RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data11.59□□□□□ -0.55not detected
PRP4YPR178W DSN1P40568 576 aa11.59□□□□□ -0.55
PRP4YPR178W TMA16Q08687 178 aa11.59□□□□□ -0.55
PRP4YPR178W ISW2Q08773 1120 aa11.59□□□□□ -0.55
PRP4YPR178W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRP4YPR178W HSP82P02829 709 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W MPH3P0CE00 602 aa11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CBP3P21560 335 aa11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W YEL043WP32618 956 aa11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W NDC80P40460 691 aa11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W PDC1P06169 563 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RGP1P16664 663 aa11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W EPL1P43572 832 aa11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W YMR102CQ03177 834 aa11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W GYL1Q04322 720 aa11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W LAM4P38800 1345 aa11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data11.56□□□□□ -0.56not detected
PRP4YPR178W PXL1P36166 706 aa11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W REI1P38344 393 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CCT4P39078 528 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W YNL193WP53870 558 aa11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W VPS38Q05919 439 aa11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W ATG13Q06628 738 aa11.56□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RPO26P20435 155 aa11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W SAP190P36123 1033 aa11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W MET1P36150 593 aa11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W ADE17P38009 592 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W MGA2P40578 1113 aa11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data11.54□□□□□ -0.56not detected
PRP4YPR178W ALD3P54114 506 aa11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W UBP16Q02863 499 aa11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W FCP1Q03254 732 aa11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W ARG8P18544 423 aa11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CUE3P53137 624 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W TAH18Q12181 623 aa11.54□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W STO1P34160 861 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W MUD2P36084 527 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W RPN10P38886 268 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W ENP2P48234 707 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRP4YPR178W MSH3P25336 1018 aa11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SAC6P32599 642 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W CCC2P38995 1004 aa11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W EST2Q06163 884 aa11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W OMS1Q06668 471 aa11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W DCS2Q12123 353 aa11.52□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SEC9P40357 651 aa11.51□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W ATG23Q06671 453 aa11.51□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W PHM7Q12252 991 aa11.51□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SEC23P15303 768 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W HCA4P20448 770 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W EFM2P38347 419 aa11.5□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W BUD16P39988 312 aa11.5□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W YOL098CQ12496 1037 aa11.5□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SAC3P46674 1301 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W URA1P28272 314 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W BMH1P29311 267 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SLD2P34252 453 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W BMH2P34730 273 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W RER2P35196 286 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W PTP3P40048 928 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W AFT2Q08957 416 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W ATG9Q12142 997 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W RRI2Q12348 645 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W OSH2Q12451 1283 aa11.49□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W DCD1P06773 312 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W PIF1P07271 859 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W AVT3P36062 692 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W RGD1P38339 666 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W AKR1P39010 764 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W FYV8P46949 817 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W BOP3P53958 396 aa11.48□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data11.48□□□□□ -0.57not detected
PRP4YPR178W ADR1P07248 1323 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W MCM3P24279 971 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W ASF1P32447 279 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W NFU1P32860 256 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W BYE1P36106 594 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W KAR5Q04746 504 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W VAC14Q06708 880 aa11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W GET3Q12154 354 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W SEC65P29478 273 aa11.46□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W YKL133CP36066 463 aa11.46□□□□□ -0.57
PRP4YPR178W IES2P40154 320 aa11.46□□□□□ -0.57
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