Protein–RNA interactions for Protein: Q12415

TFC7, Transcription factor tau 55 kDa subunit, yeastyeast

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC7Q12415 NSR1YGR159C 1245 nt16.96■□□□□ 0.31
TFC7Q12415 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.89■□□□□ 0.29
TFC7Q12415 NOP1YDL014W 984 nt16.35■□□□□ 0.21
TFC7Q12415 MDJ1YFL016C 1536 nt15.61■□□□□ 0.09
TFC7Q12415 YKL036CYKL036C 393 nt14.93□□□□□ -0.02
TFC7Q12415 YJL027CYJL027C 417 nt14.33□□□□□ -0.12
TFC7Q12415 SRX1YKL086W 384 nt14.29□□□□□ -0.12
TFC7Q12415 Q0297Q0297 156 nt14.27□□□□□ -0.13
TFC7Q12415 DBP2YNL112W 1641 nt13.59□□□□□ -0.23
TFC7Q12415 YCR051WYCR051W 669 nt13.53□□□□□ -0.24
TFC7Q12415 SCS3YGL126W 1143 nt13.5□□□□□ -0.25
TFC7Q12415 YBR190WYBR190W 312 nt13.44□□□□□ -0.26
TFC7Q12415 SSA3YBL075C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
TFC7Q12415 RTC3YHR087W 336 nt13.1□□□□□ -0.31
TFC7Q12415 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.04□□□□□ -0.32
TFC7Q12415 YOL085CYOL085C 342 nt12.93□□□□□ -0.34
TFC7Q12415 CCC1YLR220W 969 nt12.86□□□□□ -0.35
TFC7Q12415 RPP1BYDL130W 321 nt12.8□□□□□ -0.36
TFC7Q12415 PKP1YIL042C 1185 nt12.74□□□□□ -0.37
TFC7Q12415 PUT4YOR348C 1884 nt12.65□□□□□ -0.38
TFC7Q12415 RVS167YDR388W 1449 nt12.62□□□□□ -0.39
TFC7Q12415 SCJ1YMR214W 1134 nt12.47□□□□□ -0.41
TFC7Q12415 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.26□□□□□ -0.45
TFC7Q12415 ARE1YCR048W 1833 nt12.25□□□□□ -0.45
TFC7Q12415 PET122YER153C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
TFC7Q12415 POA1YBR022W 534 nt12.2□□□□□ -0.46
TFC7Q12415 SAH1YER043C 1350 nt12.09□□□□□ -0.47
TFC7Q12415 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.08□□□□□ -0.48
TFC7Q12415 SHR5YOL110W 714 nt12.08□□□□□ -0.48
TFC7Q12415 URN1YPR152C 1398 nt12.07□□□□□ -0.48
TFC7Q12415 SCR1SCR1 522 nt12.06□□□□□ -0.48
TFC7Q12415 BSC6YOL137W 1494 nt12.04□□□□□ -0.48
TFC7Q12415 OPI9YLR338W 858 nt12.02□□□□□ -0.49
TFC7Q12415 ATS1YAL020C 1002 nt12.01□□□□□ -0.49
TFC7Q12415 SPT5YML010W 3192 nt11.92□□□□□ -0.5
TFC7Q12415 DEP1YAL013W 1218 nt11.91□□□□□ -0.5
TFC7Q12415 YDJ1YNL064C 1230 nt11.88□□□□□ -0.51
TFC7Q12415 RRN5YLR141W 1092 nt11.86□□□□□ -0.51
TFC7Q12415 SSA4YER103W 1929 nt11.76□□□□□ -0.53
TFC7Q12415 BUD23YCR047C 828 nt11.76□□□□□ -0.53
TFC7Q12415 RPN10YHR200W 807 nt11.75□□□□□ -0.53
TFC7Q12415 YNL208WYNL208W 600 nt11.66□□□□□ -0.54
TFC7Q12415 PUN1YLR414C 792 nt11.65□□□□□ -0.54
TFC7Q12415 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.63□□□□□ -0.55
TFC7Q12415 GAR1YHR089C 618 nt11.62□□□□□ -0.55
TFC7Q12415 PTC2YER089C 1395 nt11.61□□□□□ -0.55
TFC7Q12415 RSB1YOR049C 1065 nt11.57□□□□□ -0.56
TFC7Q12415 NAB2YGL122C 1578 nt11.54□□□□□ -0.56
TFC7Q12415 YJR018WYJR018W 363 nt11.48□□□□□ -0.57
TFC7Q12415 BDF1YLR399C 2061 nt11.37□□□□□ -0.59
TFC7Q12415 MEP2YNL142W 1500 nt11.36□□□□□ -0.59
TFC7Q12415 FIS1YIL065C 468 nt11.33□□□□□ -0.6
TFC7Q12415 DAL1YIR027C 1383 nt11.28□□□□□ -0.6
TFC7Q12415 TIR1YER011W 765 nt11.24□□□□□ -0.61
TFC7Q12415 FPR4YLR449W 1179 nt11.23□□□□□ -0.61
TFC7Q12415 YJR120WYJR120W 351 nt11.22□□□□□ -0.61
TFC7Q12415 TAT1YBR069C 1860 nt11.21□□□□□ -0.61
TFC7Q12415 DCW1YKL046C 1350 nt11.18□□□□□ -0.62
TFC7Q12415 PHO4YFR034C 939 nt11.18□□□□□ -0.62
TFC7Q12415 YPS1YLR120C 1710 nt11.16□□□□□ -0.62
TFC7Q12415 PST2YDR032C 597 nt11.16□□□□□ -0.62
TFC7Q12415 SSA1YAL005C 1929 nt11.13□□□□□ -0.63
TFC7Q12415 INM2YDR287W 879 nt11.13□□□□□ -0.63
TFC7Q12415 RPP2BYDR382W 333 nt11.08□□□□□ -0.64
TFC7Q12415 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.07□□□□□ -0.64
TFC7Q12415 PAC11YDR488C 1602 nt11.06□□□□□ -0.64
TFC7Q12415 EMI2YDR516C 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
TFC7Q12415 YDR095CYDR095C 411 nt11□□□□□ -0.65
TFC7Q12415 YBR220CYBR220C 1683 nt11□□□□□ -0.65
TFC7Q12415 YMR090WYMR090W 684 nt10.96□□□□□ -0.65
TFC7Q12415 YBL100CYBL100C 315 nt10.94□□□□□ -0.66
TFC7Q12415 SRB2YHR041C 633 nt10.93□□□□□ -0.66
TFC7Q12415 NVJ2YPR091C 2313 nt10.92□□□□□ -0.66
TFC7Q12415 YDL221WYDL221W 552 nt10.88□□□□□ -0.67
TFC7Q12415 SDH1YKL148C 1923 nt10.86□□□□□ -0.67
TFC7Q12415 CAC2YML102W 1407 nt10.84□□□□□ -0.67
TFC7Q12415 PTP1YDL230W 1008 nt10.82□□□□□ -0.68
TFC7Q12415 FUN26YAL022C 1554 nt10.8□□□□□ -0.68
TFC7Q12415 RPP2AYOL039W 321 nt10.79□□□□□ -0.68
TFC7Q12415 BDH2YAL061W 1254 nt10.78□□□□□ -0.68
TFC7Q12415 SHU1YHL006C 453 nt10.75□□□□□ -0.69
TFC7Q12415 ALF1YNL148C 765 nt10.75□□□□□ -0.69
TFC7Q12415 PCH2YBR186W 1695 nt10.72□□□□□ -0.69
TFC7Q12415 SCC4YER147C 1875 nt10.71□□□□□ -0.69
TFC7Q12415 WWM1YFL010C 636 nt10.71□□□□□ -0.69
TFC7Q12415 GUT2YIL155C 1950 nt10.68□□□□□ -0.7
TFC7Q12415 IRC15YPL017C 1500 nt10.68□□□□□ -0.7
TFC7Q12415 SEC11YIR022W 504 nt10.67□□□□□ -0.7
TFC7Q12415 TRM9YML014W 840 nt10.67□□□□□ -0.7
TFC7Q12415 YGR021WYGR021W 873 nt10.63□□□□□ -0.71
TFC7Q12415 YKL097CYKL097C 411 nt10.63□□□□□ -0.71
TFC7Q12415 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.61□□□□□ -0.71
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