Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.95■□□□□ 0.78
RTK1Q12100 NOP1YDL014W 984 nt19.67■□□□□ 0.74
RTK1Q12100 NSR1YGR159C 1245 nt19.48■□□□□ 0.71
RTK1Q12100 YKL036CYKL036C 393 nt18.54■□□□□ 0.56
RTK1Q12100 YJL027CYJL027C 417 nt17.37■□□□□ 0.37
RTK1Q12100 Q0297Q0297 156 nt17.35■□□□□ 0.37
RTK1Q12100 SRX1YKL086W 384 nt17.15■□□□□ 0.34
RTK1Q12100 SCS3YGL126W 1143 nt17.08■□□□□ 0.32
RTK1Q12100 MDJ1YFL016C 1536 nt16.77■□□□□ 0.28
RTK1Q12100 YCR051WYCR051W 669 nt16.27■□□□□ 0.2
RTK1Q12100 YOL085CYOL085C 342 nt16.02■□□□□ 0.16
RTK1Q12100 SCJ1YMR214W 1134 nt15.81■□□□□ 0.12
RTK1Q12100 PKP1YIL042C 1185 nt15.66■□□□□ 0.1
RTK1Q12100 RPP1BYDL130W 321 nt15.55■□□□□ 0.08
RTK1Q12100 ATS1YAL020C 1002 nt15.42■□□□□ 0.06
RTK1Q12100 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.22■□□□□ 0.03
RTK1Q12100 DBP2YNL112W 1641 nt15.03■□□□□ -0
RTK1Q12100 CCC1YLR220W 969 nt15.01□□□□□ -0.01
RTK1Q12100 SCR1SCR1 522 nt14.8□□□□□ -0.04
RTK1Q12100 PET122YER153C 765 nt14.76□□□□□ -0.05
RTK1Q12100 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.54□□□□□ -0.08
RTK1Q12100 RRN5YLR141W 1092 nt14.38□□□□□ -0.11
RTK1Q12100 RVS167YDR388W 1449 nt14.33□□□□□ -0.11
RTK1Q12100 RTC3YHR087W 336 nt14.28□□□□□ -0.12
RTK1Q12100 YBR190WYBR190W 312 nt14.25□□□□□ -0.13
RTK1Q12100 RSB1YOR049C 1065 nt14.24□□□□□ -0.13
RTK1Q12100 PST2YDR032C 597 nt14.2□□□□□ -0.14
RTK1Q12100 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.11□□□□□ -0.15
RTK1Q12100 YDJ1YNL064C 1230 nt14.11□□□□□ -0.15
RTK1Q12100 SHR5YOL110W 714 nt13.93□□□□□ -0.18
RTK1Q12100 YKL097CYKL097C 411 nt13.9□□□□□ -0.18
RTK1Q12100 GAR1YHR089C 618 nt13.65□□□□□ -0.22
RTK1Q12100 SHU1YHL006C 453 nt13.48□□□□□ -0.25
RTK1Q12100 DEP1YAL013W 1218 nt13.28□□□□□ -0.28
RTK1Q12100 YNL208WYNL208W 600 nt13.21□□□□□ -0.29
RTK1Q12100 YOR139CYOR139C 393 nt13.21□□□□□ -0.29
RTK1Q12100 URN1YPR152C 1398 nt13.2□□□□□ -0.3
RTK1Q12100 TIR1YER011W 765 nt13.2□□□□□ -0.3
RTK1Q12100 RPN10YHR200W 807 nt13.2□□□□□ -0.3
RTK1Q12100 SSA3YBL075C 1950 nt13.19□□□□□ -0.3
RTK1Q12100 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.08□□□□□ -0.32
RTK1Q12100 NPL3YDR432W 1245 nt13.04□□□□□ -0.32
RTK1Q12100 OPI9YLR338W 858 nt12.95□□□□□ -0.34
RTK1Q12100 SSA1YAL005C 1929 nt12.91□□□□□ -0.34
RTK1Q12100 Q0182Q0182 405 nt12.88□□□□□ -0.35
RTK1Q12100 YGR021WYGR021W 873 nt12.82□□□□□ -0.36
RTK1Q12100 YOL037CYOL037C 354 nt12.79□□□□□ -0.36
RTK1Q12100 PUT4YOR348C 1884 nt12.77□□□□□ -0.37
RTK1Q12100 HOM6YJR139C 1080 nt12.75□□□□□ -0.37
RTK1Q12100 SRB2YHR041C 633 nt12.73□□□□□ -0.37
RTK1Q12100 MNP1YGL068W 585 nt12.71□□□□□ -0.37
RTK1Q12100 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 WWM1YFL010C 636 nt12.66□□□□□ -0.38
RTK1Q12100 YJR018WYJR018W 363 nt12.64□□□□□ -0.39
RTK1Q12100 PUN1YLR414C 792 nt12.61□□□□□ -0.39
RTK1Q12100 RKM5YLR137W 1104 nt12.57□□□□□ -0.4
RTK1Q12100 RPP2BYDR382W 333 nt12.56□□□□□ -0.4
RTK1Q12100 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.52□□□□□ -0.41
RTK1Q12100 YJR120WYJR120W 351 nt12.51□□□□□ -0.41
RTK1Q12100 MOT3YMR070W 1473 nt12.51□□□□□ -0.41
RTK1Q12100 ARE1YCR048W 1833 nt12.44□□□□□ -0.42
RTK1Q12100 YLR281CYLR281C 468 nt12.41□□□□□ -0.42
RTK1Q12100 PUS2YGL063W 1113 nt12.4□□□□□ -0.42
RTK1Q12100 BDH2YAL061W 1254 nt12.36□□□□□ -0.43
RTK1Q12100 LSM3YLR438C-A 270 nt12.32□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 POA1YBR022W 534 nt12.32□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 PTC2YER089C 1395 nt12.3□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.29□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 WHI5YOR083W 888 nt12.28□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.44
RTK1Q12100 INM2YDR287W 879 nt12.17□□□□□ -0.46
RTK1Q12100 MRPL8YJL063C 717 nt12.14□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 NAB2YGL122C 1578 nt12.12□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 IMP2'YIL154C 1041 nt12.1□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 FMP45YDL222C 930 nt12.09□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 DSK2YMR276W 1122 nt12.09□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 YBL100CYBL100C 315 nt12.09□□□□□ -0.47
RTK1Q12100 DAL1YIR027C 1383 nt12.05□□□□□ -0.48
RTK1Q12100 YCH1YGR203W 447 nt12.04□□□□□ -0.48
RTK1Q12100 TRM9YML014W 840 nt12.04□□□□□ -0.48
RTK1Q12100 BUD23YCR047C 828 nt12.03□□□□□ -0.48
RTK1Q12100 YPR011CYPR011C 981 nt12.01□□□□□ -0.49
RTK1Q12100 YLR236CYLR236C 324 nt11.98□□□□□ -0.49
RTK1Q12100 FIS1YIL065C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
RTK1Q12100 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
RTK1Q12100 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.49
RTK1Q12100 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.95□□□□□ -0.5
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