Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.29■■■■■ 6.6
PplQ9R269 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
PplQ9R269 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
PplQ9R269 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
PplQ9R269 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.81■■■■■ 5.4
PplQ9R269 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
PplQ9R269 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
PplQ9R269 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
PplQ9R269 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
PplQ9R269 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
PplQ9R269 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.88■■■■■ 5.09
PplQ9R269 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
PplQ9R269 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PplQ9R269 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
PplQ9R269 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
PplQ9R269 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PplQ9R269 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PplQ9R269 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PplQ9R269 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PplQ9R269 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PplQ9R269 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
PplQ9R269 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
PplQ9R269 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
PplQ9R269 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
PplQ9R269 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PplQ9R269 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
PplQ9R269 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
PplQ9R269 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PplQ9R269 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PplQ9R269 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
PplQ9R269 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PplQ9R269 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PplQ9R269 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PplQ9R269 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PplQ9R269 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
PplQ9R269 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PplQ9R269 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PplQ9R269 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PplQ9R269 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PplQ9R269 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PplQ9R269 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
PplQ9R269 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
PplQ9R269 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PplQ9R269 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PplQ9R269 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PplQ9R269 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PplQ9R269 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
PplQ9R269 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PplQ9R269 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PplQ9R269 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PplQ9R269 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
PplQ9R269 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
PplQ9R269 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PplQ9R269 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
PplQ9R269 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
PplQ9R269 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PplQ9R269 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PplQ9R269 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PplQ9R269 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
PplQ9R269 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PplQ9R269 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PplQ9R269 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PplQ9R269 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PplQ9R269 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PplQ9R269 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PplQ9R269 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PplQ9R269 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PplQ9R269 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PplQ9R269 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PplQ9R269 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PplQ9R269 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PplQ9R269 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PplQ9R269 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PplQ9R269 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PplQ9R269 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PplQ9R269 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PplQ9R269 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PplQ9R269 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PplQ9R269 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PplQ9R269 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PplQ9R269 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PplQ9R269 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PplQ9R269 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PplQ9R269 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PplQ9R269 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PplQ9R269 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PplQ9R269 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PplQ9R269 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PplQ9R269 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PplQ9R269 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PplQ9R269 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PplQ9R269 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PplQ9R269 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PplQ9R269 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PplQ9R269 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PplQ9R269 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
PplQ9R269 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PplQ9R269 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PplQ9R269 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PplQ9R269 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms