RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	SPP41	P38904	1435 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SNT2	P53127	1403 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	IRA2	P19158	3079 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	FYV5	P25585	152 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SRL3	P36167	246 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YNL019C	P53975	284 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	IRA1	P18963	3092 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	DNF1	P32660	1571 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	BNI1	P41832	1953 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	SCC2	Q04002	1493 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	CSF1	Q12150	2958 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	PHB1	P40961	287 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YGR201C	P42936	225 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	COA4	Q05809	96 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RSM27	YGR215W	TSC11	P40061	1430 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	TRM732	Q03496	1420 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YSP2	Q06681	1438 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	CDC25	P04821	1589 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	BPT1	P14772	1559 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	IRC20	Q06554	1556 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	NMT1	P14743	455 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	HUT1	Q12520	339 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	VPS15	P22219	1454 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	NUP159	P40477	1460 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	MMS22	Q06164	1454 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SSN2	P38931	1420 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PDR11	P40550	1411 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	HIR3	P47171	1648 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SOM1	Q05676	74 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	FIT3	Q08907	204 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	COA6	Q3E846	104 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PET20	Q99373	253 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YOR1	P53049	1477 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	IQG1	Q12280	1495 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	MEC1	P38111	2368 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	LYS2	P07702	1392 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	KRE5	P22023	1365 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RSF2	P46974	1380 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SSK2	P53599	1579 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SIN3	P22579	1536 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	STU1	P38198	1513 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	FIG1	P38224	298 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YOR385W	Q08909	290 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SRB8	P25648	1427 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SMC4	Q12267	1418 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PDR12	Q02785	1511 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	GDB1	Q06625	1536 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	POL1	P13382	1468 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	MYO4	P32492	1471 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	FUN14	P18411	198 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YBR013C	P38215	129 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	MIC27	P50945	234 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	CAT8	P39113	1433 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	ATG2	P53855	1592 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	NUP170	P38181	1502 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SFT2	P38166	215 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	PDR10	P51533	1564 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	EMC4	P53073	190 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RKR1	Q04781	1562 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	NAT5	Q08689	176 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	VTH1	P40438	1549 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	VTH2	P40890	1549 aa		0.17	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.8 ms