Protein–RNA interactions for Protein: Q12404

MPD1, Protein disulfide-isomerase MPD1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MPD1Q12404 NSR1YGR159C 1245 nt17.28■□□□□ 0.36
MPD1Q12404 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.27■□□□□ 0.36
MPD1Q12404 NOP1YDL014W 984 nt16.69■□□□□ 0.26
MPD1Q12404 MDJ1YFL016C 1536 nt15.53■□□□□ 0.08
MPD1Q12404 YKL036CYKL036C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
MPD1Q12404 SRX1YKL086W 384 nt14.61□□□□□ -0.07
MPD1Q12404 Q0297Q0297 156 nt14.59□□□□□ -0.07
MPD1Q12404 YJL027CYJL027C 417 nt14.3□□□□□ -0.12
MPD1Q12404 YCR051WYCR051W 669 nt13.84□□□□□ -0.19
MPD1Q12404 SCS3YGL126W 1143 nt13.84□□□□□ -0.19
MPD1Q12404 DBP2YNL112W 1641 nt13.68□□□□□ -0.22
MPD1Q12404 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.32□□□□□ -0.28
MPD1Q12404 YOL085CYOL085C 342 nt13.26□□□□□ -0.29
MPD1Q12404 YBR190WYBR190W 312 nt13.25□□□□□ -0.29
MPD1Q12404 CCC1YLR220W 969 nt13.17□□□□□ -0.3
MPD1Q12404 RPP1BYDL130W 321 nt13.09□□□□□ -0.31
MPD1Q12404 PKP1YIL042C 1185 nt13.08□□□□□ -0.32
MPD1Q12404 RTC3YHR087W 336 nt12.94□□□□□ -0.34
MPD1Q12404 RVS167YDR388W 1449 nt12.78□□□□□ -0.36
MPD1Q12404 SCJ1YMR214W 1134 nt12.75□□□□□ -0.37
MPD1Q12404 PET122YER153C 765 nt12.55□□□□□ -0.4
MPD1Q12404 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.54□□□□□ -0.4
MPD1Q12404 ATS1YAL020C 1002 nt12.32□□□□□ -0.44
MPD1Q12404 SCR1SCR1 522 nt12.32□□□□□ -0.44
MPD1Q12404 SHR5YOL110W 714 nt12.32□□□□□ -0.44
MPD1Q12404 PUT4YOR348C 1884 nt12.17□□□□□ -0.46
MPD1Q12404 RRN5YLR141W 1092 nt12.16□□□□□ -0.46
MPD1Q12404 YDJ1YNL064C 1230 nt12.13□□□□□ -0.47
MPD1Q12404 URN1YPR152C 1398 nt12.08□□□□□ -0.48
MPD1Q12404 DEP1YAL013W 1218 nt12.04□□□□□ -0.48
MPD1Q12404 OPI9YLR338W 858 nt11.93□□□□□ -0.5
MPD1Q12404 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.92□□□□□ -0.5
MPD1Q12404 SAH1YER043C 1350 nt11.91□□□□□ -0.5
MPD1Q12404 ARE1YCR048W 1833 nt11.9□□□□□ -0.5
MPD1Q12404 GAR1YHR089C 618 nt11.89□□□□□ -0.51
MPD1Q12404 SSA3YBL075C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
MPD1Q12404 RSB1YOR049C 1065 nt11.86□□□□□ -0.51
MPD1Q12404 RPN10YHR200W 807 nt11.83□□□□□ -0.52
MPD1Q12404 YNL208WYNL208W 600 nt11.81□□□□□ -0.52
MPD1Q12404 POA1YBR022W 534 nt11.78□□□□□ -0.52
MPD1Q12404 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.76□□□□□ -0.53
MPD1Q12404 PUN1YLR414C 792 nt11.57□□□□□ -0.56
MPD1Q12404 BSC6YOL137W 1494 nt11.57□□□□□ -0.56
MPD1Q12404 YJR018WYJR018W 363 nt11.5□□□□□ -0.57
MPD1Q12404 TIR1YER011W 765 nt11.49□□□□□ -0.57
MPD1Q12404 PTC2YER089C 1395 nt11.47□□□□□ -0.57
MPD1Q12404 BUD23YCR047C 828 nt11.46□□□□□ -0.57
MPD1Q12404 PST2YDR032C 597 nt11.45□□□□□ -0.58
MPD1Q12404 SSA1YAL005C 1929 nt11.4□□□□□ -0.58
MPD1Q12404 YJR120WYJR120W 351 nt11.35□□□□□ -0.59
MPD1Q12404 NAB2YGL122C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
MPD1Q12404 SRB2YHR041C 633 nt11.23□□□□□ -0.61
MPD1Q12404 RPP2BYDR382W 333 nt11.21□□□□□ -0.61
MPD1Q12404 FIS1YIL065C 468 nt11.2□□□□□ -0.62
MPD1Q12404 DAL1YIR027C 1383 nt11.16□□□□□ -0.62
MPD1Q12404 FPR4YLR449W 1179 nt11.13□□□□□ -0.63
MPD1Q12404 SPT5YML010W 3192 nt11.12□□□□□ -0.63
MPD1Q12404 INM2YDR287W 879 nt11.1□□□□□ -0.63
MPD1Q12404 PHO4YFR034C 939 nt11.07□□□□□ -0.64
MPD1Q12404 SHU1YHL006C 453 nt11.03□□□□□ -0.64
MPD1Q12404 YBL100CYBL100C 315 nt10.99□□□□□ -0.65
MPD1Q12404 WWM1YFL010C 636 nt10.98□□□□□ -0.65
MPD1Q12404 BDH2YAL061W 1254 nt10.98□□□□□ -0.65
MPD1Q12404 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.92□□□□□ -0.66
MPD1Q12404 YKL097CYKL097C 411 nt10.9□□□□□ -0.66
MPD1Q12404 YPS1YLR120C 1710 nt10.89□□□□□ -0.67
MPD1Q12404 MEP2YNL142W 1500 nt10.86□□□□□ -0.67
MPD1Q12404 FUN26YAL022C 1554 nt10.86□□□□□ -0.67
MPD1Q12404 YGR021WYGR021W 873 nt10.84□□□□□ -0.67
MPD1Q12404 YDR095CYDR095C 411 nt10.82□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 HOM6YJR139C 1080 nt10.82□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 LSM3YLR438C-A 270 nt10.8□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 SSA4YER103W 1929 nt10.78□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.78□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.78□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 TRM9YML014W 840 nt10.78□□□□□ -0.68
MPD1Q12404 MNP1YGL068W 585 nt10.76□□□□□ -0.69
MPD1Q12404 DCW1YKL046C 1350 nt10.71□□□□□ -0.69
MPD1Q12404 ALF1YNL148C 765 nt10.71□□□□□ -0.69
MPD1Q12404 CCT6YDR188W 1641 nt10.7□□□□□ -0.7
MPD1Q12404 RKM5YLR137W 1104 nt10.65□□□□□ -0.7
MPD1Q12404 PTP1YDL230W 1008 nt10.61□□□□□ -0.71
MPD1Q12404 RPP2AYOL039W 321 nt10.6□□□□□ -0.71
MPD1Q12404 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.59□□□□□ -0.71
MPD1Q12404 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.59□□□□□ -0.71
MPD1Q12404 SIS1YNL007C 1059 nt10.57□□□□□ -0.72
MPD1Q12404 EMI2YDR516C 1503 nt10.55□□□□□ -0.72
MPD1Q12404 CAC2YML102W 1407 nt10.54□□□□□ -0.72
MPD1Q12404 YOR139CYOR139C 393 nt10.53□□□□□ -0.72
MPD1Q12404 YOL037CYOL037C 354 nt10.49□□□□□ -0.73
MPD1Q12404 YDL221WYDL221W 552 nt10.47□□□□□ -0.73
MPD1Q12404 YMR090WYMR090W 684 nt10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms