Protein–RNA interactions for Protein: Q12375

ORT1, Mitochondrial ornithine transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ORT1Q12375 NSR1YGR159C 1245 nt17.75■□□□□ 0.43
ORT1Q12375 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.6■□□□□ 0.41
ORT1Q12375 NOP1YDL014W 984 nt16.96■□□□□ 0.31
ORT1Q12375 MDJ1YFL016C 1536 nt16.09■□□□□ 0.17
ORT1Q12375 YKL036CYKL036C 393 nt15.36■□□□□ 0.05
ORT1Q12375 SRX1YKL086W 384 nt14.82□□□□□ -0.04
ORT1Q12375 YJL027CYJL027C 417 nt14.81□□□□□ -0.04
ORT1Q12375 Q0297Q0297 156 nt14.75□□□□□ -0.05
ORT1Q12375 DBP2YNL112W 1641 nt14.1□□□□□ -0.15
ORT1Q12375 YCR051WYCR051W 669 nt14.05□□□□□ -0.16
ORT1Q12375 SCS3YGL126W 1143 nt13.82□□□□□ -0.2
ORT1Q12375 YBR190WYBR190W 312 nt13.79□□□□□ -0.2
ORT1Q12375 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.6□□□□□ -0.23
ORT1Q12375 RTC3YHR087W 336 nt13.46□□□□□ -0.25
ORT1Q12375 CCC1YLR220W 969 nt13.46□□□□□ -0.25
ORT1Q12375 YOL085CYOL085C 342 nt13.31□□□□□ -0.28
ORT1Q12375 RPP1BYDL130W 321 nt13.23□□□□□ -0.29
ORT1Q12375 RVS167YDR388W 1449 nt13.17□□□□□ -0.3
ORT1Q12375 PKP1YIL042C 1185 nt13.16□□□□□ -0.3
ORT1Q12375 SCJ1YMR214W 1134 nt13.05□□□□□ -0.32
ORT1Q12375 PUT4YOR348C 1884 nt12.77□□□□□ -0.37
ORT1Q12375 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.75□□□□□ -0.37
ORT1Q12375 PET122YER153C 765 nt12.69□□□□□ -0.38
ORT1Q12375 SSA3YBL075C 1950 nt12.69□□□□□ -0.38
ORT1Q12375 SHR5YOL110W 714 nt12.63□□□□□ -0.39
ORT1Q12375 URN1YPR152C 1398 nt12.49□□□□□ -0.41
ORT1Q12375 SCR1SCR1 522 nt12.46□□□□□ -0.41
ORT1Q12375 ARE1YCR048W 1833 nt12.44□□□□□ -0.42
ORT1Q12375 DEP1YAL013W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
ORT1Q12375 SAH1YER043C 1350 nt12.38□□□□□ -0.43
ORT1Q12375 OPI9YLR338W 858 nt12.37□□□□□ -0.43
ORT1Q12375 YDJ1YNL064C 1230 nt12.34□□□□□ -0.43
ORT1Q12375 POA1YBR022W 534 nt12.33□□□□□ -0.44
ORT1Q12375 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.29□□□□□ -0.44
ORT1Q12375 RRN5YLR141W 1092 nt12.28□□□□□ -0.44
ORT1Q12375 ATS1YAL020C 1002 nt12.26□□□□□ -0.45
ORT1Q12375 RPN10YHR200W 807 nt12.23□□□□□ -0.45
ORT1Q12375 YNL208WYNL208W 600 nt12.15□□□□□ -0.46
ORT1Q12375 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
ORT1Q12375 GAR1YHR089C 618 nt12.12□□□□□ -0.47
ORT1Q12375 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.04□□□□□ -0.48
ORT1Q12375 PUN1YLR414C 792 nt12.01□□□□□ -0.49
ORT1Q12375 BUD23YCR047C 828 nt11.98□□□□□ -0.49
ORT1Q12375 RSB1YOR049C 1065 nt11.94□□□□□ -0.5
ORT1Q12375 PTC2YER089C 1395 nt11.92□□□□□ -0.5
ORT1Q12375 YJR018WYJR018W 363 nt11.9□□□□□ -0.5
ORT1Q12375 NAB2YGL122C 1578 nt11.81□□□□□ -0.52
ORT1Q12375 SPT5YML010W 3192 nt11.81□□□□□ -0.52
ORT1Q12375 TIR1YER011W 765 nt11.73□□□□□ -0.53
ORT1Q12375 SSA1YAL005C 1929 nt11.66□□□□□ -0.54
ORT1Q12375 YJR120WYJR120W 351 nt11.66□□□□□ -0.54
ORT1Q12375 FIS1YIL065C 468 nt11.62□□□□□ -0.55
ORT1Q12375 DAL1YIR027C 1383 nt11.59□□□□□ -0.55
ORT1Q12375 RPP2BYDR382W 333 nt11.56□□□□□ -0.56
ORT1Q12375 FPR4YLR449W 1179 nt11.55□□□□□ -0.56
ORT1Q12375 SSA4YER103W 1929 nt11.53□□□□□ -0.56
ORT1Q12375 INM2YDR287W 879 nt11.5□□□□□ -0.57
ORT1Q12375 PHO4YFR034C 939 nt11.49□□□□□ -0.57
ORT1Q12375 MEP2YNL142W 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
ORT1Q12375 PST2YDR032C 597 nt11.41□□□□□ -0.58
ORT1Q12375 SRB2YHR041C 633 nt11.41□□□□□ -0.58
ORT1Q12375 YPS1YLR120C 1710 nt11.38□□□□□ -0.59
ORT1Q12375 YBL100CYBL100C 315 nt11.35□□□□□ -0.59
ORT1Q12375 BDH2YAL061W 1254 nt11.28□□□□□ -0.6
ORT1Q12375 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.27□□□□□ -0.61
ORT1Q12375 YDR095CYDR095C 411 nt11.26□□□□□ -0.61
ORT1Q12375 DCW1YKL046C 1350 nt11.25□□□□□ -0.61
ORT1Q12375 FUN26YAL022C 1554 nt11.2□□□□□ -0.62
ORT1Q12375 WWM1YFL010C 636 nt11.17□□□□□ -0.62
ORT1Q12375 BDF1YLR399C 2061 nt11.12□□□□□ -0.63
ORT1Q12375 TRM9YML014W 840 nt11.12□□□□□ -0.63
ORT1Q12375 ALF1YNL148C 765 nt11.11□□□□□ -0.63
ORT1Q12375 EMI2YDR516C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
ORT1Q12375 LSM3YLR438C-A 270 nt11.06□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 PTP1YDL230W 1008 nt11.04□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 RPP2AYOL039W 321 nt11.04□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 CCT6YDR188W 1641 nt11.03□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 SHU1YHL006C 453 nt11.03□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 YMR090WYMR090W 684 nt11.03□□□□□ -0.64
ORT1Q12375 CAC2YML102W 1407 nt11.01□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 YGR021WYGR021W 873 nt10.99□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 YBR220CYBR220C 1683 nt10.98□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 YDL221WYDL221W 552 nt10.98□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.98□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.97□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 TAT1YBR069C 1860 nt10.97□□□□□ -0.65
ORT1Q12375 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.95□□□□□ -0.66
ORT1Q12375 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.95□□□□□ -0.66
ORT1Q12375 SIS1YNL007C 1059 nt10.95□□□□□ -0.66
ORT1Q12375 HOM6YJR139C 1080 nt10.94□□□□□ -0.66
ORT1Q12375 Q0182Q0182 405 nt10.92□□□□□ -0.66
ORT1Q12375 SDH1YKL148C 1923 nt10.92□□□□□ -0.66
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