Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWD8

Cdk19, Cyclin-dependent kinase 19, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk19Q8BWD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.83■■■■■ 6.21
Cdk19Q8BWD8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Cdk19Q8BWD8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Cdk19Q8BWD8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
Cdk19Q8BWD8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
Cdk19Q8BWD8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Cdk19Q8BWD8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Cdk19Q8BWD8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Cdk19Q8BWD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Cdk19Q8BWD8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Cdk19Q8BWD8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Cdk19Q8BWD8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Cdk19Q8BWD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Cdk19Q8BWD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Cdk19Q8BWD8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Cdk19Q8BWD8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
Cdk19Q8BWD8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Cdk19Q8BWD8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Cdk19Q8BWD8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Cdk19Q8BWD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Cdk19Q8BWD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Cdk19Q8BWD8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Cdk19Q8BWD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Cdk19Q8BWD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Cdk19Q8BWD8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cdk19Q8BWD8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Cdk19Q8BWD8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
Cdk19Q8BWD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cdk19Q8BWD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cdk19Q8BWD8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Cdk19Q8BWD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Cdk19Q8BWD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Cdk19Q8BWD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
Cdk19Q8BWD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Cdk19Q8BWD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Cdk19Q8BWD8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Cdk19Q8BWD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Cdk19Q8BWD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Cdk19Q8BWD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cdk19Q8BWD8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cdk19Q8BWD8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cdk19Q8BWD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cdk19Q8BWD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cdk19Q8BWD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Cdk19Q8BWD8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Cdk19Q8BWD8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cdk19Q8BWD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cdk19Q8BWD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cdk19Q8BWD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Cdk19Q8BWD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Cdk19Q8BWD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cdk19Q8BWD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Cdk19Q8BWD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cdk19Q8BWD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cdk19Q8BWD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Cdk19Q8BWD8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cdk19Q8BWD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cdk19Q8BWD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cdk19Q8BWD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Cdk19Q8BWD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Cdk19Q8BWD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cdk19Q8BWD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Cdk19Q8BWD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Cdk19Q8BWD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
Cdk19Q8BWD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cdk19Q8BWD8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cdk19Q8BWD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Cdk19Q8BWD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Cdk19Q8BWD8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Cdk19Q8BWD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cdk19Q8BWD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Cdk19Q8BWD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cdk19Q8BWD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cdk19Q8BWD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Cdk19Q8BWD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Cdk19Q8BWD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Cdk19Q8BWD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Cdk19Q8BWD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cdk19Q8BWD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cdk19Q8BWD8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Cdk19Q8BWD8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Cdk19Q8BWD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cdk19Q8BWD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cdk19Q8BWD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cdk19Q8BWD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Cdk19Q8BWD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Cdk19Q8BWD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Cdk19Q8BWD8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cdk19Q8BWD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cdk19Q8BWD8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Cdk19Q8BWD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cdk19Q8BWD8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cdk19Q8BWD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cdk19Q8BWD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Cdk19Q8BWD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cdk19Q8BWD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cdk19Q8BWD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Cdk19Q8BWD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cdk19Q8BWD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Cdk19Q8BWD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms