Protein–RNA interactions for Protein: Q12020

SRL2, Protein SRL2, yeastyeast

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRL2Q12020 NSR1YGR159C 1245 nt17.65■□□□□ 0.42
SRL2Q12020 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.48■□□□□ 0.39
SRL2Q12020 NOP1YDL014W 984 nt17.13■□□□□ 0.33
SRL2Q12020 YKL036CYKL036C 393 nt15.89■□□□□ 0.13
SRL2Q12020 MDJ1YFL016C 1536 nt15.87■□□□□ 0.13
SRL2Q12020 Q0297Q0297 156 nt15□□□□□ -0.01
SRL2Q12020 SRX1YKL086W 384 nt14.93□□□□□ -0.02
SRL2Q12020 YJL027CYJL027C 417 nt14.85□□□□□ -0.03
SRL2Q12020 SCS3YGL126W 1143 nt14.48□□□□□ -0.09
SRL2Q12020 YCR051WYCR051W 669 nt14.15□□□□□ -0.14
SRL2Q12020 DBP2YNL112W 1641 nt13.9□□□□□ -0.18
SRL2Q12020 YOL085CYOL085C 342 nt13.72□□□□□ -0.21
SRL2Q12020 YBR190WYBR190W 312 nt13.68□□□□□ -0.22
SRL2Q12020 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.5□□□□□ -0.25
SRL2Q12020 RPP1BYDL130W 321 nt13.45□□□□□ -0.26
SRL2Q12020 PKP1YIL042C 1185 nt13.44□□□□□ -0.26
SRL2Q12020 RTC3YHR087W 336 nt13.35□□□□□ -0.27
SRL2Q12020 CCC1YLR220W 969 nt13.34□□□□□ -0.27
SRL2Q12020 RVS167YDR388W 1449 nt13.13□□□□□ -0.31
SRL2Q12020 SCJ1YMR214W 1134 nt13.1□□□□□ -0.31
SRL2Q12020 ATS1YAL020C 1002 nt13□□□□□ -0.33
SRL2Q12020 SSA3YBL075C 1950 nt12.89□□□□□ -0.35
SRL2Q12020 PET122YER153C 765 nt12.79□□□□□ -0.36
SRL2Q12020 SCR1SCR1 522 nt12.78□□□□□ -0.36
SRL2Q12020 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.71□□□□□ -0.37
SRL2Q12020 SHR5YOL110W 714 nt12.57□□□□□ -0.4
SRL2Q12020 PUT4YOR348C 1884 nt12.57□□□□□ -0.4
SRL2Q12020 RRN5YLR141W 1092 nt12.44□□□□□ -0.42
SRL2Q12020 URN1YPR152C 1398 nt12.37□□□□□ -0.43
SRL2Q12020 YDJ1YNL064C 1230 nt12.34□□□□□ -0.43
SRL2Q12020 OPI9YLR338W 858 nt12.27□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 RSB1YOR049C 1065 nt12.25□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 ARE1YCR048W 1833 nt12.25□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 DEP1YAL013W 1218 nt12.24□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 SAH1YER043C 1350 nt12.21□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 RPN10YHR200W 807 nt12.21□□□□□ -0.45
SRL2Q12020 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.19□□□□□ -0.46
SRL2Q12020 POA1YBR022W 534 nt12.16□□□□□ -0.46
SRL2Q12020 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.13□□□□□ -0.47
SRL2Q12020 YNL208WYNL208W 600 nt12.09□□□□□ -0.47
SRL2Q12020 GAR1YHR089C 618 nt12.02□□□□□ -0.49
SRL2Q12020 PST2YDR032C 597 nt12□□□□□ -0.49
SRL2Q12020 BSC6YOL137W 1494 nt11.95□□□□□ -0.5
SRL2Q12020 PUN1YLR414C 792 nt11.94□□□□□ -0.5
SRL2Q12020 BUD23YCR047C 828 nt11.83□□□□□ -0.52
SRL2Q12020 YJR018WYJR018W 363 nt11.8□□□□□ -0.52
SRL2Q12020 PTC2YER089C 1395 nt11.79□□□□□ -0.52
SRL2Q12020 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.53
SRL2Q12020 TIR1YER011W 765 nt11.65□□□□□ -0.54
SRL2Q12020 YKL097CYKL097C 411 nt11.64□□□□□ -0.55
SRL2Q12020 SPT5YML010W 3192 nt11.61□□□□□ -0.55
SRL2Q12020 RPP2BYDR382W 333 nt11.54□□□□□ -0.56
SRL2Q12020 SSA1YAL005C 1929 nt11.52□□□□□ -0.57
SRL2Q12020 DAL1YIR027C 1383 nt11.5□□□□□ -0.57
SRL2Q12020 FIS1YIL065C 468 nt11.47□□□□□ -0.57
SRL2Q12020 YJR120WYJR120W 351 nt11.47□□□□□ -0.57
SRL2Q12020 SHU1YHL006C 453 nt11.46□□□□□ -0.57
SRL2Q12020 INM2YDR287W 879 nt11.45□□□□□ -0.58
SRL2Q12020 FPR4YLR449W 1179 nt11.44□□□□□ -0.58
SRL2Q12020 SSA4YER103W 1929 nt11.42□□□□□ -0.58
SRL2Q12020 PHO4YFR034C 939 nt11.37□□□□□ -0.59
SRL2Q12020 YBL100CYBL100C 315 nt11.27□□□□□ -0.61
SRL2Q12020 MEP2YNL142W 1500 nt11.26□□□□□ -0.61
SRL2Q12020 YPS1YLR120C 1710 nt11.25□□□□□ -0.61
SRL2Q12020 BDH2YAL061W 1254 nt11.22□□□□□ -0.61
SRL2Q12020 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.2□□□□□ -0.62
SRL2Q12020 SRB2YHR041C 633 nt11.19□□□□□ -0.62
SRL2Q12020 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.16□□□□□ -0.62
SRL2Q12020 YGR021WYGR021W 873 nt11.15□□□□□ -0.62
SRL2Q12020 YDR095CYDR095C 411 nt11.14□□□□□ -0.63
SRL2Q12020 FUN26YAL022C 1554 nt11.11□□□□□ -0.63
SRL2Q12020 WWM1YFL010C 636 nt11.07□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 YOR139CYOR139C 393 nt11.07□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 TRM9YML014W 840 nt11.06□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 LSM3YLR438C-A 270 nt11.05□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 ALF1YNL148C 765 nt11.05□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 NPL3YDR432W 1245 nt11.04□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 HOM6YJR139C 1080 nt11.04□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 BDF1YLR399C 2061 nt11.04□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 DCW1YKL046C 1350 nt11.03□□□□□ -0.64
SRL2Q12020 YMR090WYMR090W 684 nt10.97□□□□□ -0.65
SRL2Q12020 CCT6YDR188W 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
SRL2Q12020 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.96□□□□□ -0.65
SRL2Q12020 MNP1YGL068W 585 nt10.96□□□□□ -0.65
SRL2Q12020 YOL037CYOL037C 354 nt10.95□□□□□ -0.66
SRL2Q12020 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SRL2Q12020 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SRL2Q12020 RPP2AYOL039W 321 nt10.94□□□□□ -0.66
SRL2Q12020 EMI2YDR516C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
SRL2Q12020 RKM5YLR137W 1104 nt10.89□□□□□ -0.67
SRL2Q12020 Q0182Q0182 405 nt10.88□□□□□ -0.67
SRL2Q12020 TAT1YBR069C 1860 nt10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms