Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.74■■□□□ 1.71
SSP2Q08646 NSR1YGR159C 1245 nt25.22■■□□□ 1.63
SSP2Q08646 NOP1YDL014W 984 nt25.15■■□□□ 1.62
SSP2Q08646 YKL036CYKL036C 393 nt23.55■■□□□ 1.36
SSP2Q08646 Q0297Q0297 156 nt22.1■■□□□ 1.13
SSP2Q08646 MDJ1YFL016C 1536 nt22.08■■□□□ 1.13
SSP2Q08646 YJL027CYJL027C 417 nt22.07■■□□□ 1.12
SSP2Q08646 SRX1YKL086W 384 nt21.96■■□□□ 1.11
SSP2Q08646 SCS3YGL126W 1143 nt21.6■■□□□ 1.05
SSP2Q08646 YCR051WYCR051W 669 nt20.91■□□□□ 0.94
SSP2Q08646 YOL085CYOL085C 342 nt20.37■□□□□ 0.85
SSP2Q08646 PKP1YIL042C 1185 nt20.06■□□□□ 0.8
SSP2Q08646 RPP1BYDL130W 321 nt19.85■□□□□ 0.77
SSP2Q08646 DBP2YNL112W 1641 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.63■□□□□ 0.73
SSP2Q08646 SCJ1YMR214W 1134 nt19.55■□□□□ 0.72
SSP2Q08646 CCC1YLR220W 969 nt19.5■□□□□ 0.71
SSP2Q08646 ATS1YAL020C 1002 nt19.42■□□□□ 0.7
SSP2Q08646 PET122YER153C 765 nt18.93■□□□□ 0.62
SSP2Q08646 SCR1SCR1 522 nt18.86■□□□□ 0.61
SSP2Q08646 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SSP2Q08646 YBR190WYBR190W 312 nt18.7■□□□□ 0.58
SSP2Q08646 RVS167YDR388W 1449 nt18.61■□□□□ 0.57
SSP2Q08646 RRN5YLR141W 1092 nt18.43■□□□□ 0.54
SSP2Q08646 RTC3YHR087W 336 nt18.38■□□□□ 0.53
SSP2Q08646 RSB1YOR049C 1065 nt18.19■□□□□ 0.5
SSP2Q08646 YDJ1YNL064C 1230 nt18.07■□□□□ 0.48
SSP2Q08646 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.06■□□□□ 0.48
SSP2Q08646 SHR5YOL110W 714 nt18.02■□□□□ 0.48
SSP2Q08646 PST2YDR032C 597 nt17.9■□□□□ 0.46
SSP2Q08646 GAR1YHR089C 618 nt17.67■□□□□ 0.42
SSP2Q08646 DEP1YAL013W 1218 nt17.43■□□□□ 0.38
SSP2Q08646 YKL097CYKL097C 411 nt17.43■□□□□ 0.38
SSP2Q08646 URN1YPR152C 1398 nt17.3■□□□□ 0.36
SSP2Q08646 YNL208WYNL208W 600 nt17.17■□□□□ 0.34
SSP2Q08646 RPN10YHR200W 807 nt17.15■□□□□ 0.34
SSP2Q08646 SHU1YHL006C 453 nt17.11■□□□□ 0.33
SSP2Q08646 TIR1YER011W 765 nt17.04■□□□□ 0.32
SSP2Q08646 OPI9YLR338W 858 nt16.95■□□□□ 0.3
SSP2Q08646 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.77■□□□□ 0.28
SSP2Q08646 SAH1YER043C 1350 nt16.77■□□□□ 0.27
SSP2Q08646 SSA1YAL005C 1929 nt16.74■□□□□ 0.27
SSP2Q08646 PUT4YOR348C 1884 nt16.67■□□□□ 0.26
SSP2Q08646 YOR139CYOR139C 393 nt16.63■□□□□ 0.25
SSP2Q08646 YJR018WYJR018W 363 nt16.53■□□□□ 0.24
SSP2Q08646 SRB2YHR041C 633 nt16.51■□□□□ 0.23
SSP2Q08646 ARE1YCR048W 1833 nt16.49■□□□□ 0.23
SSP2Q08646 PUN1YLR414C 792 nt16.48■□□□□ 0.23
SSP2Q08646 NPL3YDR432W 1245 nt16.46■□□□□ 0.23
SSP2Q08646 YGR021WYGR021W 873 nt16.37■□□□□ 0.21
SSP2Q08646 WWM1YFL010C 636 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP2Q08646 RPP2BYDR382W 333 nt16.32■□□□□ 0.2
SSP2Q08646 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.32■□□□□ 0.2
SSP2Q08646 MNP1YGL068W 585 nt16.31■□□□□ 0.2
SSP2Q08646 HOM6YJR139C 1080 nt16.31■□□□□ 0.2
SSP2Q08646 YJR120WYJR120W 351 nt16.3■□□□□ 0.2
SSP2Q08646 POA1YBR022W 534 nt16.24■□□□□ 0.19
SSP2Q08646 PTC2YER089C 1395 nt16.23■□□□□ 0.19
SSP2Q08646 YOL037CYOL037C 354 nt16.17■□□□□ 0.18
SSP2Q08646 RKM5YLR137W 1104 nt16.08■□□□□ 0.16
SSP2Q08646 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.07■□□□□ 0.16
SSP2Q08646 BUD23YCR047C 828 nt16.02■□□□□ 0.16
SSP2Q08646 BDH2YAL061W 1254 nt16.02■□□□□ 0.16
SSP2Q08646 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.96■□□□□ 0.15
SSP2Q08646 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.96■□□□□ 0.15
SSP2Q08646 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.96■□□□□ 0.15
SSP2Q08646 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.96■□□□□ 0.15
SSP2Q08646 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.96■□□□□ 0.15
SSP2Q08646 NAB2YGL122C 1578 nt15.95■□□□□ 0.14
SSP2Q08646 SSA3YBL075C 1950 nt15.92■□□□□ 0.14
SSP2Q08646 INM2YDR287W 879 nt15.88■□□□□ 0.13
SSP2Q08646 LSM3YLR438C-A 270 nt15.87■□□□□ 0.13
SSP2Q08646 FPR4YLR449W 1179 nt15.85■□□□□ 0.13
SSP2Q08646 DAL1YIR027C 1383 nt15.81■□□□□ 0.12
SSP2Q08646 YBL100CYBL100C 315 nt15.81■□□□□ 0.12
SSP2Q08646 BSC6YOL137W 1494 nt15.79■□□□□ 0.12
SSP2Q08646 PUS2YGL063W 1113 nt15.76■□□□□ 0.11
SSP2Q08646 YLR281CYLR281C 468 nt15.75■□□□□ 0.11
SSP2Q08646 FIS1YIL065C 468 nt15.74■□□□□ 0.11
SSP2Q08646 TRM9YML014W 840 nt15.68■□□□□ 0.1
SSP2Q08646 WHI5YOR083W 888 nt15.67■□□□□ 0.1
SSP2Q08646 PHO4YFR034C 939 nt15.66■□□□□ 0.1
SSP2Q08646 FUN26YAL022C 1554 nt15.62■□□□□ 0.09
SSP2Q08646 MOT3YMR070W 1473 nt15.49■□□□□ 0.07
SSP2Q08646 CCT6YDR188W 1641 nt15.46■□□□□ 0.06
SSP2Q08646 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.39■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 DSK2YMR276W 1122 nt15.39■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 FMP45YDL222C 930 nt15.37■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 ALF1YNL148C 765 nt15.36■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.34■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.34■□□□□ 0.05
SSP2Q08646 YPR011CYPR011C 981 nt15.34■□□□□ 0.05
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