RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naip7Q9JIB3 1402 aa16.86■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.86■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psme1P97371 249 aa16.86■□□□□ 0.29
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc52a2Q9D8F3 450 aa16.85■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa16.85■□□□□ 0.29
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf11Q91VU6 549 aa16.85■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uggt1Q6P5E4 1551 aa16.85■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa16.85■□□□□ 0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PalldQ9ET54 1408 aa16.84■□□□□ 0.29
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep170bQ80U49 1574 aa16.81■□□□□ 0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa16.8■□□□□ 0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DnmbpQ6TXD4 1580 aa16.8■□□□□ 0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IghaA0A0A6YXW6 389 aa16.8■□□□□ 0.28
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif7B7ZNG0 1348 aa16.79■□□□□ 0.28
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.78■□□□□ 0.28
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef28P97433 1693 aa16.77■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa16.76■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa16.76■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.76■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift172Q6VH22 1749 aa16.74■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan21Q07231 555 aa16.74■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk19Q8BWD8 501 aa16.72■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp6Q91WS2 869 aa16.72■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esx1O88933 382 aa16.71■□□□□ 0.27
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ipo9Q91YE6 1041 aa16.69■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InsrP15208 1372 aa16.68■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PplQ9R269 1755 aa16.68■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc27Q3V036 639 aa16.68■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa16.67■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsto1O09131 240 aa16.67■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MaddQ80U28 1577 aa16.67■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abca14E9Q8F8 1683 aa16.67■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ecm2Q5FW85 670 aa16.66■□□□□ 0.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa16.66■□□□□ 0.26
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex14Q7M6U3 1450 aa16.63■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NgefQ8CHT1 710 aa16.62■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa16.61■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChgaP26339 463 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dip2aQ8BWT5 1523 aa16.59■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dip2bQ3UH60 1574 aa16.59■□□□□ 0.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NinlQ6ZQ12 1394 aa16.58■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2rx7Q9Z1M0 595 aa16.58■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kank1E9Q238 1360 aa16.56■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox12Q04890 314 aa16.56■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NeflP08551 543 aa16.55■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurod2Q62414 383 aa16.55■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa16.55■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k19E9Q3S4 1311 aa16.54■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhg1F6S200 1446 aa16.54■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nwd1A6H603 1563 aa16.54■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PzpQ61838 1495 aa16.53■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NktrP30415 1453 aa16.53■□□□□ 0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Birc3O08863 600 aa16.52■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UJC8 639 aa16.51■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4galnt3Q6L8S8 986 aa16.51■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FanciQ8K368 1330 aa16.51■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa16.51■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slit3Q9WVB4 1523 aa16.5■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqcf3Q9D498 203 aa16.5■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga2Q921M4 999 aa16.49■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa16.49■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrxn1Q9CS84 1514 aa16.49■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttll13A4Q9F6 804 aa16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp32F8VPZ3 1604 aa16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GsdmaQ9EST1 446 aa16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif16bB1AVY7 1312 aa16.48■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa16.47■□□□□ 0.23
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Topaz1E5FYH1 1653 aa16.46■□□□□ 0.23
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