCL057W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRD1YCL057W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.77□□□□□ -1.01not detected
PRD1YCL057W STS1P38637 319 aa8.77□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W IFH1P39520 1085 aa8.77□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W TGL3P40308 642 aa8.76□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W COQ8P27697 501 aa8.74□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PRD1YCL057W CKB1P43639 278 aa8.71□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W VPS70P47161 811 aa8.71□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W YOR238WQ08634 303 aa8.71□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W YFR006WP43590 535 aa8.68□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W EDS1P38073 919 aa8.67□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W YAP5P40574 245 aa8.66□□□□□ -1.02
PRD1YCL057W MIF2P35201 549 aa8.65□□□□□ -1.03
PRD1YCL057W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRD1YCL057W PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W MST1P07236 462 aa8.57□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W PIB1Q06651 286 aa8.57□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W DSF2P38213 736 aa8.56□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W TAF7Q05021 590 aa8.54□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W PBS2P08018 668 aa8.53□□□□□ -1.04
PRD1YCL057W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRD1YCL057W SAM3Q08986 587 aa8.5□□□□□ -1.05
PRD1YCL057W GUT1P32190 709 aa8.44□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W ATH1P48016 1211 aa8.42□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W MAM3Q12296 706 aa8.41□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W COX6P00427 148 aa8.41□□□□□ -1.06
PRD1YCL057W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W GYP5Q12344 894 aa8.38□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W GTT3P39996 337 aa8.38□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W IES2P40154 320 aa8.36□□□□□ -1.07
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