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Protein–RNA interactions for Protein: Q04233
GIS4, Protein GIS4, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
GIS4
Q04233
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
23.2
■■□□□ 1.3
GIS4
Q04233
NSR1
YGR159C
1245 nt
23.06
■■□□□ 1.28
GIS4
Q04233
NOP1
YDL014W
984 nt
22.53
■■□□□ 1.2
GIS4
Q04233
YKL036C
YKL036C
393 nt
20.86
■□□□□ 0.93
GIS4
Q04233
MDJ1
YFL016C
1536 nt
20.48
■□□□□ 0.87
GIS4
Q04233
Q0297
Q0297
156 nt
19.81
■□□□□ 0.76
GIS4
Q04233
SRX1
YKL086W
384 nt
19.75
■□□□□ 0.75
GIS4
Q04233
YJL027C
YJL027C
417 nt
19.46
■□□□□ 0.71
GIS4
Q04233
SCS3
YGL126W
1143 nt
19.04
■□□□□ 0.64
GIS4
Q04233
YCR051W
YCR051W
669 nt
18.7
■□□□□ 0.58
GIS4
Q04233
DBP2
YNL112W
1641 nt
18.19
■□□□□ 0.5
GIS4
Q04233
YOL085C
YOL085C
342 nt
18.11
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GIS4
Q04233
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
17.86
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GIS4
Q04233
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
17.86
■□□□□ 0.45
GIS4
Q04233
PKP1
YIL042C
1185 nt
17.82
■□□□□ 0.44
GIS4
Q04233
RPP1B
YDL130W
321 nt
17.76
■□□□□ 0.43
GIS4
Q04233
CCC1
YLR220W
969 nt
17.63
■□□□□ 0.41
GIS4
Q04233
YBR190W
YBR190W
312 nt
17.42
■□□□□ 0.38
GIS4
Q04233
ATS1
YAL020C
1002 nt
17.03
■□□□□ 0.32
GIS4
Q04233
SCJ1
YMR214W
1134 nt
17.01
■□□□□ 0.31
GIS4
Q04233
PET122
YER153C
765 nt
16.99
■□□□□ 0.31
GIS4
Q04233
RTC3
YHR087W
336 nt
16.98
■□□□□ 0.31
GIS4
Q04233
RVS167
YDR388W
1449 nt
16.96
■□□□□ 0.3
GIS4
Q04233
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
16.9
■□□□□ 0.3
GIS4
Q04233
SCR1
SCR1
522 nt
16.72
■□□□□ 0.27
GIS4
Q04233
RRN5
YLR141W
1092 nt
16.5
■□□□□ 0.23
GIS4
Q04233
SHR5
YOL110W
714 nt
16.43
■□□□□ 0.22
GIS4
Q04233
YDJ1
YNL064C
1230 nt
16.34
■□□□□ 0.21
GIS4
Q04233
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
16.19
■□□□□ 0.18
GIS4
Q04233
RSB1
YOR049C
1065 nt
16.12
■□□□□ 0.17
GIS4
Q04233
DEP1
YAL013W
1218 nt
15.97
■□□□□ 0.15
GIS4
Q04233
GAR1
YHR089C
618 nt
15.96
■□□□□ 0.15
GIS4
Q04233
URN1
YPR152C
1398 nt
15.96
■□□□□ 0.15
GIS4
Q04233
PUT4
YOR348C
1884 nt
15.86
■□□□□ 0.13
GIS4
Q04233
PST2
YDR032C
597 nt
15.8
■□□□□ 0.12
GIS4
Q04233
OPI9
YLR338W
858 nt
15.74
■□□□□ 0.11
GIS4
Q04233
YNL208W
YNL208W
600 nt
15.7
■□□□□ 0.1
GIS4
Q04233
RPN10
YHR200W
807 nt
15.66
■□□□□ 0.1
GIS4
Q04233
SAH1
YER043C
1350 nt
15.63
■□□□□ 0.09
GIS4
Q04233
ARE1
YCR048W
1833 nt
15.58
■□□□□ 0.08
GIS4
Q04233
TIR1
YER011W
765 nt
15.43
■□□□□ 0.06
GIS4
Q04233
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
15.33
■□□□□ 0.04
GIS4
Q04233
POA1
YBR022W
534 nt
15.33
■□□□□ 0.04
GIS4
Q04233
SSA1
YAL005C
1929 nt
15.29
■□□□□ 0.04
GIS4
Q04233
PUN1
YLR414C
792 nt
15.24
■□□□□ 0.03
GIS4
Q04233
YJR018W
YJR018W
363 nt
15.22
■□□□□ 0.03
GIS4
Q04233
SHU1
YHL006C
453 nt
15.15
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GIS4
Q04233
YKL097C
YKL097C
411 nt
15.12
■□□□□ 0.01
GIS4
Q04233
SRB2
YHR041C
633 nt
15.11
■□□□□ 0.01
GIS4
Q04233
YJR120W
YJR120W
351 nt
15.11
■□□□□ 0.01
GIS4
Q04233
PTC2
YER089C
1395 nt
15.08
■□□□□ 0
GIS4
Q04233
BSC6
YOL137W
1494 nt
15
□□□□□ -0.01
GIS4
Q04233
BUD23
YCR047C
828 nt
14.94
□□□□□ -0.02
GIS4
Q04233
YAL037C-B
YAL037C-B
975 nt
14.9
□□□□□ -0.02
GIS4
Q04233
RPP2B
YDR382W
333 nt
14.86
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GIS4
Q04233
NAB2
YGL122C
1578 nt
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□□□□□ -0.03
GIS4
Q04233
WWM1
YFL010C
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□□□□□ -0.04
GIS4
Q04233
SSA3
YBL075C
1950 nt
14.76
□□□□□ -0.05
GIS4
Q04233
FIS1
YIL065C
468 nt
14.72
□□□□□ -0.05
GIS4
Q04233
DAL1
YIR027C
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14.68
□□□□□ -0.06
GIS4
Q04233
INM2
YDR287W
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14.66
□□□□□ -0.06
GIS4
Q04233
HOM6
YJR139C
1080 nt
14.66
□□□□□ -0.06
GIS4
Q04233
YGR021W
YGR021W
873 nt
14.64
□□□□□ -0.07
GIS4
Q04233
BDH2
YAL061W
1254 nt
14.64
□□□□□ -0.07
GIS4
Q04233
MNP1
YGL068W
585 nt
14.6
□□□□□ -0.07
GIS4
Q04233
FPR4
YLR449W
1179 nt
14.6
□□□□□ -0.07
GIS4
Q04233
YOR139C
YOR139C
393 nt
14.6
□□□□□ -0.07
GIS4
Q04233
PHO4
YFR034C
939 nt
14.56
□□□□□ -0.08
GIS4
Q04233
YBL100C
YBL100C
315 nt
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□□□□□ -0.08
GIS4
Q04233
YFL021C-A
YFL021C-A
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□□□□□ -0.09
GIS4
Q04233
LSM3
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□□□□□ -0.1
GIS4
Q04233
RKM5
YLR137W
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□□□□□ -0.1
GIS4
Q04233
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YAL022C
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□□□□□ -0.11
GIS4
Q04233
SPT5
YML010W
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14.37
□□□□□ -0.11
GIS4
Q04233
NPL3
YDR432W
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□□□□□ -0.11
GIS4
Q04233
TRM9
YML014W
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14.32
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GIS4
Q04233
YOL037C
YOL037C
354 nt
14.31
□□□□□ -0.12
GIS4
Q04233
YPS1
YLR120C
1710 nt
14.27
□□□□□ -0.12
GIS4
Q04233
CCT6
YDR188W
1641 nt
14.23
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GIS4
Q04233
YDR095C
YDR095C
411 nt
14.2
□□□□□ -0.14
GIS4
Q04233
ALF1
YNL148C
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14.1
□□□□□ -0.15
GIS4
Q04233
MEP2
YNL142W
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□□□□□ -0.16
GIS4
Q04233
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YHR165W-A
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□□□□□ -0.16
GIS4
Q04233
YLR281C
YLR281C
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14.03
□□□□□ -0.16
GIS4
Q04233
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
IMT4
tM(CAU)E
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□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
SUF2
tP(AGG)C
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
SUF10
tP(AGG)N
72 nt
14.02
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
SIS1
YNL007C
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13.98
□□□□□ -0.17
GIS4
Q04233
WHI5
YOR083W
888 nt
13.97
□□□□□ -0.17
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