RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	SPR28	Q04921	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	APC11	Q12157	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	SUV3	P32580	737 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	PET112	P33893	541 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	ISU2	Q12056	156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	MNN1	P39106	762 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	DAK2	P43550	591 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	TUB4	P53378	473 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	PTC4	P38089	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	ALR1	Q08269	859 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBP12	YJL197W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	SET4	P42948	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NUD1	P32336	851 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	SAM37	P50110	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CYC8	P14922	966 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PEP7	P32609	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	UBP12	P39538	1254 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
UBP12	YJL197W	OXR1	Q08952	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	TAT2	P38967	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	YJR142W	P47173	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	ERF2	Q06551	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CDC55	Q00362	526 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PPM2	Q08282	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NPL4	P33755	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CWC24	P53769	259 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	AGE1	Q04412	482 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
UBP12	YJL197W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	JIP4	Q03361	876 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CYT1	P07143	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NUP82	P40368	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	NTH2	P35172	780 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	YBR197C	P38306	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	YNL011C	P53980	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	MPC54	Q08550	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	RAD2	P07276	1031 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	MRC1	P25588	1096 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	IXR1	P33417	597 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PAF1	P38351	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	HUL5	P53119	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PHO8	P11491	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	ISC10	P32645	267 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	RAM1	P22007	431 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	HDA3	Q06623	655 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	BDS1	Q08347	646 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	MCD1	Q12158	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	VAC17	P25591	423 aa		4.71	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
UBP12	YJL197W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	TPD3	P31383	635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	GRX7	P38068	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
UBP12	YJL197W	MTO1	P53070	669 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	CAB1	Q04430	367 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	CDC34	P14682	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	RAD4	P14736	754 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	DPB3	P27344	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	SMC1	P32908	1225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	KXD1	P53158	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	RPB10	P22139	70 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	RSC4	Q02206	625 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	MRPS18	P42847	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	TIM54	P47045	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	YGR053C	P53234	283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	YEN1	P40028	759 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	ITC1	P53125	1264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBP12	YJL197W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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