RNA–Protein interactions for RNA: YJL212C

OPT1, Transcript of Proton-coupled oligopeptide transporter of the plasma membrane, yeast

Gene OPT1, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OPT1	YJL212C	MRPS28	P21771	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YHL044W	P38727	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	IRC22	P40006	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	SNF4	P12904	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	PRR2	Q12310	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YCR043C	P25361	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	TIM8	P57744	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	DGA1	Q08650	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	INP1	Q03694	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YPS3	Q12303	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	JID1	Q12350	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ATG5	Q12380	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ATG22	P25568	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	CSH1	P38287	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	LDB16	P25587	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ERG2	P32352	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	TVP38	P36164	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	PHO89	P38361	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPA43	P46669	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YGL101W	P53144	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	PLP1	Q04004	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	MRX8	Q05473	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	TIM17	P39515	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	GLC8	P41818	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	APS3	P47064	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	DID2	P69771	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	GCN2	P15442	1659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	NUP192	P47054	1683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YJR015W	P47090	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	NDD1	Q08887	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	ORM1	P53224	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	PEX34	P25584	144 aa		4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	MSA2	P36157	363 aa		4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	YJL028W	P47062	111 aa		4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
OPT1	YJL212C	CDC8	P00572	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	SDH3	P33421	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	EFM1	P38732	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	RMD6	P39975	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	AVT6	P40074	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	ILM1	P47155	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YGL262W	P53054	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	PGA1	P53896	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	UBC7	Q02159	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	HRD1	Q08109	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YBR285W	P38354	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YER189W	P40104	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	SDT1	P53078	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	GAS3	Q03655	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	PDR18	P53756	1333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	LPP1	Q04396	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	ECM19	Q06011	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	ZRT3	P34240	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YEA4	P40004	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	APQ12	P40532	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	API2	Q04413	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	SPO13	P23624	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	RAV2	Q03956	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPT1	YJL212C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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