Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.5■■■■■ 6.31
Plekhg1F6S200 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
Plekhg1F6S200 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
Plekhg1F6S200 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
Plekhg1F6S200 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
Plekhg1F6S200 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
Plekhg1F6S200 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Plekhg1F6S200 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Plekhg1F6S200 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Plekhg1F6S200 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Plekhg1F6S200 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
Plekhg1F6S200 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Plekhg1F6S200 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Plekhg1F6S200 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Plekhg1F6S200 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Plekhg1F6S200 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Plekhg1F6S200 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.6
Plekhg1F6S200 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Plekhg1F6S200 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Plekhg1F6S200 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Plekhg1F6S200 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Plekhg1F6S200 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Plekhg1F6S200 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
Plekhg1F6S200 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Plekhg1F6S200 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Plekhg1F6S200 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Plekhg1F6S200 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Plekhg1F6S200 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Plekhg1F6S200 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Plekhg1F6S200 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Plekhg1F6S200 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Plekhg1F6S200 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Plekhg1F6S200 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Plekhg1F6S200 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Plekhg1F6S200 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Plekhg1F6S200 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Plekhg1F6S200 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Plekhg1F6S200 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Plekhg1F6S200 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Plekhg1F6S200 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
Plekhg1F6S200 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Plekhg1F6S200 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Plekhg1F6S200 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Plekhg1F6S200 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
Plekhg1F6S200 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Plekhg1F6S200 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Plekhg1F6S200 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Plekhg1F6S200 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Plekhg1F6S200 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Plekhg1F6S200 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Plekhg1F6S200 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Plekhg1F6S200 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Plekhg1F6S200 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Plekhg1F6S200 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Plekhg1F6S200 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Plekhg1F6S200 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Plekhg1F6S200 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Plekhg1F6S200 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Plekhg1F6S200 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Plekhg1F6S200 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Plekhg1F6S200 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Plekhg1F6S200 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Plekhg1F6S200 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Plekhg1F6S200 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Plekhg1F6S200 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Plekhg1F6S200 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Plekhg1F6S200 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Plekhg1F6S200 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Plekhg1F6S200 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Plekhg1F6S200 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Plekhg1F6S200 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Plekhg1F6S200 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Plekhg1F6S200 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Plekhg1F6S200 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Plekhg1F6S200 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Plekhg1F6S200 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Plekhg1F6S200 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Plekhg1F6S200 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Plekhg1F6S200 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Plekhg1F6S200 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Plekhg1F6S200 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Plekhg1F6S200 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Plekhg1F6S200 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Plekhg1F6S200 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Plekhg1F6S200 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Plekhg1F6S200 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Plekhg1F6S200 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Plekhg1F6S200 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Plekhg1F6S200 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Plekhg1F6S200 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Plekhg1F6S200 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Plekhg1F6S200 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Plekhg1F6S200 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Plekhg1F6S200 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Plekhg1F6S200 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Plekhg1F6S200 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Plekhg1F6S200 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms