RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	TFA1	P36100	482 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SPS100	YHR139C	BOI2	P39969	1040 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SPS100	YHR139C	MSN5	P52918	1224 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SPS100	YHR139C	FCP1	Q03254	732 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SPS100	YHR139C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SPS100	YHR139C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	BDF2	Q07442	638 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	EAF6	P47128	113 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	ITC1	P53125	1264 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	UBP12	P39538	1254 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	POL32	P47110	350 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	YKL222C	P35995	705 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	PFF1	P38244	976 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	IRC3	Q06683	689 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	PSH1	Q12161	406 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	ERT1	P38140	529 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	CWH41	P53008	833 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	SPO1	P53541	631 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SPS100	YHR139C	PMD1	P32634	1753 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	CTT1	P06115	562 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	MTC5	Q03897	1148 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SIT4	P20604	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	HXT10	P43581	546 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	UBP16	Q02863	499 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SAC3	P46674	1301 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	KIN4	Q01919	800 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	ERO1	Q03103	563 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SAS4	Q04003	481 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPS100	YHR139C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	DPH6	Q12429	685 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	ICP55	P40051	511 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	THI3	Q07471	609 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	GRX6	Q12438	231 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	NCB2	Q92317	146 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	MGM1	P32266	881 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	SLA1	P32790	1244 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	GYP5	Q12344	894 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SPS100	YHR139C	YKU70	P32807	602 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SRC1	Q03707	834 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	ADR1	P07248	1323 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	KRE2	P27809	442 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	BDP1	P46678	594 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	TOP1	P04786	769 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SPL2	P38839	148 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	HKR1	P41809	1802 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	AI2	P03876	854 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	UBX2	Q04228	584 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	POM152	P39685	1337 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SHC1	P39000	512 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	YGL242C	P53066	181 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	SET4	P42948	560 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	YNL193W	P53870	558 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	NKP2	Q06162	153 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	RRI2	Q12348	645 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SPS100	YHR139C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	PDR18	P53756	1333 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	MLC1	P53141	149 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	IRC4	Q03036	179 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	DPL1	Q05567	589 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	CDC16	P09798	840 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	FPK1	P53739	893 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	ATG20	Q07528	640 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	FIG2	P25653	1609 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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