Protein–RNA interactions for Protein: P53169

YBP2, YAP1-binding protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBP2P53169 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.12■■□□□ 1.77
YBP2P53169 NOP1YDL014W 984 nt25.56■■□□□ 1.68
YBP2P53169 NSR1YGR159C 1245 nt25.54■■□□□ 1.68
YBP2P53169 YKL036CYKL036C 393 nt24.02■■□□□ 1.44
YBP2P53169 Q0297Q0297 156 nt22.53■■□□□ 1.2
YBP2P53169 YJL027CYJL027C 417 nt22.51■■□□□ 1.19
YBP2P53169 SRX1YKL086W 384 nt22.34■■□□□ 1.17
YBP2P53169 MDJ1YFL016C 1536 nt22.26■■□□□ 1.15
YBP2P53169 SCS3YGL126W 1143 nt22.09■■□□□ 1.13
YBP2P53169 YCR051WYCR051W 669 nt21.24■□□□□ 0.99
YBP2P53169 YOL085CYOL085C 342 nt20.79■□□□□ 0.92
YBP2P53169 PKP1YIL042C 1185 nt20.43■□□□□ 0.86
YBP2P53169 RPP1BYDL130W 321 nt20.21■□□□□ 0.83
YBP2P53169 SCJ1YMR214W 1134 nt20.13■□□□□ 0.81
YBP2P53169 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.93■□□□□ 0.78
YBP2P53169 ATS1YAL020C 1002 nt19.89■□□□□ 0.77
YBP2P53169 DBP2YNL112W 1641 nt19.88■□□□□ 0.77
YBP2P53169 CCC1YLR220W 969 nt19.75■□□□□ 0.75
YBP2P53169 PET122YER153C 765 nt19.26■□□□□ 0.67
YBP2P53169 SCR1SCR1 522 nt19.18■□□□□ 0.66
YBP2P53169 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.01■□□□□ 0.63
YBP2P53169 YBR190WYBR190W 312 nt18.85■□□□□ 0.61
YBP2P53169 RVS167YDR388W 1449 nt18.79■□□□□ 0.6
YBP2P53169 RRN5YLR141W 1092 nt18.76■□□□□ 0.59
YBP2P53169 RSB1YOR049C 1065 nt18.51■□□□□ 0.55
YBP2P53169 RTC3YHR087W 336 nt18.47■□□□□ 0.55
YBP2P53169 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.39■□□□□ 0.53
YBP2P53169 YDJ1YNL064C 1230 nt18.38■□□□□ 0.53
YBP2P53169 PST2YDR032C 597 nt18.35■□□□□ 0.53
YBP2P53169 SHR5YOL110W 714 nt18.24■□□□□ 0.51
YBP2P53169 GAR1YHR089C 618 nt17.91■□□□□ 0.46
YBP2P53169 YKL097CYKL097C 411 nt17.86■□□□□ 0.45
YBP2P53169 DEP1YAL013W 1218 nt17.59■□□□□ 0.41
YBP2P53169 SHU1YHL006C 453 nt17.5■□□□□ 0.39
YBP2P53169 URN1YPR152C 1398 nt17.46■□□□□ 0.39
YBP2P53169 YNL208WYNL208W 600 nt17.35■□□□□ 0.37
YBP2P53169 TIR1YER011W 765 nt17.29■□□□□ 0.36
YBP2P53169 RPN10YHR200W 807 nt17.29■□□□□ 0.36
YBP2P53169 OPI9YLR338W 858 nt17.11■□□□□ 0.33
YBP2P53169 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.1■□□□□ 0.33
YBP2P53169 YOR139CYOR139C 393 nt17.07■□□□□ 0.32
YBP2P53169 SSA1YAL005C 1929 nt16.99■□□□□ 0.31
YBP2P53169 SAH1YER043C 1350 nt16.89■□□□□ 0.29
YBP2P53169 NPL3YDR432W 1245 nt16.82■□□□□ 0.28
YBP2P53169 SRB2YHR041C 633 nt16.8■□□□□ 0.28
YBP2P53169 PUT4YOR348C 1884 nt16.76■□□□□ 0.27
YBP2P53169 YJR018WYJR018W 363 nt16.68■□□□□ 0.26
YBP2P53169 YGR021WYGR021W 873 nt16.63■□□□□ 0.25
YBP2P53169 WWM1YFL010C 636 nt16.61■□□□□ 0.25
YBP2P53169 MNP1YGL068W 585 nt16.61■□□□□ 0.25
YBP2P53169 HOM6YJR139C 1080 nt16.61■□□□□ 0.25
YBP2P53169 PUN1YLR414C 792 nt16.61■□□□□ 0.25
YBP2P53169 ARE1YCR048W 1833 nt16.61■□□□□ 0.25
YBP2P53169 YJR120WYJR120W 351 nt16.53■□□□□ 0.24
YBP2P53169 YOL037CYOL037C 354 nt16.5■□□□□ 0.23
YBP2P53169 RPP2BYDR382W 333 nt16.47■□□□□ 0.23
YBP2P53169 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.39■□□□□ 0.21
YBP2P53169 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 RKM5YLR137W 1104 nt16.37■□□□□ 0.21
YBP2P53169 PTC2YER089C 1395 nt16.34■□□□□ 0.21
YBP2P53169 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.32■□□□□ 0.2
YBP2P53169 POA1YBR022W 534 nt16.29■□□□□ 0.2
YBP2P53169 SSA3YBL075C 1950 nt16.23■□□□□ 0.19
YBP2P53169 BDH2YAL061W 1254 nt16.22■□□□□ 0.19
YBP2P53169 LSM3YLR438C-A 270 nt16.1■□□□□ 0.17
YBP2P53169 PUS2YGL063W 1113 nt16.09■□□□□ 0.17
YBP2P53169 YLR281CYLR281C 468 nt16.09■□□□□ 0.17
YBP2P53169 BUD23YCR047C 828 nt16.06■□□□□ 0.16
YBP2P53169 NAB2YGL122C 1578 nt16.05■□□□□ 0.16
YBP2P53169 INM2YDR287W 879 nt16.02■□□□□ 0.16
YBP2P53169 WHI5YOR083W 888 nt15.97■□□□□ 0.15
YBP2P53169 YBL100CYBL100C 315 nt15.95■□□□□ 0.14
YBP2P53169 DAL1YIR027C 1383 nt15.94■□□□□ 0.14
YBP2P53169 FPR4YLR449W 1179 nt15.92■□□□□ 0.14
YBP2P53169 MOT3YMR070W 1473 nt15.91■□□□□ 0.14
YBP2P53169 FIS1YIL065C 468 nt15.87■□□□□ 0.13
YBP2P53169 TRM9YML014W 840 nt15.84■□□□□ 0.13
YBP2P53169 BSC6YOL137W 1494 nt15.84■□□□□ 0.13
YBP2P53169 PHO4YFR034C 939 nt15.78■□□□□ 0.12
YBP2P53169 FUN26YAL022C 1554 nt15.78■□□□□ 0.12
YBP2P53169 YPR011CYPR011C 981 nt15.69■□□□□ 0.1
YBP2P53169 FMP45YDL222C 930 nt15.68■□□□□ 0.1
YBP2P53169 DSK2YMR276W 1122 nt15.68■□□□□ 0.1
YBP2P53169 CCT6YDR188W 1641 nt15.65■□□□□ 0.1
YBP2P53169 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.63■□□□□ 0.09
YBP2P53169 YLR236CYLR236C 324 nt15.62■□□□□ 0.09
YBP2P53169 IMP2'YIL154C 1041 nt15.61■□□□□ 0.09
YBP2P53169 YCH1YGR203W 447 nt15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms