Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.89■□□□□ 0.61
RPL20AP0CX23 NSR1YGR159C 1245 nt18.76■□□□□ 0.59
RPL20AP0CX23 NOP1YDL014W 984 nt18.38■□□□□ 0.53
RPL20AP0CX23 YKL036CYKL036C 393 nt17■□□□□ 0.31
RPL20AP0CX23 MDJ1YFL016C 1536 nt16.6■□□□□ 0.25
RPL20AP0CX23 Q0297Q0297 156 nt16.11■□□□□ 0.17
RPL20AP0CX23 SRX1YKL086W 384 nt16.06■□□□□ 0.16
RPL20AP0CX23 YJL027CYJL027C 417 nt15.87■□□□□ 0.13
RPL20AP0CX23 SCS3YGL126W 1143 nt15.48■□□□□ 0.07
RPL20AP0CX23 YCR051WYCR051W 669 nt15.24■□□□□ 0.03
RPL20AP0CX23 YOL085CYOL085C 342 nt14.73□□□□□ -0.05
RPL20AP0CX23 DBP2YNL112W 1641 nt14.72□□□□□ -0.05
RPL20AP0CX23 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.51□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 PKP1YIL042C 1185 nt14.49□□□□□ -0.09
RPL20AP0CX23 RPP1BYDL130W 321 nt14.45□□□□□ -0.1
RPL20AP0CX23 CCC1YLR220W 969 nt14.35□□□□□ -0.11
RPL20AP0CX23 YBR190WYBR190W 312 nt14.16□□□□□ -0.14
RPL20AP0CX23 ATS1YAL020C 1002 nt13.86□□□□□ -0.19
RPL20AP0CX23 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
RPL20AP0CX23 RTC3YHR087W 336 nt13.84□□□□□ -0.19
RPL20AP0CX23 PET122YER153C 765 nt13.8□□□□□ -0.2
RPL20AP0CX23 SCJ1YMR214W 1134 nt13.78□□□□□ -0.2
RPL20AP0CX23 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.74□□□□□ -0.21
RPL20AP0CX23 SCR1SCR1 522 nt13.67□□□□□ -0.22
RPL20AP0CX23 RRN5YLR141W 1092 nt13.42□□□□□ -0.26
RPL20AP0CX23 SHR5YOL110W 714 nt13.37□□□□□ -0.27
RPL20AP0CX23 YDJ1YNL064C 1230 nt13.29□□□□□ -0.28
RPL20AP0CX23 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.15□□□□□ -0.3
RPL20AP0CX23 RSB1YOR049C 1065 nt13.13□□□□□ -0.31
RPL20AP0CX23 GAR1YHR089C 618 nt12.98□□□□□ -0.33
RPL20AP0CX23 DEP1YAL013W 1218 nt12.97□□□□□ -0.33
RPL20AP0CX23 URN1YPR152C 1398 nt12.96□□□□□ -0.33
RPL20AP0CX23 PUT4YOR348C 1884 nt12.87□□□□□ -0.35
RPL20AP0CX23 PST2YDR032C 597 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL20AP0CX23 RPN10YHR200W 807 nt12.79□□□□□ -0.36
RPL20AP0CX23 OPI9YLR338W 858 nt12.78□□□□□ -0.36
RPL20AP0CX23 YNL208WYNL208W 600 nt12.78□□□□□ -0.36
RPL20AP0CX23 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
RPL20AP0CX23 ARE1YCR048W 1833 nt12.62□□□□□ -0.39
RPL20AP0CX23 TIR1YER011W 765 nt12.55□□□□□ -0.4
RPL20AP0CX23 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.45□□□□□ -0.42
RPL20AP0CX23 POA1YBR022W 534 nt12.45□□□□□ -0.42
RPL20AP0CX23 PUN1YLR414C 792 nt12.41□□□□□ -0.42
RPL20AP0CX23 SSA1YAL005C 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
RPL20AP0CX23 YJR018WYJR018W 363 nt12.38□□□□□ -0.43
RPL20AP0CX23 YKL097CYKL097C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
RPL20AP0CX23 SHU1YHL006C 453 nt12.3□□□□□ -0.44
RPL20AP0CX23 PTC2YER089C 1395 nt12.25□□□□□ -0.45
RPL20AP0CX23 BSC6YOL137W 1494 nt12.21□□□□□ -0.46
RPL20AP0CX23 YJR120WYJR120W 351 nt12.2□□□□□ -0.46
RPL20AP0CX23 SRB2YHR041C 633 nt12.19□□□□□ -0.46
RPL20AP0CX23 BUD23YCR047C 828 nt12.15□□□□□ -0.46
RPL20AP0CX23 RPP2BYDR382W 333 nt12.14□□□□□ -0.47
RPL20AP0CX23 SSA3YBL075C 1950 nt12.14□□□□□ -0.47
RPL20AP0CX23 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.1□□□□□ -0.47
RPL20AP0CX23 NAB2YGL122C 1578 nt12.09□□□□□ -0.47
RPL20AP0CX23 WWM1YFL010C 636 nt12□□□□□ -0.49
RPL20AP0CX23 DAL1YIR027C 1383 nt11.94□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 INM2YDR287W 879 nt11.94□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 YGR021WYGR021W 873 nt11.94□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 FIS1YIL065C 468 nt11.92□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 HOM6YJR139C 1080 nt11.9□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 BDH2YAL061W 1254 nt11.9□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 FPR4YLR449W 1179 nt11.9□□□□□ -0.5
RPL20AP0CX23 MNP1YGL068W 585 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL20AP0CX23 YOR139CYOR139C 393 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL20AP0CX23 PHO4YFR034C 939 nt11.82□□□□□ -0.52
RPL20AP0CX23 YBL100CYBL100C 315 nt11.82□□□□□ -0.52
RPL20AP0CX23 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.81□□□□□ -0.52
RPL20AP0CX23 LSM3YLR438C-A 270 nt11.76□□□□□ -0.53
RPL20AP0CX23 NPL3YDR432W 1245 nt11.73□□□□□ -0.53
RPL20AP0CX23 RKM5YLR137W 1104 nt11.73□□□□□ -0.53
RPL20AP0CX23 SPT5YML010W 3192 nt11.7□□□□□ -0.54
RPL20AP0CX23 FUN26YAL022C 1554 nt11.69□□□□□ -0.54
RPL20AP0CX23 TRM9YML014W 840 nt11.68□□□□□ -0.54
RPL20AP0CX23 YOL037CYOL037C 354 nt11.67□□□□□ -0.54
RPL20AP0CX23 YPS1YLR120C 1710 nt11.58□□□□□ -0.56
RPL20AP0CX23 CCT6YDR188W 1641 nt11.56□□□□□ -0.56
RPL20AP0CX23 YDR095CYDR095C 411 nt11.51□□□□□ -0.57
RPL20AP0CX23 ALF1YNL148C 765 nt11.51□□□□□ -0.57
RPL20AP0CX23 MEP2YNL142W 1500 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL20AP0CX23 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL20AP0CX23 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL20AP0CX23 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.44□□□□□ -0.58
RPL20AP0CX23 YLR281CYLR281C 468 nt11.4□□□□□ -0.58
RPL20AP0CX23 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 WHI5YOR083W 888 nt11.36□□□□□ -0.59
RPL20AP0CX23 SIS1YNL007C 1059 nt11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms