Protein–RNA interactions for Protein: P47183

THI11, 4-amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine phosphate synthase THI11, yeastyeast

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THI11P47183 YML009W-BYML009W-B 477 nt28.51■■■□□ 2.15
THI11P47183 NOP1YDL014W 984 nt27.99■■■□□ 2.07
THI11P47183 NSR1YGR159C 1245 nt27.46■■□□□ 1.99
THI11P47183 YKL036CYKL036C 393 nt26.74■■□□□ 1.87
THI11P47183 YJL027CYJL027C 417 nt25.16■■□□□ 1.62
THI11P47183 SCS3YGL126W 1143 nt24.86■■□□□ 1.57
THI11P47183 Q0297Q0297 156 nt24.85■■□□□ 1.57
THI11P47183 SRX1YKL086W 384 nt24.51■■□□□ 1.51
THI11P47183 MDJ1YFL016C 1536 nt23.61■■□□□ 1.37
THI11P47183 YCR051WYCR051W 669 nt23.36■■□□□ 1.33
THI11P47183 YOL085CYOL085C 342 nt23.17■■□□□ 1.3
THI11P47183 SCJ1YMR214W 1134 nt23.09■■□□□ 1.29
THI11P47183 PKP1YIL042C 1185 nt22.77■■□□□ 1.24
THI11P47183 ATS1YAL020C 1002 nt22.47■■□□□ 1.19
THI11P47183 RPP1BYDL130W 321 nt22.31■■□□□ 1.16
THI11P47183 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.64■■□□□ 1.05
THI11P47183 CCC1YLR220W 969 nt21.47■■□□□ 1.03
THI11P47183 DBP2YNL112W 1641 nt21.26■□□□□ 0.99
THI11P47183 PET122YER153C 765 nt21.25■□□□□ 0.99
THI11P47183 SCR1SCR1 522 nt21.2■□□□□ 0.98
THI11P47183 RTC3YHR087W 336 nt21.06■□□□□ 0.96
THI11P47183 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.78■□□□□ 0.92
THI11P47183 RRN5YLR141W 1092 nt20.73■□□□□ 0.91
THI11P47183 PST2YDR032C 597 nt20.66■□□□□ 0.9
THI11P47183 RSB1YOR049C 1065 nt20.56■□□□□ 0.88
THI11P47183 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.32■□□□□ 0.84
THI11P47183 YKL097CYKL097C 411 nt20.32■□□□□ 0.84
THI11P47183 RVS167YDR388W 1449 nt20.1■□□□□ 0.81
THI11P47183 YDJ1YNL064C 1230 nt20.05■□□□□ 0.8
THI11P47183 YBR190WYBR190W 312 nt19.8■□□□□ 0.76
THI11P47183 SHR5YOL110W 714 nt19.65■□□□□ 0.74
THI11P47183 SHU1YHL006C 453 nt19.64■□□□□ 0.73
THI11P47183 GAR1YHR089C 618 nt19.52■□□□□ 0.72
THI11P47183 YOR139CYOR139C 393 nt19.39■□□□□ 0.69
THI11P47183 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt19.09■□□□□ 0.65
THI11P47183 NPL3YDR432W 1245 nt18.96■□□□□ 0.63
THI11P47183 DEP1YAL013W 1218 nt18.87■□□□□ 0.61
THI11P47183 TIR1YER011W 765 nt18.81■□□□□ 0.6
THI11P47183 YNL208WYNL208W 600 nt18.58■□□□□ 0.56
THI11P47183 URN1YPR152C 1398 nt18.56■□□□□ 0.56
THI11P47183 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt18.55■□□□□ 0.56
THI11P47183 IMT4tM(CAU)E 72 nt18.55■□□□□ 0.56
THI11P47183 IMT3tM(CAU)J3 72 nt18.55■□□□□ 0.56
THI11P47183 IMT1tM(CAU)O1 72 nt18.55■□□□□ 0.56
THI11P47183 IMT2tM(CAU)P 72 nt18.55■□□□□ 0.56
THI11P47183 RPN10YHR200W 807 nt18.45■□□□□ 0.54
THI11P47183 SSA1YAL005C 1929 nt18.43■□□□□ 0.54
THI11P47183 MNP1YGL068W 585 nt18.41■□□□□ 0.54
THI11P47183 SRB2YHR041C 633 nt18.37■□□□□ 0.53
THI11P47183 YOL037CYOL037C 354 nt18.37■□□□□ 0.53
THI11P47183 HOM6YJR139C 1080 nt18.3■□□□□ 0.52
THI11P47183 YGR021WYGR021W 873 nt18.26■□□□□ 0.51
THI11P47183 MOT3YMR070W 1473 nt18.2■□□□□ 0.5
THI11P47183 BSC6YOL137W 1494 nt18.19■□□□□ 0.5
THI11P47183 WWM1YFL010C 636 nt18.17■□□□□ 0.5
THI11P47183 OPI9YLR338W 858 nt18.08■□□□□ 0.48
THI11P47183 PUS2YGL063W 1113 nt18.06■□□□□ 0.48
THI11P47183 RKM5YLR137W 1104 nt18.03■□□□□ 0.48
THI11P47183 YLR281CYLR281C 468 nt17.91■□□□□ 0.46
THI11P47183 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.79■□□□□ 0.44
THI11P47183 SAH1YER043C 1350 nt17.78■□□□□ 0.44
THI11P47183 YJR018WYJR018W 363 nt17.76■□□□□ 0.43
THI11P47183 YJR120WYJR120W 351 nt17.75■□□□□ 0.43
THI11P47183 MRPL8YJL063C 717 nt17.74■□□□□ 0.43
THI11P47183 WHI5YOR083W 888 nt17.72■□□□□ 0.43
THI11P47183 SSA3YBL075C 1950 nt17.62■□□□□ 0.41
THI11P47183 FMP45YDL222C 930 nt17.62■□□□□ 0.41
THI11P47183 UBX6YJL048C 1191 nt17.62■□□□□ 0.41
THI11P47183 RPP2BYDR382W 333 nt17.6■□□□□ 0.41
THI11P47183 YPR011CYPR011C 981 nt17.57■□□□□ 0.4
THI11P47183 PUN1YLR414C 792 nt17.53■□□□□ 0.4
THI11P47183 YCH1YGR203W 447 nt17.47■□□□□ 0.39
THI11P47183 BDH2YAL061W 1254 nt17.44■□□□□ 0.38
THI11P47183 DSK2YMR276W 1122 nt17.44■□□□□ 0.38
THI11P47183 YLR236CYLR236C 324 nt17.43■□□□□ 0.38
THI11P47183 ADO1YJR105W 1023 nt17.42■□□□□ 0.38
THI11P47183 LSM3YLR438C-A 270 nt17.35■□□□□ 0.37
THI11P47183 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt17.31■□□□□ 0.36
THI11P47183 YEL076CYEL076C 651 nt17.31■□□□□ 0.36
THI11P47183 YLR464WYLR464W 651 nt17.31■□□□□ 0.36
THI11P47183 PUT4YOR348C 1884 nt17.31■□□□□ 0.36
THI11P47183 ARE1YCR048W 1833 nt17.3■□□□□ 0.36
THI11P47183 IMP2'YIL154C 1041 nt17.24■□□□□ 0.35
THI11P47183 PTC2YER089C 1395 nt17.21■□□□□ 0.35
THI11P47183 SPP1YPL138C 1062 nt17.17■□□□□ 0.34
THI11P47183 RTG1YOL067C 534 nt17.15■□□□□ 0.34
THI11P47183 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.07■□□□□ 0.32
THI11P47183 LPX1YOR084W 1164 nt17.07■□□□□ 0.32
THI11P47183 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.06■□□□□ 0.32
THI11P47183 SIS1YNL007C 1059 nt17.06■□□□□ 0.32
THI11P47183 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.01■□□□□ 0.31
THI11P47183 YBL100CYBL100C 315 nt16.99■□□□□ 0.31
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