RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	SIT4	P20604	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	RAD24	P32641	659 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	EAF6	P47128	113 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	MSN5	P52918	1224 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	UBP16	Q02863	499 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	MTC5	Q03897	1148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	CSI1	Q04368	295 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	BDF2	Q07442	638 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	YGR122W	P53272	402 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	ERO1	Q03103	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	CTI6	Q08923	506 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CIN4	YMR138W	UBP12	P39538	1254 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	PRY3	P47033	881 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	ITC1	P53125	1264 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	KIN4	Q01919	800 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	DAL5	P15365	543 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	FCP1	Q03254	732 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	PKH1	Q03407	766 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	SWC3	P31376	625 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	CWH41	P53008	833 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	POL32	P47110	350 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	IRC3	Q06683	689 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	PSH1	Q12161	406 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	ADR1	P07248	1323 aa		7.27	□□□□□ -1.24
CIN4	YMR138W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	DPH6	Q12429	685 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	ICP55	P40051	511 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	HXT10	P43581	546 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SPO1	P53541	631 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	GRX6	Q12438	231 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	FIG2	P25653	1609 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	PMD1	P32634	1753 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	KRE2	P27809	442 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SHC1	P39000	512 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SAS4	Q04003	481 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	UBX2	Q04228	584 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SPL2	P38839	148 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	GYP5	Q12344	894 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	POM152	P39685	1337 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	MGM1	P32266	881 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	YKU70	P32807	602 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	FPK1	P53739	893 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CIN4	YMR138W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	THI3	Q07471	609 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	HKR1	P41809	1802 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	CDC16	P09798	840 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	SET4	P42948	560 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	DPL1	Q05567	589 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	ATG20	Q07528	640 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	PIF1	P07271	859 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	YGL242C	P53066	181 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	SRC1	Q03707	834 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	PSF3	Q12146	194 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	NCB2	Q92317	146 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	AI2	P03876	854 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	IRC4	Q03036	179 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	GAS5	Q08193	484 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	YLR278C	Q05854	1341 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	NPL4	P33755	580 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	MLC1	P53141	149 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CIN4	YMR138W	EPS1	P40557	701 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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