Protein–RNA interactions for Protein: P40533

TED1, Protein TED1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TED1P40533 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.17■□□□□ 0.66
TED1P40533 NSR1YGR159C 1245 nt19.05■□□□□ 0.64
TED1P40533 NOP1YDL014W 984 nt18.55■□□□□ 0.56
TED1P40533 YKL036CYKL036C 393 nt17.14■□□□□ 0.33
TED1P40533 MDJ1YFL016C 1536 nt17.02■□□□□ 0.32
TED1P40533 Q0297Q0297 156 nt16.29■□□□□ 0.2
TED1P40533 SRX1YKL086W 384 nt16.27■□□□□ 0.2
TED1P40533 YJL027CYJL027C 417 nt15.99■□□□□ 0.15
TED1P40533 SCS3YGL126W 1143 nt15.63■□□□□ 0.09
TED1P40533 YCR051WYCR051W 669 nt15.42■□□□□ 0.06
TED1P40533 DBP2YNL112W 1641 nt15.08■□□□□ 0
TED1P40533 YOL085CYOL085C 342 nt14.88□□□□□ -0.03
TED1P40533 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.76□□□□□ -0.05
TED1P40533 PKP1YIL042C 1185 nt14.68□□□□□ -0.06
TED1P40533 RPP1BYDL130W 321 nt14.61□□□□□ -0.07
TED1P40533 CCC1YLR220W 969 nt14.59□□□□□ -0.07
TED1P40533 YBR190WYBR190W 312 nt14.46□□□□□ -0.09
TED1P40533 RTC3YHR087W 336 nt14.12□□□□□ -0.15
TED1P40533 SCJ1YMR214W 1134 nt14.09□□□□□ -0.15
TED1P40533 RVS167YDR388W 1449 nt14.03□□□□□ -0.16
TED1P40533 PET122YER153C 765 nt14□□□□□ -0.17
TED1P40533 SSA3YBL075C 1950 nt13.99□□□□□ -0.17
TED1P40533 ATS1YAL020C 1002 nt13.96□□□□□ -0.17
TED1P40533 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.94□□□□□ -0.18
TED1P40533 SCR1SCR1 522 nt13.75□□□□□ -0.21
TED1P40533 RRN5YLR141W 1092 nt13.59□□□□□ -0.23
TED1P40533 SHR5YOL110W 714 nt13.58□□□□□ -0.24
TED1P40533 YDJ1YNL064C 1230 nt13.47□□□□□ -0.25
TED1P40533 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.33□□□□□ -0.28
TED1P40533 RSB1YOR049C 1065 nt13.27□□□□□ -0.29
TED1P40533 DEP1YAL013W 1218 nt13.25□□□□□ -0.29
TED1P40533 URN1YPR152C 1398 nt13.24□□□□□ -0.29
TED1P40533 PUT4YOR348C 1884 nt13.22□□□□□ -0.29
TED1P40533 GAR1YHR089C 618 nt13.19□□□□□ -0.3
TED1P40533 OPI9YLR338W 858 nt13.06□□□□□ -0.32
TED1P40533 SAH1YER043C 1350 nt13.01□□□□□ -0.33
TED1P40533 YNL208WYNL208W 600 nt12.99□□□□□ -0.33
TED1P40533 ARE1YCR048W 1833 nt12.97□□□□□ -0.33
TED1P40533 RPN10YHR200W 807 nt12.96□□□□□ -0.33
TED1P40533 PST2YDR032C 597 nt12.95□□□□□ -0.34
TED1P40533 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.78□□□□□ -0.36
TED1P40533 POA1YBR022W 534 nt12.78□□□□□ -0.36
TED1P40533 Q0182Q0182 405 nt12.77□□□□□ -0.37
TED1P40533 TIR1YER011W 765 nt12.74□□□□□ -0.37
TED1P40533 MOT3YMR070W 1473 nt12.67□□□□□ -0.38
TED1P40533 PUN1YLR414C 792 nt12.65□□□□□ -0.38
TED1P40533 SSA1YAL005C 1929 nt12.64□□□□□ -0.39
TED1P40533 YJR018WYJR018W 363 nt12.62□□□□□ -0.39
TED1P40533 YJR120WYJR120W 351 nt12.53□□□□□ -0.4
TED1P40533 PTC2YER089C 1395 nt12.53□□□□□ -0.4
TED1P40533 SRB2YHR041C 633 nt12.52□□□□□ -0.41
TED1P40533 BSC6YOL137W 1494 nt12.52□□□□□ -0.41
TED1P40533 BUD23YCR047C 828 nt12.46□□□□□ -0.41
TED1P40533 SHU1YHL006C 453 nt12.45□□□□□ -0.42
TED1P40533 YKL097CYKL097C 411 nt12.37□□□□□ -0.43
TED1P40533 NAB2YGL122C 1578 nt12.34□□□□□ -0.43
TED1P40533 RPP2BYDR382W 333 nt12.29□□□□□ -0.44
TED1P40533 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.28□□□□□ -0.44
TED1P40533 FIS1YIL065C 468 nt12.23□□□□□ -0.45
TED1P40533 SSA4YER103W 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
TED1P40533 WWM1YFL010C 636 nt12.21□□□□□ -0.45
TED1P40533 DAL1YIR027C 1383 nt12.19□□□□□ -0.46
TED1P40533 SPT5YML010W 3192 nt12.18□□□□□ -0.46
TED1P40533 FPR4YLR449W 1179 nt12.15□□□□□ -0.46
TED1P40533 INM2YDR287W 879 nt12.14□□□□□ -0.47
TED1P40533 BDH2YAL061W 1254 nt12.1□□□□□ -0.47
TED1P40533 PHO4YFR034C 939 nt12.09□□□□□ -0.47
TED1P40533 HOM6YJR139C 1080 nt12.07□□□□□ -0.48
TED1P40533 YGR021WYGR021W 873 nt12.05□□□□□ -0.48
TED1P40533 MNP1YGL068W 585 nt12.04□□□□□ -0.48
TED1P40533 YBL100CYBL100C 315 nt12.04□□□□□ -0.48
TED1P40533 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.96□□□□□ -0.49
TED1P40533 YOR139CYOR139C 393 nt11.96□□□□□ -0.49
TED1P40533 FUN26YAL022C 1554 nt11.92□□□□□ -0.5
TED1P40533 YGR139WYGR139W 339 nt11.92□□□□□ -0.5
TED1P40533 LSM3YLR438C-A 270 nt11.92□□□□□ -0.5
TED1P40533 PAC11YDR488C 1602 nt11.9□□□□□ -0.5
TED1P40533 RKM5YLR137W 1104 nt11.89□□□□□ -0.51
TED1P40533 YPS1YLR120C 1710 nt11.88□□□□□ -0.51
TED1P40533 NVJ2YPR091C 2313 nt11.87□□□□□ -0.51
TED1P40533 TRM9YML014W 840 nt11.85□□□□□ -0.51
TED1P40533 BDF1YLR399C 2061 nt11.82□□□□□ -0.52
TED1P40533 YDR095CYDR095C 411 nt11.8□□□□□ -0.52
TED1P40533 FPS1YLL043W 2010 nt11.78□□□□□ -0.52
TED1P40533 NPL3YDR432W 1245 nt11.77□□□□□ -0.53
TED1P40533 CCT6YDR188W 1641 nt11.77□□□□□ -0.53
TED1P40533 YOL037CYOL037C 354 nt11.75□□□□□ -0.53
TED1P40533 MEP2YNL142W 1500 nt11.74□□□□□ -0.53
TED1P40533 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.7□□□□□ -0.54
TED1P40533 ALF1YNL148C 765 nt11.7□□□□□ -0.54
TED1P40533 TAT1YBR069C 1860 nt11.65□□□□□ -0.54
TED1P40533 DCW1YKL046C 1350 nt11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms