Protein–RNA interactions for Protein: Q12106

MCP1, MDM10-complementing protein 1, yeastyeast

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCP1Q12106 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.53■□□□□ 0.56
MCP1Q12106 NSR1YGR159C 1245 nt18.47■□□□□ 0.55
MCP1Q12106 NOP1YDL014W 984 nt18.01■□□□□ 0.47
MCP1Q12106 YKL036CYKL036C 393 nt16.54■□□□□ 0.24
MCP1Q12106 MDJ1YFL016C 1536 nt16.44■□□□□ 0.22
MCP1Q12106 Q0297Q0297 156 nt15.71■□□□□ 0.11
MCP1Q12106 SRX1YKL086W 384 nt15.71■□□□□ 0.11
MCP1Q12106 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
MCP1Q12106 SCS3YGL126W 1143 nt14.99□□□□□ -0.01
MCP1Q12106 YCR051WYCR051W 669 nt14.93□□□□□ -0.02
MCP1Q12106 DBP2YNL112W 1641 nt14.48□□□□□ -0.09
MCP1Q12106 YOL085CYOL085C 342 nt14.32□□□□□ -0.12
MCP1Q12106 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.22□□□□□ -0.13
MCP1Q12106 PKP1YIL042C 1185 nt14.12□□□□□ -0.15
MCP1Q12106 CCC1YLR220W 969 nt14.12□□□□□ -0.15
MCP1Q12106 RPP1BYDL130W 321 nt14.11□□□□□ -0.15
MCP1Q12106 YBR190WYBR190W 312 nt14.04□□□□□ -0.16
MCP1Q12106 RTC3YHR087W 336 nt13.77□□□□□ -0.21
MCP1Q12106 RVS167YDR388W 1449 nt13.67□□□□□ -0.22
MCP1Q12106 SCJ1YMR214W 1134 nt13.53□□□□□ -0.24
MCP1Q12106 PET122YER153C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
MCP1Q12106 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.45□□□□□ -0.26
MCP1Q12106 ATS1YAL020C 1002 nt13.41□□□□□ -0.26
MCP1Q12106 SCR1SCR1 522 nt13.36□□□□□ -0.27
MCP1Q12106 SHR5YOL110W 714 nt13.16□□□□□ -0.3
MCP1Q12106 RRN5YLR141W 1092 nt13.1□□□□□ -0.31
MCP1Q12106 YDJ1YNL064C 1230 nt13.01□□□□□ -0.33
MCP1Q12106 URN1YPR152C 1398 nt12.83□□□□□ -0.36
MCP1Q12106 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.83□□□□□ -0.36
MCP1Q12106 DEP1YAL013W 1218 nt12.82□□□□□ -0.36
MCP1Q12106 RSB1YOR049C 1065 nt12.82□□□□□ -0.36
MCP1Q12106 PUT4YOR348C 1884 nt12.76□□□□□ -0.37
MCP1Q12106 GAR1YHR089C 618 nt12.75□□□□□ -0.37
MCP1Q12106 RPN10YHR200W 807 nt12.66□□□□□ -0.38
MCP1Q12106 OPI9YLR338W 858 nt12.66□□□□□ -0.38
MCP1Q12106 YNL208WYNL208W 600 nt12.61□□□□□ -0.39
MCP1Q12106 SAH1YER043C 1350 nt12.59□□□□□ -0.39
MCP1Q12106 ARE1YCR048W 1833 nt12.51□□□□□ -0.41
MCP1Q12106 PST2YDR032C 597 nt12.42□□□□□ -0.42
MCP1Q12106 POA1YBR022W 534 nt12.4□□□□□ -0.42
MCP1Q12106 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.37□□□□□ -0.43
MCP1Q12106 TIR1YER011W 765 nt12.32□□□□□ -0.44
MCP1Q12106 SSA3YBL075C 1950 nt12.31□□□□□ -0.44
MCP1Q12106 PUN1YLR414C 792 nt12.3□□□□□ -0.44
MCP1Q12106 YJR018WYJR018W 363 nt12.25□□□□□ -0.45
MCP1Q12106 PTC2YER089C 1395 nt12.16□□□□□ -0.46
MCP1Q12106 SSA1YAL005C 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
MCP1Q12106 BUD23YCR047C 828 nt12.12□□□□□ -0.47
MCP1Q12106 BSC6YOL137W 1494 nt12.12□□□□□ -0.47
MCP1Q12106 RPP2BYDR382W 333 nt12.01□□□□□ -0.49
MCP1Q12106 NAB2YGL122C 1578 nt12.01□□□□□ -0.49
MCP1Q12106 YJR120WYJR120W 351 nt11.99□□□□□ -0.49
MCP1Q12106 SHU1YHL006C 453 nt11.93□□□□□ -0.5
MCP1Q12106 YKL097CYKL097C 411 nt11.92□□□□□ -0.5
MCP1Q12106 SRB2YHR041C 633 nt11.91□□□□□ -0.5
MCP1Q12106 INM2YDR287W 879 nt11.84□□□□□ -0.51
MCP1Q12106 FPR4YLR449W 1179 nt11.84□□□□□ -0.51
MCP1Q12106 DAL1YIR027C 1383 nt11.83□□□□□ -0.52
MCP1Q12106 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.79□□□□□ -0.52
MCP1Q12106 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
MCP1Q12106 WWM1YFL010C 636 nt11.76□□□□□ -0.53
MCP1Q12106 BDH2YAL061W 1254 nt11.73□□□□□ -0.53
MCP1Q12106 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
MCP1Q12106 YBL100CYBL100C 315 nt11.69□□□□□ -0.54
MCP1Q12106 YGR021WYGR021W 873 nt11.68□□□□□ -0.54
MCP1Q12106 HOM6YJR139C 1080 nt11.61□□□□□ -0.55
MCP1Q12106 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
MCP1Q12106 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.57□□□□□ -0.56
MCP1Q12106 FUN26YAL022C 1554 nt11.55□□□□□ -0.56
MCP1Q12106 TRM9YML014W 840 nt11.55□□□□□ -0.56
MCP1Q12106 MNP1YGL068W 585 nt11.54□□□□□ -0.56
MCP1Q12106 YPS1YLR120C 1710 nt11.49□□□□□ -0.57
MCP1Q12106 SPT5YML010W 3192 nt11.49□□□□□ -0.57
MCP1Q12106 RKM5YLR137W 1104 nt11.45□□□□□ -0.58
MCP1Q12106 ALF1YNL148C 765 nt11.43□□□□□ -0.58
MCP1Q12106 YDR095CYDR095C 411 nt11.41□□□□□ -0.58
MCP1Q12106 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.41□□□□□ -0.58
MCP1Q12106 YOR139CYOR139C 393 nt11.41□□□□□ -0.58
MCP1Q12106 CCT6YDR188W 1641 nt11.38□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 NPL3YDR432W 1245 nt11.38□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 MEP2YNL142W 1500 nt11.38□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 YOL037CYOL037C 354 nt11.35□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.34□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.34□□□□□ -0.59
MCP1Q12106 RPP2AYOL039W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
MCP1Q12106 SIS1YNL007C 1059 nt11.22□□□□□ -0.61
MCP1Q12106 DCW1YKL046C 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
MCP1Q12106 PTP1YDL230W 1008 nt11.15□□□□□ -0.62
MCP1Q12106 SSA4YER103W 1929 nt11.14□□□□□ -0.63
MCP1Q12106 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.08□□□□□ -0.64
MCP1Q12106 YLR281CYLR281C 468 nt11.08□□□□□ -0.64
MCP1Q12106 EMI2YDR516C 1503 nt11.08□□□□□ -0.64
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