RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP4	YPR178W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	CLB5	P30283	435 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	PIB2	P53191	635 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	WAR1	Q03631	944 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	CLB1	P24868	471 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	FYV10	P40492	516 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	BUD6	P41697	788 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	MRS2	Q01926	470 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	RNT1	Q02555	471 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	FBP26	P32604	452 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	YCG1	Q06680	1035 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	TCB1	Q12466	1186 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PRP4	YPR178W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SPT21	P35209	758 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	YGL082W	P53155	381 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	VPS64	Q03944	604 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	YLR407W	Q06070	228 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	OPI1	P21957	404 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	EPS1	P40557	701 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	GIN4	Q12263	1142 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	STE11	P23561	717 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SRC1	Q03707	834 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	PEP3	P27801	918 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	OSW7	P43611	510 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	PET123	P17558	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	MSH1	P25846	959 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	HXT10	P43581	546 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	VPS75	P53853	264 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	ECM23	Q02710	187 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SML1	Q04964	104 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	YLR271W	Q06152	274 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	CTI6	Q08923	506 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	GYP5	Q12344	894 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	VPS41	P38959	992 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	RMT2	Q03305	412 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	MTC5	Q03897	1148 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	TLG2	Q08144	397 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PRP4	YPR178W	SLA1	P32790	1244 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	PSH1	Q12161	406 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	SSP2	Q08646	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	TFC8	Q12308	588 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	CDC15	P27636	974 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	IMP2'	P32351	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	PSY4	P38193	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RTT107	P38850	1070 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	STR2	P47164	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	YGL140C	P53120	1219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	APL4	Q12028	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	THI12	P42883	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	THI5	P43534	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	THI11	P47183	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	PKH1	Q03407	766 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	THI13	Q07748	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	YOL087C	Q99247	1116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	DPB3	P27344	201 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	PCH2	P38126	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	CAJ1	P39101	391 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	ECM1	P39715	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	FAR11	P53917	953 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RBA50	Q04418	439 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	YPR204W	Q08995	1032 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MCM16	Q12262	181 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	RSF2	P46974	1380 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	PHO13	P19881	312 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	DIT2	P21595	489 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MED8	P38304	223 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	YBP2	P53169	641 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	MAL13	P53338	473 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	ALF1	P53904	254 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	AI2	P03876	854 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PRP4	YPR178W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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