RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	HRT1	Q08273	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ORT1	Q12375	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CPR2	P23285	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	PMT2	P31382	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SNC2	P33328	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	DLS1	P40366	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YIL060W	P40519	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	OTU1	P43558	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	CAF16	P43569	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MCM22	P47167	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YGR045C	P53229	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YNR014W	P53719	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YFT2	Q06676	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	THI73	Q07904	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	ENB1	Q08299	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	RDR1	Q08904	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	SET6	Q12529	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS1	YPL212C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MSW1	P04803	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	IFM1	P25038	676 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PPZ2	P33329	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PUS1	YPL212C	YKL097C	P34245	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ECM31	P38122	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YPC1	P38298	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YJL193W	P39542	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BUL1	P48524	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BXI1	P48558	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YGL159W	P53110	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BUD25	P85052	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SRL2	Q12020	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MCP1	Q12106	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YRM1	Q12340	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NAM2	P11325	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SEC22	P22214	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CPR4	P25334	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ERG4	P25340	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PET18	P25362	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	COQ2	P32378	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	KAE1	P36132	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YHR180W	P38868	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YIR035C	P40579	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MOG1	P47123	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YLR460C	P54007	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ODC1	Q03028	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YML018C	Q03730	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	EKI1	Q03764	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CAC2	Q04199	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NNT1	Q05874	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	DXO1	Q06349	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BSC6	Q08280	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RLM1	Q12224	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	TFC7	Q12415	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PET20	Q99373	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CTA1	P15202	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	STE18	P18852	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPD3	P32561	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YKL107W	P34251	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	FLO10	P36170	1169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SHG1	P38337	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CHS7	P38843	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	LNP1	P38878	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PGD1	P40356	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	EMC5	P40540	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NAS2	P40555	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SHR5	P41912	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YHC3	P47040	408 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PMT3	P47190	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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