Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.89■■■■■ 6.38
Pik3c2bE9QAN8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Pik3c2bE9QAN8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.6
Pik3c2bE9QAN8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.99■■■■■ 5.27
Pik3c2bE9QAN8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
Pik3c2bE9QAN8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
Pik3c2bE9QAN8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Pik3c2bE9QAN8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Pik3c2bE9QAN8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Pik3c2bE9QAN8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Pik3c2bE9QAN8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Pik3c2bE9QAN8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Pik3c2bE9QAN8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Pik3c2bE9QAN8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Pik3c2bE9QAN8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Pik3c2bE9QAN8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Pik3c2bE9QAN8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Pik3c2bE9QAN8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Pik3c2bE9QAN8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Pik3c2bE9QAN8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Pik3c2bE9QAN8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Pik3c2bE9QAN8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Pik3c2bE9QAN8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
Pik3c2bE9QAN8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Pik3c2bE9QAN8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Pik3c2bE9QAN8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Pik3c2bE9QAN8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Pik3c2bE9QAN8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Pik3c2bE9QAN8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Pik3c2bE9QAN8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Pik3c2bE9QAN8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Pik3c2bE9QAN8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Pik3c2bE9QAN8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Pik3c2bE9QAN8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Pik3c2bE9QAN8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Pik3c2bE9QAN8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Pik3c2bE9QAN8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Pik3c2bE9QAN8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Pik3c2bE9QAN8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Pik3c2bE9QAN8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Pik3c2bE9QAN8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Pik3c2bE9QAN8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Pik3c2bE9QAN8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Pik3c2bE9QAN8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.19
Pik3c2bE9QAN8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Pik3c2bE9QAN8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Pik3c2bE9QAN8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pik3c2bE9QAN8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Pik3c2bE9QAN8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Pik3c2bE9QAN8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Pik3c2bE9QAN8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Pik3c2bE9QAN8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Pik3c2bE9QAN8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Pik3c2bE9QAN8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Pik3c2bE9QAN8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pik3c2bE9QAN8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Pik3c2bE9QAN8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Pik3c2bE9QAN8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Pik3c2bE9QAN8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Pik3c2bE9QAN8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Pik3c2bE9QAN8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pik3c2bE9QAN8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Pik3c2bE9QAN8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Pik3c2bE9QAN8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Pik3c2bE9QAN8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Pik3c2bE9QAN8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pik3c2bE9QAN8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pik3c2bE9QAN8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Pik3c2bE9QAN8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Pik3c2bE9QAN8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pik3c2bE9QAN8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Pik3c2bE9QAN8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Pik3c2bE9QAN8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Pik3c2bE9QAN8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Pik3c2bE9QAN8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pik3c2bE9QAN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pik3c2bE9QAN8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Pik3c2bE9QAN8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pik3c2bE9QAN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Pik3c2bE9QAN8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Pik3c2bE9QAN8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pik3c2bE9QAN8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Pik3c2bE9QAN8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Pik3c2bE9QAN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Pik3c2bE9QAN8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Pik3c2bE9QAN8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms