Protein–RNA interactions for Protein: Q12368

SNU23, 23 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU23Q12368 NSR1YGR159C 1245 nt15.76■□□□□ 0.11
SNU23Q12368 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.16■□□□□ 0.02
SNU23Q12368 MDJ1YFL016C 1536 nt14.62□□□□□ -0.07
SNU23Q12368 NOP1YDL014W 984 nt14.51□□□□□ -0.09
SNU23Q12368 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
SNU23Q12368 YJL027CYJL027C 417 nt13.49□□□□□ -0.25
SNU23Q12368 YKL036CYKL036C 393 nt12.76□□□□□ -0.37
SNU23Q12368 YBR190WYBR190W 312 nt12.74□□□□□ -0.37
SNU23Q12368 SRX1YKL086W 384 nt12.63□□□□□ -0.39
SNU23Q12368 DBP2YNL112W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
SNU23Q12368 PUT4YOR348C 1884 nt12.43□□□□□ -0.42
SNU23Q12368 Q0297Q0297 156 nt12.41□□□□□ -0.42
SNU23Q12368 RTC3YHR087W 336 nt12.39□□□□□ -0.43
SNU23Q12368 SSA4YER103W 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
SNU23Q12368 PAC11YDR488C 1602 nt12.21□□□□□ -0.46
SNU23Q12368 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
SNU23Q12368 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
SNU23Q12368 NVJ2YPR091C 2313 nt12□□□□□ -0.49
SNU23Q12368 POA1YBR022W 534 nt11.93□□□□□ -0.5
SNU23Q12368 YCR051WYCR051W 669 nt11.91□□□□□ -0.5
SNU23Q12368 BSC6YOL137W 1494 nt11.9□□□□□ -0.5
SNU23Q12368 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 ARE1YCR048W 1833 nt11.85□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 TAT1YBR069C 1860 nt11.84□□□□□ -0.51
SNU23Q12368 RVS167YDR388W 1449 nt11.81□□□□□ -0.52
SNU23Q12368 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.72□□□□□ -0.53
SNU23Q12368 CCC1YLR220W 969 nt11.69□□□□□ -0.54
SNU23Q12368 FPS1YLL043W 2010 nt11.62□□□□□ -0.55
SNU23Q12368 SCJ1YMR214W 1134 nt11.49□□□□□ -0.57
SNU23Q12368 URN1YPR152C 1398 nt11.47□□□□□ -0.57
SNU23Q12368 SAH1YER043C 1350 nt11.45□□□□□ -0.58
SNU23Q12368 SCS3YGL126W 1143 nt11.43□□□□□ -0.58
SNU23Q12368 BUD23YCR047C 828 nt11.34□□□□□ -0.59
SNU23Q12368 OPI9YLR338W 858 nt11.31□□□□□ -0.6
SNU23Q12368 MEP2YNL142W 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
SNU23Q12368 SHR5YOL110W 714 nt11.19□□□□□ -0.62
SNU23Q12368 RPP1BYDL130W 321 nt11.13□□□□□ -0.63
SNU23Q12368 YBR220CYBR220C 1683 nt11.1□□□□□ -0.63
SNU23Q12368 UME6YDR207C 2511 nt11.09□□□□□ -0.63
SNU23Q12368 SSA1YAL005C 1929 nt11.07□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 DCW1YKL046C 1350 nt11.06□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 DEP1YAL013W 1218 nt11.06□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 YOL085CYOL085C 342 nt11.06□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 RPN10YHR200W 807 nt11.05□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 PCH2YBR186W 1695 nt11.02□□□□□ -0.64
SNU23Q12368 PUN1YLR414C 792 nt11.02□□□□□ -0.65
SNU23Q12368 NAB2YGL122C 1578 nt11□□□□□ -0.65
SNU23Q12368 GUT2YIL155C 1950 nt11□□□□□ -0.65
SNU23Q12368 PTC2YER089C 1395 nt10.97□□□□□ -0.65
SNU23Q12368 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.95□□□□□ -0.66
SNU23Q12368 PKP1YIL042C 1185 nt10.95□□□□□ -0.66
SNU23Q12368 YMR090WYMR090W 684 nt10.95□□□□□ -0.66
SNU23Q12368 EMI2YDR516C 1503 nt10.9□□□□□ -0.66
SNU23Q12368 SEC11YIR022W 504 nt10.9□□□□□ -0.66
SNU23Q12368 YNL208WYNL208W 600 nt10.88□□□□□ -0.67
SNU23Q12368 SDH1YKL148C 1923 nt10.82□□□□□ -0.68
SNU23Q12368 BOR1YNL275W 1731 nt10.81□□□□□ -0.68
SNU23Q12368 PIB2YGL023C 1908 nt10.78□□□□□ -0.68
SNU23Q12368 YJR018WYJR018W 363 nt10.75□□□□□ -0.69
SNU23Q12368 YPS1YLR120C 1710 nt10.74□□□□□ -0.69
SNU23Q12368 YDL221WYDL221W 552 nt10.73□□□□□ -0.69
SNU23Q12368 FIS1YIL065C 468 nt10.73□□□□□ -0.69
SNU23Q12368 PET122YER153C 765 nt10.69□□□□□ -0.7
SNU23Q12368 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.69□□□□□ -0.7
SNU23Q12368 DAL1YIR027C 1383 nt10.65□□□□□ -0.7
SNU23Q12368 MCH5YOR306C 1566 nt10.64□□□□□ -0.71
SNU23Q12368 YDJ1YNL064C 1230 nt10.63□□□□□ -0.71
SNU23Q12368 RTF1YGL244W 1677 nt10.62□□□□□ -0.71
SNU23Q12368 YJL225CYJL225C 5277 nt10.6□□□□□ -0.71
SNU23Q12368 FPR4YLR449W 1179 nt10.6□□□□□ -0.71
SNU23Q12368 SCC4YER147C 1875 nt10.57□□□□□ -0.72
SNU23Q12368 PHO4YFR034C 939 nt10.55□□□□□ -0.72
SNU23Q12368 INM2YDR287W 879 nt10.5□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 YDR095CYDR095C 411 nt10.49□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 GAR1YHR089C 618 nt10.48□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 YSC84YHR016C 1407 nt10.48□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 CAC2YML102W 1407 nt10.47□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 Q0182Q0182 405 nt10.46□□□□□ -0.73
SNU23Q12368 PTK1YKL198C 1989 nt10.45□□□□□ -0.74
SNU23Q12368 BOP3YNL042W 1191 nt10.44□□□□□ -0.74
SNU23Q12368 SCR1SCR1 522 nt10.44□□□□□ -0.74
SNU23Q12368 ALG12YNR030W 1656 nt10.39□□□□□ -0.75
SNU23Q12368 RPP2BYDR382W 333 nt10.39□□□□□ -0.75
SNU23Q12368 YHL050CYHL050C 2094 nt10.37□□□□□ -0.75
SNU23Q12368 PTP1YDL230W 1008 nt10.35□□□□□ -0.75
SNU23Q12368 YJR120WYJR120W 351 nt10.35□□□□□ -0.75
SNU23Q12368 IRC15YPL017C 1500 nt10.33□□□□□ -0.76
SNU23Q12368 RRN5YLR141W 1092 nt10.32□□□□□ -0.76
SNU23Q12368 GIS3YLR094C 1509 nt10.29□□□□□ -0.76
SNU23Q12368 RPP2AYOL039W 321 nt10.28□□□□□ -0.76
SNU23Q12368 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
SNU23Q12368 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms