Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.88■■■■■ 6.7
Itsn1Q9Z0R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
Itsn1Q9Z0R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
Itsn1Q9Z0R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.75■■■■■ 5.55
Itsn1Q9Z0R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.27■■■■■ 5.48
Itsn1Q9Z0R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.35■■■■■ 5.33
Itsn1Q9Z0R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Itsn1Q9Z0R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Itsn1Q9Z0R4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
Itsn1Q9Z0R4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Itsn1Q9Z0R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
Itsn1Q9Z0R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
Itsn1Q9Z0R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Itsn1Q9Z0R4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Itsn1Q9Z0R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Itsn1Q9Z0R4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Itsn1Q9Z0R4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Itsn1Q9Z0R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Itsn1Q9Z0R4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Itsn1Q9Z0R4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Itsn1Q9Z0R4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Itsn1Q9Z0R4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Itsn1Q9Z0R4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Itsn1Q9Z0R4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
Itsn1Q9Z0R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Itsn1Q9Z0R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Itsn1Q9Z0R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Itsn1Q9Z0R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Itsn1Q9Z0R4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Itsn1Q9Z0R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Itsn1Q9Z0R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Itsn1Q9Z0R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Itsn1Q9Z0R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Itsn1Q9Z0R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Itsn1Q9Z0R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
Itsn1Q9Z0R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Itsn1Q9Z0R4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Itsn1Q9Z0R4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Itsn1Q9Z0R4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Itsn1Q9Z0R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Itsn1Q9Z0R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Itsn1Q9Z0R4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
Itsn1Q9Z0R4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Itsn1Q9Z0R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Itsn1Q9Z0R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Itsn1Q9Z0R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Itsn1Q9Z0R4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Itsn1Q9Z0R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Itsn1Q9Z0R4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Itsn1Q9Z0R4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Itsn1Q9Z0R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Itsn1Q9Z0R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
Itsn1Q9Z0R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Itsn1Q9Z0R4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Itsn1Q9Z0R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Itsn1Q9Z0R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Itsn1Q9Z0R4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Itsn1Q9Z0R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Itsn1Q9Z0R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Itsn1Q9Z0R4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Itsn1Q9Z0R4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Itsn1Q9Z0R4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Itsn1Q9Z0R4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Itsn1Q9Z0R4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Itsn1Q9Z0R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Itsn1Q9Z0R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Itsn1Q9Z0R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Itsn1Q9Z0R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Itsn1Q9Z0R4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Itsn1Q9Z0R4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Itsn1Q9Z0R4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Itsn1Q9Z0R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
Itsn1Q9Z0R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Itsn1Q9Z0R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Itsn1Q9Z0R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Itsn1Q9Z0R4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Itsn1Q9Z0R4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Itsn1Q9Z0R4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Itsn1Q9Z0R4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Itsn1Q9Z0R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Itsn1Q9Z0R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Itsn1Q9Z0R4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Itsn1Q9Z0R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Itsn1Q9Z0R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Itsn1Q9Z0R4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Itsn1Q9Z0R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Itsn1Q9Z0R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Itsn1Q9Z0R4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Itsn1Q9Z0R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Itsn1Q9Z0R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Itsn1Q9Z0R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Itsn1Q9Z0R4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Itsn1Q9Z0R4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Itsn1Q9Z0R4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Itsn1Q9Z0R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Itsn1Q9Z0R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Itsn1Q9Z0R4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Itsn1Q9Z0R4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Itsn1Q9Z0R4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Itsn1Q9Z0R4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms