Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.25■■■■■ 6.27
NinlQ6ZQ12 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
NinlQ6ZQ12 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NinlQ6ZQ12 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.75■■■■■ 5.24
NinlQ6ZQ12 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
NinlQ6ZQ12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
NinlQ6ZQ12 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NinlQ6ZQ12 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NinlQ6ZQ12 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NinlQ6ZQ12 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
NinlQ6ZQ12 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
NinlQ6ZQ12 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
NinlQ6ZQ12 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
NinlQ6ZQ12 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NinlQ6ZQ12 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
NinlQ6ZQ12 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NinlQ6ZQ12 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
NinlQ6ZQ12 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
NinlQ6ZQ12 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
NinlQ6ZQ12 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NinlQ6ZQ12 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NinlQ6ZQ12 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NinlQ6ZQ12 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
NinlQ6ZQ12 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NinlQ6ZQ12 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NinlQ6ZQ12 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
NinlQ6ZQ12 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NinlQ6ZQ12 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NinlQ6ZQ12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
NinlQ6ZQ12 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NinlQ6ZQ12 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NinlQ6ZQ12 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NinlQ6ZQ12 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
NinlQ6ZQ12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NinlQ6ZQ12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NinlQ6ZQ12 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NinlQ6ZQ12 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
NinlQ6ZQ12 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NinlQ6ZQ12 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NinlQ6ZQ12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NinlQ6ZQ12 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NinlQ6ZQ12 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NinlQ6ZQ12 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NinlQ6ZQ12 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
NinlQ6ZQ12 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NinlQ6ZQ12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NinlQ6ZQ12 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NinlQ6ZQ12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NinlQ6ZQ12 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NinlQ6ZQ12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NinlQ6ZQ12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NinlQ6ZQ12 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NinlQ6ZQ12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NinlQ6ZQ12 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NinlQ6ZQ12 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
NinlQ6ZQ12 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NinlQ6ZQ12 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NinlQ6ZQ12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NinlQ6ZQ12 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NinlQ6ZQ12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NinlQ6ZQ12 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NinlQ6ZQ12 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NinlQ6ZQ12 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NinlQ6ZQ12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NinlQ6ZQ12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
NinlQ6ZQ12 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NinlQ6ZQ12 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NinlQ6ZQ12 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NinlQ6ZQ12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NinlQ6ZQ12 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NinlQ6ZQ12 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NinlQ6ZQ12 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NinlQ6ZQ12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms